MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp17

Total Repeats: 656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012180	AAT	2	6	15441	15446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012180	T	7	7	15472	15478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012180	T	6	6	15488	15493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012180	A	6	6	15498	15503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012180	ATT	2	6	15510	15515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012180	TTTA	2	8	15527	15534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012180	AAATT	2	10	15601	15610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012180	T	6	6	15641	15646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012180	A	7	7	15698	15704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012180	TA	5	10	15781	15790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012180	ATTTT	2	10	15793	15802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012180	T	7	7	15799	15805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012180	ATT	2	6	15818	15823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012180	TAA	2	6	15830	15835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012180	CTT	2	6	15874	15879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796758
516	NC_012180	T	6	6	15899	15904	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
517	NC_012180	TGT	3	9	15930	15938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796758
518	NC_012180	TTG	2	6	15987	15992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796758
519	NC_012180	T	6	6	15997	16002	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
520	NC_012180	GTT	2	6	16007	16012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796758
521	NC_012180	T	6	6	16088	16093	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
522	NC_012180	TAG	2	6	16119	16124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796758
523	NC_012180	AGTT	2	8	16135	16142	25 %	50 %	25 %	0 %	224796758
524	NC_012180	TCG	2	6	16152	16157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796758
525	NC_012180	GCA	2	6	16173	16178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796758
526	NC_012180	ATT	2	6	16179	16184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796758
527	NC_012180	T	6	6	16204	16209	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
528	NC_012180	CTGTTT	2	12	16210	16221	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224796758
529	NC_012180	TAA	2	6	16225	16230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796758
530	NC_012180	TCGTAA	2	12	16236	16247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224796758
531	NC_012180	AAC	2	6	16268	16273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796758
532	NC_012180	T	6	6	16367	16372	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
533	NC_012180	A	6	6	16395	16400	100 %	0 %	0 %	0 %	224796758
534	NC_012180	TAT	2	6	16403	16408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796758
535	NC_012180	ATTT	2	8	16415	16422	25 %	75 %	0 %	0 %	224796758
536	NC_012180	A	7	7	16457	16463	100 %	0 %	0 %	0 %	224796758
537	NC_012180	T	6	6	16500	16505	0 %	100 %	0 %	0 %	224796758
538	NC_012180	ATT	2	6	16542	16547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012180	TA	3	6	16554	16559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012180	A	8	8	16619	16626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012180	T	8	8	16641	16648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012180	TTG	2	6	16654	16659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012180	AG	3	6	16708	16713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012180	TATT	2	8	16732	16739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012180	TTA	2	6	16759	16764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012180	AAT	2	6	16783	16788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012180	TAAT	2	8	16846	16853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012180	AT	3	6	16852	16857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012180	TAAT	2	8	16867	16874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012180	AT	3	6	16873	16878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012180	TAAT	2	8	16888	16895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012180	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012180	TAAT	2	8	16909	16916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012180	AT	3	6	16915	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012180	TAAT	2	8	16930	16937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012180	ATATA	2	10	16938	16947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012180	TAAT	2	8	16951	16958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012180	ATATA	2	10	16959	16968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012180	TAAT	2	8	16972	16979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012180	ATATA	2	10	16980	16989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012180	A	7	7	17010	17016	100 %	0 %	0 %	0 %	224796753
562	NC_012180	GGT	2	6	17037	17042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224796753
563	NC_012180	A	7	7	17093	17099	100 %	0 %	0 %	0 %	224796753
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566	NC_012180	A	7	7	17233	17239	100 %	0 %	0 %	0 %	224796753
567	NC_012180	TG	3	6	17256	17261	0 %	50 %	50 %	0 %	224796753
568	NC_012180	AGA	2	6	17277	17282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796753
569	NC_012180	GAT	2	6	17322	17327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796753
570	NC_012180	GAA	2	6	17404	17409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796753
571	NC_012180	TG	3	6	17422	17427	0 %	50 %	50 %	0 %	224796753
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573	NC_012180	GAA	2	6	17487	17492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796753
574	NC_012180	A	6	6	17519	17524	100 %	0 %	0 %	0 %	224796753
575	NC_012180	ATT	2	6	17541	17546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796753
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579	NC_012180	AGA	2	6	17764	17769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012180	ATT	2	6	17771	17776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012180	GTG	2	6	17811	17816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012180	ATG	2	6	17820	17825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012180	TTGT	2	8	17826	17833	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012180	AAT	2	6	17834	17839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012180	GAT	3	9	17869	17877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012180	AT	3	6	17986	17991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012180	ATA	2	6	18007	18012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012180	CTT	2	6	18013	18018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_012180	TGT	2	6	18040	18045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_012180	ATT	2	6	18084	18089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012180	ATA	2	6	18091	18096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012180	TAT	2	6	18108	18113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012180	TTTTA	2	10	18139	18148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012180	A	7	7	18186	18192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012180	ATT	2	6	18202	18207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012180	ACA	2	6	18263	18268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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599	NC_012180	A	6	6	18278	18283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012180	ATA	2	6	18303	18308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012180	A	6	6	18328	18333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012180	TTA	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012180	TTAAA	2	10	18361	18370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_012180	TAAA	2	8	18418	18425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012180	TA	3	6	18597	18602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012180	T	6	6	18607	18612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012180	TTAAGT	2	12	18614	18625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012180	TTATG	2	10	18629	18638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012180	ATT	2	6	18682	18687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012180	GCA	2	6	18701	18706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012180	ACT	2	6	18734	18739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_012180	TAAAG	2	10	18794	18803	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012180	ATT	2	6	18812	18817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012180	TGG	2	6	18821	18826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012180	AAT	2	6	18842	18847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012180	AAG	2	6	18873	18878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012180	TTAT	2	8	18879	18886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012180	TA	3	6	18899	18904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012180	ATT	2	6	18917	18922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012180	AATTAC	2	12	18944	18955	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224796764
622	NC_012180	ATAA	3	12	18990	19001	75 %	25 %	0 %	0 %	224796764
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624	NC_012180	TAA	2	6	19019	19024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796764
625	NC_012180	A	6	6	19027	19032	100 %	0 %	0 %	0 %	224796764
626	NC_012180	TAA	2	6	19052	19057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796764
627	NC_012180	T	6	6	19076	19081	0 %	100 %	0 %	0 %	224796764
628	NC_012180	A	6	6	19103	19108	100 %	0 %	0 %	0 %	224796764
629	NC_012180	TAT	2	6	19163	19168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796764
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631	NC_012180	TAT	2	6	19265	19270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012180	TTA	2	6	19281	19286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012180	AT	3	6	19290	19295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012180	T	6	6	19346	19351	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
635	NC_012180	T	8	8	19386	19393	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
636	NC_012180	T	8	8	19395	19402	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
637	NC_012180	T	6	6	19432	19437	0 %	100 %	0 %	0 %	224796746
638	NC_012180	TTGAA	2	10	19447	19456	40 %	40 %	20 %	0 %	224796746
639	NC_012180	TAT	2	6	19468	19473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796746
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641	NC_012180	GATCTA	2	12	19513	19524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224796746
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656	NC_012180	T	7	7	20008	20014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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