MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	AAAGT	2	10	878	887	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012204	GATAA	2	10	1121	1130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012204	GCAGA	2	10	2367	2376	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012204	TCTAA	2	10	2466	2475	40 %	40 %	0 %	20 %	224985712
5	NC_012204	TATTT	2	10	3100	3109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012204	ATAAA	2	10	3480	3489	80 %	20 %	0 %	0 %	224985713
7	NC_012204	GCCTA	2	10	3571	3580	20 %	20 %	20 %	40 %	224985713
8	NC_012204	GTTTG	2	10	5333	5342	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012204	AAACA	2	10	5639	5648	80 %	0 %	0 %	20 %	224985716
10	NC_012204	AAAGT	2	10	6880	6889	60 %	20 %	20 %	0 %	224985719
11	NC_012204	ATATT	3	15	8509	8523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012204	ATATA	2	10	8610	8619	60 %	40 %	0 %	0 %	224985722
13	NC_012204	TTAAT	2	10	9702	9711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012204	TAGAT	2	10	9727	9736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012204	ATTTT	2	10	9814	9823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012204	TTTTC	2	10	10289	10298	0 %	80 %	0 %	20 %	224985724
17	NC_012204	GCAAA	2	10	10696	10705	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012204	TATAG	2	10	10922	10931	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012204	AACTT	2	10	11700	11709	40 %	40 %	0 %	20 %	224985727
20	NC_012204	AAATT	2	10	11922	11931	60 %	40 %	0 %	0 %	224985727
21	NC_012204	AAATT	2	10	12036	12045	60 %	40 %	0 %	0 %	224985727
22	NC_012204	TTTTG	2	10	13700	13709	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012204	TTTAG	2	10	14028	14037	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012204	TATTG	2	10	15089	15098	20 %	60 %	20 %	0 %	224985731
25	NC_012204	TAAAT	2	10	15934	15943	60 %	40 %	0 %	0 %	224985732
26	NC_012204	ATTTT	2	10	16107	16116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012204	TAAAA	2	10	17139	17148	80 %	20 %	0 %	0 %	224985735
28	NC_012204	AATTT	2	10	18109	18118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012204	AATCA	2	10	18799	18808	60 %	20 %	0 %	20 %	224985736
30	NC_012204	CTAAA	2	10	18930	18939	60 %	20 %	0 %	20 %	224985736
31	NC_012204	GACAT	2	10	19387	19396	40 %	20 %	20 %	20 %	224985737
32	NC_012204	AATTT	2	10	19558	19567	40 %	60 %	0 %	0 %	224985737
33	NC_012204	AAAAT	2	10	19881	19890	80 %	20 %	0 %	0 %	224985738
34	NC_012204	TTATA	2	10	20017	20026	40 %	60 %	0 %	0 %	224985738
35	NC_012204	TGTAT	2	10	20248	20257	20 %	60 %	20 %	0 %	224985738
36	NC_012204	ATTAT	4	20	20591	20610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012204	TTATT	2	10	20623	20632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012204	AAAAT	2	10	20944	20953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012204	ATTTA	2	10	21102	21111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.