MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012225	AAAG	2	8	181281	181288	75 %	0 %	25 %	0 %	225619109
5502	NC_012225	TTA	2	6	181289	181294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
5503	NC_012225	TAATG	2	10	181330	181339	40 %	40 %	20 %	0 %	225619109
5504	NC_012225	TATAT	2	10	181340	181349	40 %	60 %	0 %	0 %	225619109
5505	NC_012225	A	8	8	181366	181373	100 %	0 %	0 %	0 %	225619109
5506	NC_012225	TTA	2	6	181376	181381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619109
5507	NC_012225	ATA	2	6	181413	181418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619110
5508	NC_012225	ATTTTT	2	12	181457	181468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225619110
5509	NC_012225	TAT	2	6	181493	181498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619110
5510	NC_012225	T	6	6	181547	181552	0 %	100 %	0 %	0 %	225619110
5511	NC_012225	CTT	2	6	181560	181565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619110
5512	NC_012225	TAT	2	6	181582	181587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619110
5513	NC_012225	TTC	2	6	181589	181594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619110
5514	NC_012225	TA	3	6	181682	181687	50 %	50 %	0 %	0 %	225619110
5515	NC_012225	AT	3	6	181707	181712	50 %	50 %	0 %	0 %	225619110
5516	NC_012225	CTG	2	6	181729	181734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619110
5517	NC_012225	TCT	2	6	181737	181742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619110
5518	NC_012225	T	7	7	181742	181748	0 %	100 %	0 %	0 %	225619110
5519	NC_012225	T	7	7	181766	181772	0 %	100 %	0 %	0 %	225619110
5520	NC_012225	A	6	6	181802	181807	100 %	0 %	0 %	0 %	225619110
5521	NC_012225	TCT	2	6	181812	181817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619110
5522	NC_012225	AAT	2	6	181828	181833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619110
5523	NC_012225	TGC	2	6	181840	181845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619110
5524	NC_012225	T	6	6	181889	181894	0 %	100 %	0 %	0 %	225619110
5525	NC_012225	GAG	2	6	181945	181950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619110
5526	NC_012225	ATTAT	2	10	181980	181989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_012225	T	6	6	181998	182003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_012225	TTA	2	6	182016	182021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_012225	GTAT	2	8	182042	182049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_012225	AT	3	6	182048	182053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_012225	TAAA	2	8	182083	182090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_012225	TAT	2	6	182095	182100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_012225	TAT	2	6	182110	182115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_012225	T	7	7	182134	182140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_012225	TA	3	6	182144	182149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_012225	TGA	2	6	182222	182227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619111
5537	NC_012225	TTA	2	6	182267	182272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
5538	NC_012225	TAT	2	6	182326	182331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
5539	NC_012225	GGAA	2	8	182498	182505	50 %	0 %	50 %	0 %	225619111
5540	NC_012225	ATT	3	9	182511	182519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
5541	NC_012225	ATTA	2	8	182541	182548	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
5542	NC_012225	TA	3	6	182547	182552	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
5543	NC_012225	TTTAGA	2	12	182558	182569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225619111
5544	NC_012225	ATT	2	6	182582	182587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
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5546	NC_012225	AT	4	8	182662	182669	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
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5551	NC_012225	A	6	6	182846	182851	100 %	0 %	0 %	0 %	225619111
5552	NC_012225	TAA	2	6	182864	182869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619111
5553	NC_012225	TAT	2	6	182906	182911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
5554	NC_012225	TTA	2	6	182914	182919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
5555	NC_012225	TGGA	2	8	182957	182964	25 %	25 %	50 %	0 %	225619111
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5559	NC_012225	ATT	2	6	183011	183016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619111
5560	NC_012225	A	7	7	183032	183038	100 %	0 %	0 %	0 %	225619111
5561	NC_012225	TAAA	2	8	183052	183059	75 %	25 %	0 %	0 %	225619111
5562	NC_012225	TA	3	6	183060	183065	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
5563	NC_012225	AGA	2	6	183101	183106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619111
5564	NC_012225	TA	3	6	183122	183127	50 %	50 %	0 %	0 %	225619111
5565	NC_012225	TAA	2	6	183174	183179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_012225	AAT	2	6	183267	183272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_012225	TTAT	2	8	183279	183286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_012225	GGC	2	6	183290	183295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_012225	GGT	2	6	183304	183309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5571	NC_012225	TAA	2	6	183362	183367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_012225	GTGA	2	8	183384	183391	25 %	25 %	50 %	0 %	225619112
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5576	NC_012225	A	6	6	183573	183578	100 %	0 %	0 %	0 %	225619112
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5578	NC_012225	T	7	7	183648	183654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5581	NC_012225	AAT	2	6	183723	183728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_012225	ATTA	2	8	183737	183744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_012225	TAA	2	6	183749	183754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_012225	TTTAA	2	10	183755	183764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_012225	AT	3	6	183781	183786	50 %	50 %	0 %	0 %	225619113
5586	NC_012225	GCA	2	6	183788	183793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619113
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5597	NC_012225	ATG	2	6	184029	184034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619113
5598	NC_012225	TAC	3	9	184048	184056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619113
5599	NC_012225	AAG	2	6	184086	184091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619113
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5607	NC_012225	CTG	2	6	184419	184424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619113
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5610	NC_012225	A	7	7	184457	184463	100 %	0 %	0 %	0 %	225619113
5611	NC_012225	CTT	2	6	184481	184486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619113
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5622	NC_012225	CTA	2	6	184824	184829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619113
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5625	NC_012225	AAGA	2	8	184881	184888	75 %	0 %	25 %	0 %	225619113
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5627	NC_012225	A	6	6	184958	184963	100 %	0 %	0 %	0 %	225619113
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