MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012185	GAT	2	6	156	161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012185	TTA	2	6	175	180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012185	CCT	2	6	297	302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984640
5	NC_012185	GAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
6	NC_012185	ACA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984640
7	NC_012185	AGA	2	6	478	483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
8	NC_012185	TGA	3	9	505	513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
9	NC_012185	TGC	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
10	NC_012185	AGT	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
11	NC_012185	TTG	2	6	696	701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984640
12	NC_012185	GGC	2	6	703	708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224984640
13	NC_012185	TGA	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
14	NC_012185	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
15	NC_012185	TGA	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984640
16	NC_012185	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984640
17	NC_012185	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
18	NC_012185	ATT	2	6	941	946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984640
19	NC_012185	GCT	3	9	947	955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
20	NC_012185	GTG	3	9	969	977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
21	NC_012185	TGC	3	9	1096	1104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
22	NC_012185	GTG	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984640
23	NC_012185	TGC	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984640
24	NC_012185	TAT	2	6	1411	1416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012185	TAT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012185	TAT	2	6	1497	1502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012185	CTT	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012185	TTA	2	6	1559	1564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012185	TTA	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012185	AAT	2	6	1659	1664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012185	TAA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012185	ATA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012185	AAC	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012185	TTA	2	6	1888	1893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012185	ATT	2	6	1911	1916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012185	AAT	2	6	1964	1969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012185	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012185	TAA	2	6	2039	2044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012185	TAG	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012185	TAC	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012185	CAA	2	6	2147	2152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012185	AAT	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012185	TAA	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012185	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012185	CAC	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012185	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012185	CTA	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012185	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012185	ATT	2	6	2396	2401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012185	TAA	2	6	2441	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012185	CTT	2	6	2464	2469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012185	TGC	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012185	TTA	2	6	2605	2610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012185	TTG	2	6	2614	2619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012185	TTA	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012185	ATA	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012185	TTA	2	6	2749	2754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012185	ACA	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012185	ATT	2	6	2820	2825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012185	TTA	2	6	2872	2877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012185	ATT	2	6	2901	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012185	TCC	2	6	2957	2962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012185	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012185	TCG	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012185	TTA	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984641
66	NC_012185	CTT	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984641
67	NC_012185	CAA	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984641
68	NC_012185	ACT	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012185	TAT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012185	TTA	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012185	TAA	3	9	3446	3454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012185	TAG	2	6	3459	3464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012185	ATC	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012185	TAT	2	6	3527	3532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012185	TTA	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012185	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012185	TAC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012185	ATC	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012185	TAA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012185	TTA	2	6	4049	4054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012185	CAA	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012185	TAT	2	6	4179	4184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012185	TAT	2	6	4272	4277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012185	TTA	2	6	4298	4303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012185	GTT	2	6	4341	4346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012185	CAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984642
87	NC_012185	AAT	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
88	NC_012185	TTA	2	6	4395	4400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
89	NC_012185	ATT	2	6	4406	4411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
90	NC_012185	ATG	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984642
91	NC_012185	TAA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
92	NC_012185	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984642
93	NC_012185	TAT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984642
94	NC_012185	ATT	2	6	4678	4683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012185	TAT	2	6	4776	4781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012185	TAT	2	6	4799	4804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012185	TTA	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012185	AAT	2	6	4851	4856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012185	TAT	2	6	4934	4939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012185	CCA	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012185	ACA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012185	ATG	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984643
103	NC_012185	TTC	2	6	5071	5076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984643
104	NC_012185	TTG	2	6	5088	5093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984643
105	NC_012185	ATT	2	6	5121	5126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984643
106	NC_012185	TTC	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984643
107	NC_012185	ATT	2	6	5218	5223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012185	TTA	2	6	5240	5245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012185	TAA	2	6	5260	5265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012185	ATA	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012185	AAG	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012185	TAA	3	9	5348	5356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012185	ATT	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012185	ATT	2	6	5396	5401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012185	AAT	2	6	5419	5424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012185	AAG	2	6	5481	5486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012185	ATA	2	6	5492	5497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012185	CTA	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984644
119	NC_012185	ACA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984644
120	NC_012185	TAA	2	6	5615	5620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984644
121	NC_012185	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012185	AAT	2	6	5760	5765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012185	AAT	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012185	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984645
125	NC_012185	AAG	2	6	6040	6045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
126	NC_012185	AAG	3	9	6058	6066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
127	NC_012185	AAG	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
128	NC_012185	GAA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
129	NC_012185	TGA	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984645
130	NC_012185	AGA	2	6	6267	6272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
131	NC_012185	TAT	2	6	6490	6495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984645
132	NC_012185	AGA	2	6	6515	6520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984645
133	NC_012185	AAC	2	6	6526	6531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984645
134	NC_012185	TTA	2	6	6534	6539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984645
135	NC_012185	ATC	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984645
136	NC_012185	ATA	3	9	6698	6706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012185	TAT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012185	ATT	2	6	6788	6793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012185	TAA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012185	GCC	2	6	6904	6909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_012185	TAT	2	6	7251	7256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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