MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 1504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	A	6	6	1	6	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012177	CCTAA	2	10	18	27	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012177	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012177	TAAA	2	8	65	72	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012177	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012177	AGA	2	6	108	113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012177	ATAAA	2	10	138	147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012177	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012177	CAA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012177	AAT	2	6	219	224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012177	A	7	7	229	235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012177	CAA	2	6	257	262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012177	ATT	2	6	266	271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012177	TTAA	2	8	277	284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012177	AT	3	6	336	341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012177	TAAT	2	8	364	371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012177	G	7	7	374	380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012177	TAC	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012177	AATT	2	8	533	540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012177	AATT	2	8	549	556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012177	TTA	2	6	584	589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012177	AG	3	6	629	634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012177	A	6	6	646	651	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
24	NC_012177	ATATTA	2	12	658	669	50 %	50 %	0 %	0 %	224984382
25	NC_012177	TAA	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984382
26	NC_012177	A	8	8	763	770	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
27	NC_012177	ATTT	2	8	794	801	25 %	75 %	0 %	0 %	224984382
28	NC_012177	TGG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984382
29	NC_012177	ATT	2	6	901	906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
30	NC_012177	TAGGAG	2	12	947	958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	224984382
31	NC_012177	TTA	2	6	992	997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
32	NC_012177	A	7	7	1036	1042	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
33	NC_012177	TTA	2	6	1122	1127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
34	NC_012177	TTA	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012177	A	8	8	1138	1145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012177	AAT	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012177	T	6	6	1159	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012177	CT	3	6	1218	1223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012177	A	6	6	1274	1279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012177	TAA	3	9	1365	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012177	TTA	3	9	1424	1432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012177	ACT	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012177	A	7	7	1463	1469	100 %	0 %	0 %	0 %	224984383
44	NC_012177	ATT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984383
45	NC_012177	A	8	8	1513	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	224984383
46	NC_012177	TAA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
47	NC_012177	AAT	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
48	NC_012177	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
49	NC_012177	AAATC	2	10	1577	1586	60 %	20 %	0 %	20 %	224984383
50	NC_012177	TGA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
51	NC_012177	GAATT	2	10	1602	1611	40 %	40 %	20 %	0 %	224984383
52	NC_012177	ACA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984383
53	NC_012177	TAA	2	6	1638	1643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
54	NC_012177	AAATT	2	10	1646	1655	60 %	40 %	0 %	0 %	224984383
55	NC_012177	ATG	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
56	NC_012177	TTA	2	6	1697	1702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984383
57	NC_012177	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
58	NC_012177	AGA	2	6	1771	1776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
59	NC_012177	AGA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
60	NC_012177	AAAAGA	2	12	1858	1869	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984383
61	NC_012177	TAA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
62	NC_012177	TA	3	6	1972	1977	50 %	50 %	0 %	0 %	224984383
63	NC_012177	ATTA	2	8	1994	2001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012177	ACT	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012177	CTT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984384
66	NC_012177	TTTTA	2	10	2122	2131	20 %	80 %	0 %	0 %	224984384
67	NC_012177	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
68	NC_012177	T	7	7	2148	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
69	NC_012177	T	6	6	2200	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
70	NC_012177	ACT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
71	NC_012177	TCC	2	6	2374	2379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984384
72	NC_012177	CTC	3	9	2385	2393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984384
73	NC_012177	TCA	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
74	NC_012177	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
75	NC_012177	GCATA	2	10	2496	2505	40 %	20 %	20 %	20 %	224984384
76	NC_012177	ATTT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	224984384
77	NC_012177	T	8	8	2803	2810	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
78	NC_012177	CCTAG	2	10	2813	2822	20 %	20 %	20 %	40 %	224984384
79	NC_012177	ACT	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
80	NC_012177	CT	3	6	2849	2854	0 %	50 %	0 %	50 %	224984384
81	NC_012177	ATT	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
82	NC_012177	CAA	2	6	2885	2890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984384
83	NC_012177	CAA	2	6	2904	2909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984384
84	NC_012177	TA	3	6	2953	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012177	ATTAT	2	10	2974	2983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012177	A	7	7	3009	3015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012177	T	6	6	3047	3052	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
88	NC_012177	TA	3	6	3074	3079	50 %	50 %	0 %	0 %	224984385
89	NC_012177	T	6	6	3089	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
90	NC_012177	TAA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
91	NC_012177	AATC	2	8	3158	3165	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
92	NC_012177	TTC	2	6	3166	3171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
93	NC_012177	ATTT	2	8	3211	3218	25 %	75 %	0 %	0 %	224984385
94	NC_012177	CAT	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
95	NC_012177	T	6	6	3314	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
96	NC_012177	ATC	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
97	NC_012177	TCT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
98	NC_012177	AAG	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
99	NC_012177	ACT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
100	NC_012177	TTG	2	6	3500	3505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984385
101	NC_012177	T	6	6	3514	3519	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
102	NC_012177	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984385
103	NC_012177	CCG	2	6	3549	3554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224984385
104	NC_012177	TAAA	2	8	3569	3576	75 %	25 %	0 %	0 %	224984385
105	NC_012177	TTG	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984385
106	NC_012177	TCT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
107	NC_012177	AAT	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
108	NC_012177	TCAA	2	8	3645	3652	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
109	NC_012177	AGA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
110	NC_012177	ATCA	2	8	3707	3714	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
111	NC_012177	TCA	2	6	3762	3767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
112	NC_012177	CCA	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984385
113	NC_012177	TCA	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
114	NC_012177	CAT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
115	NC_012177	ATC	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
116	NC_012177	TTA	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984385
117	NC_012177	T	8	8	4154	4161	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
118	NC_012177	TCT	3	9	4209	4217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
119	NC_012177	AAG	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
120	NC_012177	TAA	2	6	4255	4260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
121	NC_012177	TAAA	2	8	4317	4324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012177	TA	3	6	4338	4343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012177	ATGT	2	8	4350	4357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012177	TAA	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012177	AAAG	2	8	4419	4426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012177	CAA	2	6	4428	4433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012177	AT	3	6	4438	4443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012177	ACA	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012177	CTT	2	6	4484	4489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012177	AGA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012177	A	6	6	4521	4526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012177	CAT	2	6	4545	4550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
133	NC_012177	T	6	6	4553	4558	0 %	100 %	0 %	0 %	224984386
134	NC_012177	TAG	3	9	4587	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984386
135	NC_012177	TGC	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984386
136	NC_012177	CAT	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
137	NC_012177	AAC	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984386
138	NC_012177	AGCA	2	8	4735	4742	50 %	0 %	25 %	25 %	224984386
139	NC_012177	TTTTA	2	10	4747	4756	20 %	80 %	0 %	0 %	224984386
140	NC_012177	ATTTAA	2	12	4762	4773	50 %	50 %	0 %	0 %	224984386
141	NC_012177	ACT	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
142	NC_012177	A	6	6	4822	4827	100 %	0 %	0 %	0 %	224984386
143	NC_012177	CTT	2	6	4833	4838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984386
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