MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012225	ATT	2	6	149712	149717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619083
4502	NC_012225	TTC	2	6	149721	149726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619083
4503	NC_012225	TCT	2	6	149728	149733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619083
4504	NC_012225	TCTT	2	8	149811	149818	0 %	75 %	0 %	25 %	225619083
4505	NC_012225	TAA	2	6	149844	149849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619083
4506	NC_012225	ATG	2	6	149916	149921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619083
4507	NC_012225	AT	3	6	149939	149944	50 %	50 %	0 %	0 %	225619083
4508	NC_012225	ATC	2	6	149949	149954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619083
4509	NC_012225	TGT	2	6	149979	149984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619083
4510	NC_012225	AT	3	6	149985	149990	50 %	50 %	0 %	0 %	225619083
4511	NC_012225	AAT	2	6	150059	150064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619083
4512	NC_012225	AT	3	6	150071	150076	50 %	50 %	0 %	0 %	225619083
4513	NC_012225	T	6	6	150088	150093	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
4514	NC_012225	TTG	2	6	150140	150145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619083
4515	NC_012225	AAT	2	6	150148	150153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619083
4516	NC_012225	AAT	2	6	150197	150202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619083
4517	NC_012225	AGG	2	6	150249	150254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619083
4518	NC_012225	T	7	7	150272	150278	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
4519	NC_012225	CAT	3	9	150287	150295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619083
4520	NC_012225	ACA	2	6	150301	150306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619083
4521	NC_012225	TTAT	2	8	150364	150371	25 %	75 %	0 %	0 %	225619083
4522	NC_012225	TCC	3	9	150408	150416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619083
4523	NC_012225	ATATC	2	10	150425	150434	40 %	40 %	0 %	20 %	225619083
4524	NC_012225	T	6	6	150450	150455	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
4525	NC_012225	TGTTAT	2	12	150513	150524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225619083
4526	NC_012225	TAT	2	6	150533	150538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619083
4527	NC_012225	T	6	6	150570	150575	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
4528	NC_012225	T	7	7	150594	150600	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
4529	NC_012225	ACAT	2	8	150612	150619	50 %	25 %	0 %	25 %	225619083
4530	NC_012225	AT	4	8	150621	150628	50 %	50 %	0 %	0 %	225619083
4531	NC_012225	AAAT	2	8	150666	150673	75 %	25 %	0 %	0 %	225619083
4532	NC_012225	T	7	7	150686	150692	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
4533	NC_012225	TAAT	2	8	150699	150706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_012225	ATT	2	6	150707	150712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_012225	T	7	7	150711	150717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_012225	ATT	2	6	150718	150723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012225	GTT	2	6	150724	150729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_012225	TA	3	6	150746	150751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_012225	TAT	2	6	150754	150759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_012225	TAA	2	6	150800	150805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_012225	A	6	6	150823	150828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_012225	TTTA	2	8	150830	150837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_012225	TAAAC	2	10	150869	150878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4544	NC_012225	T	6	6	150930	150935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012225	ATG	2	6	150965	150970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_012225	TA	4	8	150972	150979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_012225	ATTT	2	8	151003	151010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_012225	T	6	6	151008	151013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_012225	AATTAT	2	12	151014	151025	50 %	50 %	0 %	0 %	225619084
4550	NC_012225	AGCC	2	8	151077	151084	25 %	0 %	25 %	50 %	225619084
4551	NC_012225	TCT	2	6	151092	151097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619084
4552	NC_012225	TCT	2	6	151121	151126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619084
4553	NC_012225	T	6	6	151126	151131	0 %	100 %	0 %	0 %	225619084
4554	NC_012225	TCA	2	6	151140	151145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619084
4555	NC_012225	ATG	2	6	151188	151193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619084
4556	NC_012225	CCG	2	6	151221	151226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225619084
4557	NC_012225	AAC	3	9	151397	151405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619084
4558	NC_012225	TTTA	2	8	151412	151419	25 %	75 %	0 %	0 %	225619084
4559	NC_012225	AT	3	6	151430	151435	50 %	50 %	0 %	0 %	225619084
4560	NC_012225	AGC	2	6	151436	151441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619084
4561	NC_012225	TTC	2	6	151451	151456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619084
4562	NC_012225	TCA	2	6	151497	151502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619084
4563	NC_012225	CAG	2	6	151507	151512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619084
4564	NC_012225	AAC	2	6	151520	151525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619084
4565	NC_012225	ATT	2	6	151607	151612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619084
4566	NC_012225	CAG	2	6	151714	151719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619084
4567	NC_012225	TCT	2	6	151743	151748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619084
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4569	NC_012225	AAGT	2	8	151856	151863	50 %	25 %	25 %	0 %	225619084
4570	NC_012225	TTA	2	6	151933	151938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619084
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4574	NC_012225	CAG	2	6	152023	152028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619084
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4577	NC_012225	T	6	6	152177	152182	0 %	100 %	0 %	0 %	225619084
4578	NC_012225	AT	3	6	152200	152205	50 %	50 %	0 %	0 %	225619084
4579	NC_012225	GTC	2	6	152222	152227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619084
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4582	NC_012225	GTACAA	2	12	152332	152343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225619084
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4588	NC_012225	CTT	2	6	152673	152678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619084
4589	NC_012225	ATT	2	6	152706	152711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_012225	TAA	2	6	152720	152725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_012225	TAAA	2	8	152733	152740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_012225	A	6	6	152746	152751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_012225	TAG	2	6	152770	152775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_012225	A	6	6	152782	152787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_012225	T	8	8	152795	152802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_012225	TAA	2	6	152810	152815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_012225	T	6	6	152834	152839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_012225	T	6	6	152841	152846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_012225	TA	3	6	152849	152854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_012225	TAG	2	6	152856	152861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_012225	T	7	7	152876	152882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_012225	T	9	9	152909	152917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_012225	GTT	2	6	152939	152944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_012225	A	6	6	152952	152957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_012225	TAT	2	6	152999	153004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_012225	GTTAT	2	10	153033	153042	20 %	60 %	20 %	0 %	225619085
4607	NC_012225	AAG	2	6	153100	153105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619085
4608	NC_012225	TA	3	6	153139	153144	50 %	50 %	0 %	0 %	225619085
4609	NC_012225	T	6	6	153231	153236	0 %	100 %	0 %	0 %	225619085
4610	NC_012225	TGA	2	6	153248	153253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619085
4611	NC_012225	ATG	2	6	153298	153303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619085
4612	NC_012225	ATT	2	6	153349	153354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619085
4613	NC_012225	AT	3	6	153355	153360	50 %	50 %	0 %	0 %	225619085
4614	NC_012225	ATT	2	6	153406	153411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619085
4615	NC_012225	AAAT	2	8	153518	153525	75 %	25 %	0 %	0 %	225619085
4616	NC_012225	TTAT	2	8	153535	153542	25 %	75 %	0 %	0 %	225619085
4617	NC_012225	AT	3	6	153547	153552	50 %	50 %	0 %	0 %	225619085
4618	NC_012225	TTG	2	6	153553	153558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619085
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4621	NC_012225	TAG	2	6	153748	153753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619085
4622	NC_012225	GTG	2	6	153763	153768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225619085
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4626	NC_012225	ATA	2	6	153972	153977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619085
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