MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	AATA	2	8	339	346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012204	ATTT	2	8	404	411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012204	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012204	ATCT	2	8	478	485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012204	TAGA	2	8	561	568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012204	TCTA	2	8	1910	1917	25 %	50 %	0 %	25 %	224985711
7	NC_012204	AGCA	2	8	2557	2564	50 %	0 %	25 %	25 %	224985712
8	NC_012204	GTTA	2	8	2764	2771	25 %	50 %	25 %	0 %	224985712
9	NC_012204	TAAT	2	8	3075	3082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012204	TACA	2	8	3145	3152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012204	CTTA	2	8	3493	3500	25 %	50 %	0 %	25 %	224985713
12	NC_012204	TCTA	2	8	4277	4284	25 %	50 %	0 %	25 %	224985715
13	NC_012204	AGCA	2	8	4912	4919	50 %	0 %	25 %	25 %	224985715
14	NC_012204	TGCA	2	8	5093	5100	25 %	25 %	25 %	25 %	224985715
15	NC_012204	GCTT	2	8	5846	5853	0 %	50 %	25 %	25 %	224985717
16	NC_012204	TAAA	2	8	6228	6235	75 %	25 %	0 %	0 %	224985718
17	NC_012204	TAGA	2	8	6388	6395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012204	ATGA	2	8	7152	7159	50 %	25 %	25 %	0 %	224985719
19	NC_012204	TAAA	2	8	7267	7274	75 %	25 %	0 %	0 %	224985719
20	NC_012204	CTTA	2	8	7339	7346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012204	AGAT	2	8	7423	7430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012204	TTTC	2	8	7530	7537	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012204	TCAC	2	8	7541	7548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012204	ATTG	2	8	7889	7896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012204	AAAT	2	8	8195	8202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012204	TTTA	2	8	8254	8261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012204	ATAA	2	8	8369	8376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012204	TAAA	2	8	8391	8398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012204	TTAA	2	8	8586	8593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012204	CTAT	2	8	9262	9269	25 %	50 %	0 %	25 %	224985722
31	NC_012204	AAAC	2	8	9294	9301	75 %	0 %	0 %	25 %	224985722
32	NC_012204	AAGC	2	8	9677	9684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012204	ACAA	2	8	9839	9846	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012204	TAAT	2	8	9907	9914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012204	AATA	2	8	9944	9951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012204	TTAT	2	8	10243	10250	25 %	75 %	0 %	0 %	224985724
37	NC_012204	TAAT	2	8	10428	10435	50 %	50 %	0 %	0 %	224985725
38	NC_012204	ACAA	2	8	10542	10549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012204	TAAA	2	8	10683	10690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012204	GAAA	2	8	11479	11486	75 %	0 %	25 %	0 %	224985727
41	NC_012204	CAAA	2	8	11556	11563	75 %	0 %	0 %	25 %	224985727
42	NC_012204	AAAC	2	8	11866	11873	75 %	0 %	0 %	25 %	224985727
43	NC_012204	GAAA	2	8	11945	11952	75 %	0 %	25 %	0 %	224985727
44	NC_012204	ACGA	2	8	11976	11983	50 %	0 %	25 %	25 %	224985727
45	NC_012204	AAAT	2	8	11988	11995	75 %	25 %	0 %	0 %	224985727
46	NC_012204	TAAA	2	8	12072	12079	75 %	25 %	0 %	0 %	224985727
47	NC_012204	GCAA	2	8	12176	12183	50 %	0 %	25 %	25 %	224985727
48	NC_012204	GATG	2	8	12257	12264	25 %	25 %	50 %	0 %	224985728
49	NC_012204	AATG	2	8	13097	13104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012204	GAAT	2	8	13750	13757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012204	TAAT	2	8	14084	14091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012204	TGTA	2	8	14324	14331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012204	TATG	2	8	14494	14501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012204	AATT	2	8	15420	15427	50 %	50 %	0 %	0 %	224985731
55	NC_012204	AAAC	2	8	15626	15633	75 %	0 %	0 %	25 %	224985731
56	NC_012204	ATAA	2	8	15793	15800	75 %	25 %	0 %	0 %	224985732
57	NC_012204	AAGA	2	8	15809	15816	75 %	0 %	25 %	0 %	224985732
58	NC_012204	ATTT	2	8	15822	15829	25 %	75 %	0 %	0 %	224985732
59	NC_012204	TCAT	2	8	16558	16565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012204	ATTT	2	8	17053	17060	25 %	75 %	0 %	0 %	224985735
61	NC_012204	ATTT	2	8	17253	17260	25 %	75 %	0 %	0 %	224985735
62	NC_012204	TATT	2	8	17664	17671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012204	ATTA	2	8	17708	17715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012204	AATA	2	8	17793	17800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012204	TTAT	2	8	17982	17989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012204	ATTA	2	8	18135	18142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012204	ATTA	2	8	18167	18174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012204	ATTT	2	8	18362	18369	25 %	75 %	0 %	0 %	224985736
69	NC_012204	AAAG	2	8	18446	18453	75 %	0 %	25 %	0 %	224985736
70	NC_012204	ATTG	2	8	18607	18614	25 %	50 %	25 %	0 %	224985736
71	NC_012204	TCAA	2	8	18830	18837	50 %	25 %	0 %	25 %	224985736
72	NC_012204	ACTT	2	8	19292	19299	25 %	50 %	0 %	25 %	224985737
73	NC_012204	TAAA	2	8	19639	19646	75 %	25 %	0 %	0 %	224985737
74	NC_012204	ATTT	2	8	19897	19904	25 %	75 %	0 %	0 %	224985738
75	NC_012204	TTCC	2	8	19911	19918	0 %	50 %	0 %	50 %	224985738
76	NC_012204	GAAA	2	8	20344	20351	75 %	0 %	25 %	0 %	224985738
77	NC_012204	TATT	2	8	21225	21232	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012204	TTTC	2	8	21377	21384	0 %	75 %	0 %	25 %	224985739
79	NC_012204	TAGA	2	8	21569	21576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012204	AACC	2	8	21872	21879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012204	AGAC	2	8	22085	22092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012204	TTCT	2	8	22164	22171	0 %	75 %	0 %	25 %	224985742
83	NC_012204	GAGT	2	8	22333	22340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012204	GAAA	2	8	22388	22395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012204	TCAT	2	8	22659	22666	25 %	50 %	0 %	25 %	224985743
86	NC_012204	ATTT	2	8	22769	22776	25 %	75 %	0 %	0 %	224985743
87	NC_012204	AAAT	2	8	23622	23629	75 %	25 %	0 %	0 %	224985745

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.