MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	AT	3	6	459	464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012180	TA	3	6	752	757	50 %	50 %	0 %	0 %	224796763
3	NC_012180	TA	4	8	3808	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012180	CA	3	6	4142	4147	50 %	0 %	0 %	50 %	224796744
5	NC_012180	AT	3	6	4503	4508	50 %	50 %	0 %	0 %	224796757
6	NC_012180	CT	3	6	4537	4542	0 %	50 %	0 %	50 %	224796757
7	NC_012180	CA	3	6	4555	4560	50 %	0 %	0 %	50 %	224796757
8	NC_012180	AT	3	6	4715	4720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012180	CT	3	6	6896	6901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012180	AT	3	6	7215	7220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012180	AT	3	6	7223	7228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012180	TA	3	6	7251	7256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012180	GA	3	6	7696	7701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012180	CA	3	6	8134	8139	50 %	0 %	0 %	50 %	224796755
15	NC_012180	TA	4	8	8140	8147	50 %	50 %	0 %	0 %	224796755
16	NC_012180	AT	3	6	8149	8154	50 %	50 %	0 %	0 %	224796755
17	NC_012180	AT	3	6	8376	8381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012180	TA	3	6	8984	8989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012180	TA	3	6	9332	9337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012180	AT	3	6	9457	9462	50 %	50 %	0 %	0 %	224796765
21	NC_012180	GT	3	6	9793	9798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012180	AT	3	6	10120	10125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012180	TA	3	6	10433	10438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012180	TA	4	8	10463	10470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012180	AT	3	6	10803	10808	50 %	50 %	0 %	0 %	224796769
26	NC_012180	TA	3	6	10849	10854	50 %	50 %	0 %	0 %	224796769
27	NC_012180	AT	3	6	11168	11173	50 %	50 %	0 %	0 %	224796769
28	NC_012180	AT	3	6	11184	11189	50 %	50 %	0 %	0 %	224796769
29	NC_012180	TA	3	6	11443	11448	50 %	50 %	0 %	0 %	224796769
30	NC_012180	AT	3	6	12275	12280	50 %	50 %	0 %	0 %	224796761
31	NC_012180	AT	3	6	12356	12361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012180	TG	3	6	12362	12367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012180	TA	3	6	13462	13467	50 %	50 %	0 %	0 %	224796754
34	NC_012180	GA	3	6	14623	14628	50 %	0 %	50 %	0 %	224796756
35	NC_012180	AT	3	6	14728	14733	50 %	50 %	0 %	0 %	224796756
36	NC_012180	AT	3	6	15012	15017	50 %	50 %	0 %	0 %	224796756
37	NC_012180	TA	3	6	15080	15085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012180	TA	3	6	15205	15210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012180	TA	5	10	15781	15790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012180	TA	3	6	16554	16559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012180	AG	3	6	16708	16713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012180	AT	3	6	16852	16857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012180	AT	3	6	16873	16878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012180	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012180	AT	3	6	16915	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012180	TG	3	6	17256	17261	0 %	50 %	50 %	0 %	224796753
47	NC_012180	TG	3	6	17422	17427	0 %	50 %	50 %	0 %	224796753
48	NC_012180	TA	3	6	17662	17667	50 %	50 %	0 %	0 %	224796753
49	NC_012180	AT	3	6	17986	17991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012180	TA	3	6	18597	18602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012180	TA	3	6	18899	18904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012180	AT	3	6	19290	19295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012180	TA	3	6	19475	19480	50 %	50 %	0 %	0 %	224796746
54	NC_012180	TA	3	6	19597	19602	50 %	50 %	0 %	0 %	224796746
55	NC_012180	TA	3	6	19841	19846	50 %	50 %	0 %	0 %	224796746

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.