MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	TA	3	6	114	119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012185	AT	4	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012185	TA	3	6	1514	1519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012185	TA	3	6	1857	1862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012185	AT	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012185	TA	3	6	2250	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012185	CT	3	6	2448	2453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012185	TA	4	8	2487	2494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012185	AT	3	6	3678	3683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012185	TC	3	6	3754	3759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012185	TA	3	6	3960	3965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012185	TA	3	6	3986	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012185	AT	3	6	4742	4747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012185	TG	3	6	5506	5511	0 %	50 %	50 %	0 %	224984644
15	NC_012185	AT	3	6	5683	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012185	CT	3	6	6987	6992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012185	AT	3	6	7741	7746	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
18	NC_012185	TA	3	6	7824	7829	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
19	NC_012185	TA	3	6	7955	7960	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
20	NC_012185	TA	3	6	8281	8286	50 %	50 %	0 %	0 %	224984647
21	NC_012185	TA	3	6	8632	8637	50 %	50 %	0 %	0 %	224984647
22	NC_012185	TA	3	6	9098	9103	50 %	50 %	0 %	0 %	224984648
23	NC_012185	TA	3	6	9459	9464	50 %	50 %	0 %	0 %	224984649
24	NC_012185	TC	3	6	9909	9914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012185	GA	3	6	9964	9969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012185	AG	3	6	10038	10043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012185	AT	6	12	10173	10184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012185	AT	3	6	10528	10533	50 %	50 %	0 %	0 %	224984651
29	NC_012185	GT	3	6	10552	10557	0 %	50 %	50 %	0 %	224984651
30	NC_012185	AG	3	6	10770	10775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012185	AT	3	6	10821	10826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012185	CT	4	8	12462	12469	0 %	50 %	0 %	50 %	224984653
33	NC_012185	TA	3	6	13022	13027	50 %	50 %	0 %	0 %	224984654
34	NC_012185	AT	4	8	13857	13864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012185	AT	3	6	14034	14039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012185	TA	3	6	14210	14215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012185	GA	3	6	14621	14626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012185	AT	3	6	14643	14648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012185	CT	3	6	14950	14955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012185	TA	3	6	15091	15096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012185	AT	3	6	15194	15199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012185	AT	3	6	15494	15499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012185	AT	3	6	15578	15583	50 %	50 %	0 %	0 %	224984659
44	NC_012185	AT	3	6	15822	15827	50 %	50 %	0 %	0 %	224984659
45	NC_012185	TA	3	6	16365	16370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012185	AT	3	6	16422	16427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012185	AG	3	6	16668	16673	50 %	0 %	50 %	0 %	224984661
48	NC_012185	TA	3	6	17163	17168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012185	TA	3	6	17205	17210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012185	TA	3	6	17795	17800	50 %	50 %	0 %	0 %	224984662
51	NC_012185	AT	3	6	17997	18002	50 %	50 %	0 %	0 %	224984662
52	NC_012185	AT	3	6	18226	18231	50 %	50 %	0 %	0 %	224984662
53	NC_012185	AT	4	8	18671	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	224984662
54	NC_012185	TA	3	6	19033	19038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012185	TA	3	6	19661	19666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012185	AT	3	6	19698	19703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012185	CT	3	6	19705	19710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012185	TA	4	8	19795	19802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012185	TC	3	6	19835	19840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012185	AT	3	6	19920	19925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012185	CA	3	6	20306	20311	50 %	0 %	0 %	50 %	224984666
62	NC_012185	TC	3	6	20348	20353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012185	AT	3	6	20607	20612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012185	AT	3	6	20847	20852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012185	TA	3	6	21374	21379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012185	TA	3	6	22052	22057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012185	AT	3	6	22124	22129	50 %	50 %	0 %	0 %	224984669
68	NC_012185	TC	3	6	22202	22207	0 %	50 %	0 %	50 %	224984669
69	NC_012185	TA	3	6	22296	22301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012185	AT	3	6	22426	22431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012185	AT	3	6	22644	22649	50 %	50 %	0 %	0 %	224984670
72	NC_012185	TA	3	6	23542	23547	50 %	50 %	0 %	0 %	224984671
73	NC_012185	TA	3	6	23697	23702	50 %	50 %	0 %	0 %	224984671
74	NC_012185	AT	3	6	23710	23715	50 %	50 %	0 %	0 %	224984671
75	NC_012185	AT	3	6	24882	24887	50 %	50 %	0 %	0 %	224984673
