MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	AT	3	6	336	341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012177	AG	3	6	629	634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012177	CT	3	6	1218	1223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012177	TA	3	6	1972	1977	50 %	50 %	0 %	0 %	224984383
5	NC_012177	CT	3	6	2849	2854	0 %	50 %	0 %	50 %	224984384
6	NC_012177	TA	3	6	2953	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012177	TA	3	6	3074	3079	50 %	50 %	0 %	0 %	224984385
8	NC_012177	TA	3	6	4338	4343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012177	AT	3	6	4438	4443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012177	AT	3	6	5082	5087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012177	AT	3	6	7292	7297	50 %	50 %	0 %	0 %	224984390
12	NC_012177	AC	3	6	7415	7420	50 %	0 %	0 %	50 %	224984390
13	NC_012177	CA	3	6	7746	7751	50 %	0 %	0 %	50 %	224984390
14	NC_012177	GA	4	8	8548	8555	50 %	0 %	50 %	0 %	224984392
15	NC_012177	TA	3	6	9117	9122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012177	AT	3	6	9248	9253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	TA	3	6	10977	10982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012177	TA	3	6	11049	11054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012177	AT	4	8	11431	11438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012177	TA	4	8	12003	12010	50 %	50 %	0 %	0 %	224984397
21	NC_012177	AT	3	6	13162	13167	50 %	50 %	0 %	0 %	224984398
22	NC_012177	AT	3	6	13547	13552	50 %	50 %	0 %	0 %	224984399
23	NC_012177	TA	3	6	13723	13728	50 %	50 %	0 %	0 %	224984399
24	NC_012177	TG	3	6	13776	13781	0 %	50 %	50 %	0 %	224984399
25	NC_012177	TA	3	6	13789	13794	50 %	50 %	0 %	0 %	224984399
26	NC_012177	GA	4	8	13978	13985	50 %	0 %	50 %	0 %	224984399
27	NC_012177	AT	3	6	15166	15171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012177	CA	4	8	15191	15198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012177	AG	3	6	15522	15527	50 %	0 %	50 %	0 %	224984401
30	NC_012177	TA	4	8	15700	15707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012177	AT	3	6	16294	16299	50 %	50 %	0 %	0 %	224984402
32	NC_012177	AT	3	6	17687	17692	50 %	50 %	0 %	0 %	224984404
33	NC_012177	TA	3	6	17758	17763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012177	AT	3	6	17867	17872	50 %	50 %	0 %	0 %	224984405
35	NC_012177	AG	3	6	18325	18330	50 %	0 %	50 %	0 %	224984405
36	NC_012177	GA	3	6	18365	18370	50 %	0 %	50 %	0 %	224984405
37	NC_012177	GA	4	8	18717	18724	50 %	0 %	50 %	0 %	224984406
38	NC_012177	AT	3	6	19364	19369	50 %	50 %	0 %	0 %	224984406
39	NC_012177	AG	4	8	19463	19470	50 %	0 %	50 %	0 %	224984406
40	NC_012177	TA	3	6	20102	20107	50 %	50 %	0 %	0 %	224984407
41	NC_012177	AT	3	6	20594	20599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012177	GA	4	8	20606	20613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012177	GA	3	6	20707	20712	50 %	0 %	50 %	0 %	224984408
44	NC_012177	AG	3	6	20773	20778	50 %	0 %	50 %	0 %	224984408
45	NC_012177	AT	3	6	20870	20875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012177	TG	3	6	20906	20911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012177	AT	3	6	20988	20993	50 %	50 %	0 %	0 %	224984409
48	NC_012177	AG	4	8	21112	21119	50 %	0 %	50 %	0 %	224984409
49	NC_012177	AG	3	6	21489	21494	50 %	0 %	50 %	0 %	224984409
50	NC_012177	AT	3	6	21942	21947	50 %	50 %	0 %	0 %	224984410
51	NC_012177	AT	3	6	22747	22752	50 %	50 %	0 %	0 %	224984410
