MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	A	6	6	1	6	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012177	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012177	A	7	7	229	235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012177	G	7	7	374	380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012177	A	6	6	646	651	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
6	NC_012177	A	8	8	763	770	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
7	NC_012177	A	7	7	1036	1042	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
8	NC_012177	A	8	8	1138	1145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012177	T	6	6	1159	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012177	A	6	6	1274	1279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012177	A	7	7	1463	1469	100 %	0 %	0 %	0 %	224984383
12	NC_012177	A	8	8	1513	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	224984383
13	NC_012177	T	7	7	2148	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
14	NC_012177	T	6	6	2200	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
15	NC_012177	T	8	8	2803	2810	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
16	NC_012177	A	7	7	3009	3015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	T	6	6	3047	3052	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
18	NC_012177	T	6	6	3089	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
19	NC_012177	T	6	6	3314	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
20	NC_012177	T	6	6	3514	3519	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
21	NC_012177	T	8	8	4154	4161	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
22	NC_012177	A	6	6	4521	4526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012177	T	6	6	4553	4558	0 %	100 %	0 %	0 %	224984386
24	NC_012177	A	6	6	4822	4827	100 %	0 %	0 %	0 %	224984386
25	NC_012177	T	7	7	4992	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	224984386
26	NC_012177	T	8	8	5054	5061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012177	A	9	9	5062	5070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012177	T	9	9	5375	5383	0 %	100 %	0 %	0 %	224984387
29	NC_012177	A	6	6	5541	5546	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
30	NC_012177	A	8	8	5568	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
31	NC_012177	T	6	6	5688	5693	0 %	100 %	0 %	0 %	224984388
32	NC_012177	A	7	7	5886	5892	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
33	NC_012177	A	9	9	6006	6014	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
34	NC_012177	A	6	6	6038	6043	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
35	NC_012177	A	6	6	6245	6250	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
36	NC_012177	A	8	8	6259	6266	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
37	NC_012177	A	6	6	6451	6456	100 %	0 %	0 %	0 %	224984389
38	NC_012177	A	6	6	6577	6582	100 %	0 %	0 %	0 %	224984389
39	NC_012177	A	6	6	6786	6791	100 %	0 %	0 %	0 %	224984389
40	NC_012177	A	7	7	6805	6811	100 %	0 %	0 %	0 %	224984389
41	NC_012177	A	6	6	6835	6840	100 %	0 %	0 %	0 %	224984389
42	NC_012177	A	6	6	6972	6977	100 %	0 %	0 %	0 %	224984389
43	NC_012177	T	6	6	6995	7000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012177	A	6	6	7242	7247	100 %	0 %	0 %	0 %	224984390
45	NC_012177	A	8	8	7298	7305	100 %	0 %	0 %	0 %	224984390
46	NC_012177	A	6	6	7380	7385	100 %	0 %	0 %	0 %	224984390
47	NC_012177	A	7	7	7629	7635	100 %	0 %	0 %	0 %	224984390
48	NC_012177	A	6	6	7646	7651	100 %	0 %	0 %	0 %	224984390
49	NC_012177	T	7	7	8133	8139	0 %	100 %	0 %	0 %	224984391
50	NC_012177	A	6	6	8254	8259	100 %	0 %	0 %	0 %	224984391
51	NC_012177	A	6	6	8266	8271	100 %	0 %	0 %	0 %	224984391
52	NC_012177	A	6	6	8657	8662	100 %	0 %	0 %	0 %	224984392
53	NC_012177	T	6	6	8707	8712	0 %	100 %	0 %	0 %	224984393
54	NC_012177	A	6	6	8980	8985	100 %	0 %	0 %	0 %	224984393
55	NC_012177	A	6	6	9026	9031	100 %	0 %	0 %	0 %	224984393
56	NC_012177	A	6	6	9037	9042	100 %	0 %	0 %	0 %	224984393
57	NC_012177	T	7	7	9069	9075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012177	T	9	9	9160	9168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012177	A	6	6	9258	9263	100 %	0 %	0 %	0 %	224984394
60	NC_012177	A	7	7	9331	9337	100 %	0 %	0 %	0 %	224984394
61	NC_012177	A	6	6	9652	9657	100 %	0 %	0 %	0 %	224984394
62	NC_012177	A	6	6	9740	9745	100 %	0 %	0 %	0 %	224984394
63	NC_012177	A	7	7	9888	9894	100 %	0 %	0 %	0 %	224984394