76	NC_012185	GA	3	6	25462	25467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012185	TA	3	6	25505	25510	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
78	NC_012185	TA	3	6	25726	25731	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
79	NC_012185	AT	3	6	25749	25754	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
80	NC_012185	TA	3	6	25868	25873	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
81	NC_012185	AT	3	6	25922	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
82	NC_012185	AT	3	6	25990	25995	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
83	NC_012185	AG	3	6	26004	26009	50 %	0 %	50 %	0 %	224984674
84	NC_012185	TC	4	8	26147	26154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012185	AT	3	6	26598	26603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012185	TG	3	6	27498	27503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012185	TA	3	6	27678	27683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012185	AT	6	12	28132	28143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012185	TA	3	6	28315	28320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012185	TC	3	6	29435	29440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012185	TA	3	6	29515	29520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012185	CT	3	6	30240	30245	0 %	50 %	0 %	50 %	224984683
93	NC_012185	TC	3	6	30724	30729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012185	AT	3	6	30784	30789	50 %	50 %	0 %	0 %	224984685
95	NC_012185	AT	3	6	30845	30850	50 %	50 %	0 %	0 %	224984685
96	NC_012185	GT	3	6	31022	31027	0 %	50 %	50 %	0 %	224984685
97	NC_012185	TA	3	6	31522	31527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012185	TA	3	6	32595	32600	50 %	50 %	0 %	0 %	224984687
99	NC_012185	CT	3	6	33926	33931	0 %	50 %	0 %	50 %	224984690
100	NC_012185	AT	3	6	33966	33971	50 %	50 %	0 %	0 %	224984690
101	NC_012185	AT	3	6	34257	34262	50 %	50 %	0 %	0 %	224984691
102	NC_012185	TC	3	6	34867	34872	0 %	50 %	0 %	50 %	224984692
103	NC_012185	TA	3	6	35692	35697	50 %	50 %	0 %	0 %	224984694
104	NC_012185	TA	3	6	36185	36190	50 %	50 %	0 %	0 %	224984696
105	NC_012185	TA	3	6	36505	36510	50 %	50 %	0 %	0 %	224984697
106	NC_012185	TA	3	6	36929	36934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012185	AT	3	6	37270	37275	50 %	50 %	0 %	0 %	224984700
108	NC_012185	AT	3	6	37586	37591	50 %	50 %	0 %	0 %	224984701
109	NC_012185	AT	3	6	39384	39389	50 %	50 %	0 %	0 %	224984706
110	NC_012185	AT	3	6	39600	39605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012185	AG	3	6	39863	39868	50 %	0 %	50 %	0 %	224984709
112	NC_012185	TA	4	8	40858	40865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012185	AT	3	6	41447	41452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012185	AT	3	6	42158	42163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012185	TA	3	6	42164	42169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012185	AT	4	8	43513	43520	50 %	50 %	0 %	0 %	224984718
117	NC_012185	AT	4	8	44160	44167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012185	AT	3	6	44191	44196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012185	AT	3	6	45093	45098	50 %	50 %	0 %	0 %	224984722
120	NC_012185	TA	3	6	45718	45723	50 %	50 %	0 %	0 %	224984724
121	NC_012185	TC	3	6	45758	45763	0 %	50 %	0 %	50 %	224984724
122	NC_012185	TA	3	6	45935	45940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012185	CT	3	6	46283	46288	0 %	50 %	0 %	50 %	224984725
124	NC_012185	GT	3	6	47207	47212	0 %	50 %	50 %	0 %	224984728
125	NC_012185	TA	3	6	47574	47579	50 %	50 %	0 %	0 %	224984729
126	NC_012185	TA	3	6	48446	48451	50 %	50 %	0 %	0 %	224984730
127	NC_012185	TA	3	6	48904	48909	50 %	50 %	0 %	0 %	224984731
128	NC_012185	AT	4	8	49040	49047	50 %	50 %	0 %	0 %	224984731
129	NC_012185	AT	3	6	49536	49541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012185	TA	3	6	50430	50435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012185	TA	3	6	50530	50535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012185	TA	3	6	50689	50694	50 %	50 %	0 %	0 %	224984733
133	NC_012185	TA	3	6	51072	51077	50 %	50 %	0 %	0 %	224984734
134	NC_012185	AT	3	6	51596	51601	50 %	50 %	0 %	0 %	224984735
135	NC_012185	TA	3	6	51687	51692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012185	GT	3	6	52170	52175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012185	AT	3	6	52255	52260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012185	AT	3	6	53196	53201	50 %	50 %	0 %	0 %	224984738
139	NC_012185	TA	3	6	53330	53335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012185	TA	3	6	53574	53579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012185	AT	5	10	53581	53590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012185	TA	3	6	53592	53597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012185	AT	3	6	53929	53934	50 %	50 %	0 %	0 %	224984739
144	NC_012185	AT	3	6	54764	54769	50 %	50 %	0 %	0 %	224984739
145	NC_012185	AT	3	6	54964	54969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012185	AT	3	6	54982	54987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012185	TA	5	10	55312	55321	50 %	50 %	0 %	0 %	224984740
148	NC_012185	AT	4	8	55803	55810	50 %	50 %	0 %	0 %	224984740
149	NC_012185	AT	3	6	55860	55865	50 %	50 %	0 %	0 %	224984740
150	NC_012185	TG	3	6	56270	56275	0 %	50 %	50 %	0 %	224984741
151	NC_012185	AG	3	6	57359	57364	50 %	0 %	50 %	0 %	224984742
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.