52	NC_012177	TA	3	6	23585	23590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012177	TC	3	6	23591	23596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012177	AG	3	6	25262	25267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012177	CT	3	6	25272	25277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012177	GA	4	8	26699	26706	50 %	0 %	50 %	0 %	224984414
57	NC_012177	TA	3	6	26726	26731	50 %	50 %	0 %	0 %	224984414
58	NC_012177	AG	3	6	28220	28225	50 %	0 %	50 %	0 %	224984417
59	NC_012177	GA	3	6	28683	28688	50 %	0 %	50 %	0 %	224984417
60	NC_012177	GA	3	6	29948	29953	50 %	0 %	50 %	0 %	224984420
61	NC_012177	GA	3	6	31878	31883	50 %	0 %	50 %	0 %	224984423
62	NC_012177	GA	3	6	32556	32561	50 %	0 %	50 %	0 %	224984424
63	NC_012177	AG	3	6	33784	33789	50 %	0 %	50 %	0 %	224984426
64	NC_012177	GA	3	6	33840	33845	50 %	0 %	50 %	0 %	224984426
65	NC_012177	GA	3	6	34003	34008	50 %	0 %	50 %	0 %	224984426
66	NC_012177	GT	3	6	34195	34200	0 %	50 %	50 %	0 %	224984426
67	NC_012177	AT	3	6	34237	34242	50 %	50 %	0 %	0 %	224984426
68	NC_012177	TC	3	6	34540	34545	0 %	50 %	0 %	50 %	224984427
69	NC_012177	GT	3	6	34686	34691	0 %	50 %	50 %	0 %	224984427
70	NC_012177	GA	3	6	36185	36190	50 %	0 %	50 %	0 %	224984429
71	NC_012177	AG	3	6	36256	36261	50 %	0 %	50 %	0 %	224984429
72	NC_012177	AG	3	6	36734	36739	50 %	0 %	50 %	0 %	224984429
73	NC_012177	GT	3	6	36844	36849	0 %	50 %	50 %	0 %	224984430
74	NC_012177	AT	3	6	36976	36981	50 %	50 %	0 %	0 %	224984430
75	NC_012177	GC	3	6	37363	37368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012177	TA	3	6	37587	37592	50 %	50 %	0 %	0 %	224984431
77	NC_012177	AT	3	6	38728	38733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012177	AT	3	6	39000	39005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012177	AT	3	6	39008	39013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012177	TA	3	6	39346	39351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012177	AT	3	6	39399	39404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012177	AT	3	6	39411	39416	50 %	50 %	0 %	0 %	224984433
83	NC_012177	TA	3	6	40463	40468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012177	CT	3	6	40486	40491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012177	GT	3	6	40512	40517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012177	TA	3	6	41130	41135	50 %	50 %	0 %	0 %	224984434
87	NC_012177	TA	4	8	41288	41295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012177	TC	3	6	41684	41689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012177	CT	3	6	42802	42807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012177	GT	3	6	43095	43100	0 %	50 %	50 %	0 %	224984437
91	NC_012177	CT	3	6	43821	43826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012177	TA	3	6	45986	45991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012177	AT	3	6	46552	46557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012177	GT	3	6	47652	47657	0 %	50 %	50 %	0 %	224984443
95	NC_012177	TC	3	6	48043	48048	0 %	50 %	0 %	50 %	224984443
96	NC_012177	TA	3	6	50476	50481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012177	AT	4	8	51914	51921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012177	TA	3	6	51968	51973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012177	AG	3	6	52263	52268	50 %	0 %	50 %	0 %	224984448
100	NC_012177	TA	3	6	52792	52797	50 %	50 %	0 %	0 %	224984448
101	NC_012177	TA	3	6	52811	52816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012177	TA	3	6	53512	53517	50 %	50 %	0 %	0 %	224984450

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.