64	NC_012177	A	7	7	10294	10300	100 %	0 %	0 %	0 %	224984395
65	NC_012177	A	6	6	10479	10484	100 %	0 %	0 %	0 %	224984395
66	NC_012177	A	6	6	10503	10508	100 %	0 %	0 %	0 %	224984395
67	NC_012177	A	6	6	10643	10648	100 %	0 %	0 %	0 %	224984395
68	NC_012177	A	7	7	10788	10794	100 %	0 %	0 %	0 %	224984395
69	NC_012177	A	6	6	11114	11119	100 %	0 %	0 %	0 %	224984396
70	NC_012177	A	6	6	11169	11174	100 %	0 %	0 %	0 %	224984396
71	NC_012177	T	7	7	11448	11454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012177	T	6	6	11458	11463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012177	T	6	6	11481	11486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012177	A	6	6	11583	11588	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
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76	NC_012177	A	7	7	11667	11673	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
77	NC_012177	A	7	7	11681	11687	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
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79	NC_012177	A	6	6	11820	11825	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
80	NC_012177	A	6	6	11903	11908	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
81	NC_012177	A	7	7	11943	11949	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
82	NC_012177	A	6	6	12047	12052	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
83	NC_012177	A	7	7	12072	12078	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
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88	NC_012177	A	6	6	12579	12584	100 %	0 %	0 %	0 %	224984397
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90	NC_012177	A	7	7	12782	12788	100 %	0 %	0 %	0 %	224984398
91	NC_012177	A	6	6	12863	12868	100 %	0 %	0 %	0 %	224984398
92	NC_012177	A	7	7	12870	12876	100 %	0 %	0 %	0 %	224984398
93	NC_012177	A	6	6	13130	13135	100 %	0 %	0 %	0 %	224984398
94	NC_012177	T	6	6	13194	13199	0 %	100 %	0 %	0 %	224984398
95	NC_012177	A	6	6	13229	13234	100 %	0 %	0 %	0 %	224984398
96	NC_012177	A	6	6	13316	13321	100 %	0 %	0 %	0 %	224984398
97	NC_012177	G	6	6	13330	13335	0 %	0 %	100 %	0 %	224984398
98	NC_012177	A	6	6	13354	13359	100 %	0 %	0 %	0 %	224984398
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104	NC_012177	A	8	8	14562	14569	100 %	0 %	0 %	0 %	224984400
105	NC_012177	A	6	6	14596	14601	100 %	0 %	0 %	0 %	224984400
106	NC_012177	T	8	8	14602	14609	0 %	100 %	0 %	0 %	224984400
107	NC_012177	T	6	6	14621	14626	0 %	100 %	0 %	0 %	224984400
108	NC_012177	T	6	6	14842	14847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012177	T	7	7	14894	14900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012177	A	6	6	14917	14922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012177	A	6	6	15244	15249	100 %	0 %	0 %	0 %	224984401
112	NC_012177	A	6	6	15259	15264	100 %	0 %	0 %	0 %	224984401
113	NC_012177	T	6	6	15317	15322	0 %	100 %	0 %	0 %	224984401
114	NC_012177	T	6	6	15802	15807	0 %	100 %	0 %	0 %	224984402
115	NC_012177	T	6	6	15891	15896	0 %	100 %	0 %	0 %	224984402
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117	NC_012177	T	6	6	16123	16128	0 %	100 %	0 %	0 %	224984402
118	NC_012177	T	6	6	16159	16164	0 %	100 %	0 %	0 %	224984402
119	NC_012177	T	6	6	16438	16443	0 %	100 %	0 %	0 %	224984403
120	NC_012177	T	8	8	16454	16461	0 %	100 %	0 %	0 %	224984403
121	NC_012177	T	6	6	16476	16481	0 %	100 %	0 %	0 %	224984403
122	NC_012177	T	6	6	16483	16488	0 %	100 %	0 %	0 %	224984403
123	NC_012177	T	6	6	16865	16870	0 %	100 %	0 %	0 %	224984403
124	NC_012177	T	6	6	16975	16980	0 %	100 %	0 %	0 %	224984403
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126	NC_012177	T	6	6	17507	17512	0 %	100 %	0 %	0 %	224984404
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129	NC_012177	T	7	7	17872	17878	0 %	100 %	0 %	0 %	224984405
130	NC_012177	A	6	6	17883	17888	100 %	0 %	0 %	0 %	224984405
131	NC_012177	A	8	8	17988	17995	100 %	0 %	0 %	0 %	224984405
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133	NC_012177	A	7	7	18264	18270	100 %	0 %	0 %	0 %	224984405
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137	NC_012177	T	6	6	19946	19951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012177	A	7	7	19954	19960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_012177	A	6	6	20345	20350	100 %	0 %	0 %	0 %	224984407
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147	NC_012177	T	6	6	21555	21560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.