MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_012225	TCT	2	6	165809	165814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619097
5003	NC_012225	AAT	2	6	165818	165823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619097
5004	NC_012225	AGG	3	9	165878	165886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619097
5005	NC_012225	TTC	3	9	165932	165940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619097
5006	NC_012225	CTG	2	6	165998	166003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619097
5007	NC_012225	CTT	2	6	166017	166022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619097
5008	NC_012225	TTA	2	6	166032	166037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619097
5009	NC_012225	CTA	2	6	166042	166047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619097
5010	NC_012225	TCAT	2	8	166095	166102	25 %	50 %	0 %	25 %	225619097
5011	NC_012225	TCT	2	6	166115	166120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619097
5012	NC_012225	AGG	2	6	166217	166222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619097
5013	NC_012225	CTC	2	6	166228	166233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619097
5014	NC_012225	CAG	2	6	166306	166311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619097
5015	NC_012225	CAT	2	6	166312	166317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619097
5016	NC_012225	TAC	2	6	166346	166351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619097
5017	NC_012225	T	6	6	166389	166394	0 %	100 %	0 %	0 %	225619097
5018	NC_012225	TAT	2	6	166397	166402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619097
5019	NC_012225	CAG	2	6	166405	166410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619097
5020	NC_012225	TA	3	6	166424	166429	50 %	50 %	0 %	0 %	225619097
5021	NC_012225	TTC	2	6	166430	166435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619097
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5023	NC_012225	ATT	2	6	166478	166483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619097
5024	NC_012225	TTC	2	6	166513	166518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619097
5025	NC_012225	CTC	2	6	166519	166524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619097
5026	NC_012225	CAG	3	9	166591	166599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619097
5027	NC_012225	TTG	2	6	166603	166608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619097
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5030	NC_012225	TA	4	8	166657	166664	50 %	50 %	0 %	0 %	225619097
5031	NC_012225	GCA	2	6	166698	166703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619097
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5034	NC_012225	CTT	2	6	166792	166797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619097
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5036	NC_012225	AT	3	6	166811	166816	50 %	50 %	0 %	0 %	225619097
5037	NC_012225	T	6	6	166834	166839	0 %	100 %	0 %	0 %	225619097
5038	NC_012225	TA	3	6	166874	166879	50 %	50 %	0 %	0 %	225619097
5039	NC_012225	TA	3	6	167009	167014	50 %	50 %	0 %	0 %	225619097
5040	NC_012225	ATT	3	9	167049	167057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619097
5041	NC_012225	AAT	2	6	167066	167071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012225	TA	3	6	167075	167080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_012225	T	7	7	167081	167087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_012225	TAA	3	9	167095	167103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_012225	ATT	2	6	167116	167121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_012225	AT	3	6	167123	167128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_012225	ATT	3	9	167134	167142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012225	AT	3	6	167180	167185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_012225	AAAT	2	8	167189	167196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012225	TTA	2	6	167234	167239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_012225	TAT	3	9	167246	167254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_012225	GTAT	2	8	167261	167268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_012225	T	6	6	167271	167276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_012225	ATA	3	9	167277	167285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_012225	AAT	2	6	167291	167296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_012225	TTTG	2	8	167329	167336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_012225	AT	3	6	167351	167356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_012225	CA	3	6	167421	167426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_012225	TAA	3	9	167503	167511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619098
5060	NC_012225	ATT	2	6	167544	167549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619098
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5062	NC_012225	AT	3	6	167614	167619	50 %	50 %	0 %	0 %	225619098
5063	NC_012225	ATA	3	9	167641	167649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619098
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5067	NC_012225	A	6	6	167798	167803	100 %	0 %	0 %	0 %	225619098
5068	NC_012225	AT	3	6	167807	167812	50 %	50 %	0 %	0 %	225619098
5069	NC_012225	TATT	2	8	167818	167825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_012225	ATA	2	6	167828	167833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_012225	AT	3	6	167853	167858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_012225	GAA	2	6	167864	167869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619099
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5098	NC_012225	GTAA	2	8	168648	168655	50 %	25 %	25 %	0 %	225619099
5099	NC_012225	A	6	6	168654	168659	100 %	0 %	0 %	0 %	225619099
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5109	NC_012225	TA	3	6	168961	168966	50 %	50 %	0 %	0 %	225619099
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5251	NC_012225	TAA	2	6	173477	173482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619103
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