MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012180	ACTAT	2	10	38	47	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012180	GATAA	2	10	1216	1225	60 %	20 %	20 %	0 %	224796763
3	NC_012180	AAAAG	2	10	1423	1432	80 %	0 %	20 %	0 %	224796763
4	NC_012180	AATTT	2	10	1937	1946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012180	GTTTT	2	10	2192	2201	0 %	80 %	20 %	0 %	224796760
6	NC_012180	TTTGA	2	10	2635	2644	20 %	60 %	20 %	0 %	224796760
7	NC_012180	ATTTA	2	10	2879	2888	40 %	60 %	0 %	0 %	224796760
8	NC_012180	AATTT	2	10	3003	3012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012180	GTTTT	2	10	3249	3258	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012180	TTTGA	2	10	3685	3694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012180	CAAAA	2	10	4225	4234	80 %	0 %	0 %	20 %	224796744
12	NC_012180	TTTAT	2	10	4842	4851	20 %	80 %	0 %	0 %	224796762
13	NC_012180	AAATT	2	10	5197	5206	60 %	40 %	0 %	0 %	224796762
14	NC_012180	TAAAG	2	10	5906	5915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012180	ATTAG	2	10	6031	6040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012180	TTTTA	2	10	6822	6831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012180	AAACA	2	10	6865	6874	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012180	TATAA	2	10	7232	7241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012180	CAAAA	2	10	8577	8586	80 %	0 %	0 %	20 %	224796751
20	NC_012180	TAAGA	2	10	10352	10361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012180	TATCT	2	10	11227	11236	20 %	60 %	0 %	20 %	224796769
22	NC_012180	TTTTA	2	10	11299	11308	20 %	80 %	0 %	0 %	224796769
23	NC_012180	TTATC	2	10	11847	11856	20 %	60 %	0 %	20 %	224796769
24	NC_012180	AATTG	2	10	12094	12103	40 %	40 %	20 %	0 %	224796761
25	NC_012180	GGTTT	2	10	12521	12530	0 %	60 %	40 %	0 %	224796754
26	NC_012180	ATTTG	2	10	12768	12777	20 %	60 %	20 %	0 %	224796754
27	NC_012180	TTTTC	2	10	13050	13059	0 %	80 %	0 %	20 %	224796754
28	NC_012180	ATAAA	2	10	13642	13651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012180	ATTTT	2	10	13858	13867	20 %	80 %	0 %	0 %	224796767
30	NC_012180	TTTAA	2	10	14205	14214	40 %	60 %	0 %	0 %	224796767
31	NC_012180	GTATG	2	10	15362	15371	20 %	40 %	40 %	0 %	224796745
32	NC_012180	AAATT	2	10	15601	15610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012180	ATTTT	2	10	15793	15802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012180	ATATA	2	10	16938	16947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012180	ATATA	2	10	16959	16968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012180	ATATA	2	10	16980	16989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012180	TTTTA	2	10	18139	18148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012180	TTAAA	2	10	18361	18370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012180	AAAGA	2	10	18403	18412	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012180	TTATG	2	10	18629	18638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012180	TAAAG	2	10	18794	18803	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012180	TTGAA	2	10	19447	19456	40 %	40 %	20 %	0 %	224796746
43	NC_012180	TCTAA	2	10	19824	19833	40 %	40 %	0 %	20 %	224796746

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.