MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	AAG	2	6	81	86	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012169	AGA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012169	ATT	2	6	145	150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012169	ACT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012169	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012169	ATG	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012169	TAT	2	6	256	261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012169	CTT	2	6	468	473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012169	TTA	2	6	508	513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012169	TTA	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012169	ATA	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012169	AAT	2	6	836	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012169	GAT	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012169	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012169	TAT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
16	NC_012169	CAA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796535
17	NC_012169	TTA	2	6	1017	1022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
18	NC_012169	CTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796535
19	NC_012169	ATT	2	6	1297	1302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
20	NC_012169	TAA	2	6	1408	1413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
21	NC_012169	TCA	2	6	1445	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796535
22	NC_012169	TAA	3	9	1455	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
23	NC_012169	ACA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796533
24	NC_012169	TAA	2	6	1824	1829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796533
25	NC_012169	AAC	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796533
26	NC_012169	TTC	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796533
27	NC_012169	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796533
28	NC_012169	ATT	2	6	2041	2046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796533
29	NC_012169	AGG	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796533
30	NC_012169	TCA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
31	NC_012169	AGG	2	6	2371	2376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796545
32	NC_012169	AGA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
33	NC_012169	ATA	2	6	2495	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
34	NC_012169	CAA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796545
35	NC_012169	AAT	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
36	NC_012169	ATC	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
37	NC_012169	CAG	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796545
38	NC_012169	CTT	2	6	2664	2669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796545
39	NC_012169	TTA	2	6	2696	2701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
40	NC_012169	CCT	2	6	2705	2710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796545
41	NC_012169	TGC	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796545
42	NC_012169	AAT	2	6	2796	2801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
43	NC_012169	TTA	2	6	2864	2869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
44	NC_012169	TAT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
45	NC_012169	CTG	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796545
46	NC_012169	TCA	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
47	NC_012169	AGA	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
48	NC_012169	AGA	2	6	3229	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
49	NC_012169	TCT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796545
50	NC_012169	CCT	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796545
51	NC_012169	AGA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
52	NC_012169	ATA	2	6	3420	3425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
53	NC_012169	ATA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
54	NC_012169	GAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796543
55	NC_012169	ATA	2	6	3789	3794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
56	NC_012169	GAA	2	6	3817	3822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796543
57	NC_012169	TTA	2	6	3859	3864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
58	NC_012169	TTA	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
59	NC_012169	CAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796543
60	NC_012169	ATA	2	6	4066	4071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
61	NC_012169	AGT	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796543
62	NC_012169	ACT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
63	NC_012169	ATC	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
64	NC_012169	AAC	2	6	4287	4292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796543
65	NC_012169	TAT	2	6	4331	4336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
66	NC_012169	TCA	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
67	NC_012169	ATA	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
68	NC_012169	ATT	2	6	4596	4601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
69	NC_012169	AGC	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
70	NC_012169	TGA	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796542
71	NC_012169	AAT	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
72	NC_012169	AGA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796542
73	NC_012169	ATT	2	6	4941	4946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
74	NC_012169	ATT	2	6	4989	4994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
75	NC_012169	TCC	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796542
76	NC_012169	CAG	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
77	NC_012169	ATA	2	6	5112	5117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
78	NC_012169	AAG	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796542
79	NC_012169	CCA	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796542
80	NC_012169	CAT	5	15	5240	5254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796542
81	NC_012169	AGC	2	6	5292	5297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
82	NC_012169	TAA	2	6	5361	5366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
83	NC_012169	AAT	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
84	NC_012169	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
85	NC_012169	ATT	2	6	5545	5550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012169	ATT	2	6	5594	5599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012169	AAG	2	6	5674	5679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012169	CCT	2	6	5752	5757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012169	TGT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012169	TAA	2	6	5782	5787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012169	AAC	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012169	ACA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012169	ACC	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_012169	TAA	2	6	5908	5913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012169	AAT	2	6	6035	6040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
96	NC_012169	CAA	2	6	6087	6092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796538
97	NC_012169	TCA	2	6	6098	6103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796538
98	NC_012169	ATC	2	6	6229	6234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796538
99	NC_012169	CAC	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796538
100	NC_012169	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
101	NC_012169	AAT	2	6	6468	6473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
102	NC_012169	TAA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
103	NC_012169	ATA	2	6	6598	6603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
104	NC_012169	TAA	2	6	6746	6751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
105	NC_012169	ATA	2	6	6799	6804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796538
106	NC_012169	ATT	2	6	6880	6885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796538
107	NC_012169	ATT	2	6	6938	6943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796538
108	NC_012169	TTC	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012169	ATT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796537
110	NC_012169	ATA	2	6	7266	7271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
111	NC_012169	TAT	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796537
112	NC_012169	CCA	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796537
113	NC_012169	TAG	3	9	7449	7457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796537
114	NC_012169	ATA	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
115	NC_012169	TTC	2	6	7602	7607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796537
116	NC_012169	ATA	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
117	NC_012169	TAA	2	6	7682	7687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
118	NC_012169	AAT	2	6	7733	7738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
119	NC_012169	CTT	2	6	7746	7751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796537
120	NC_012169	AAG	2	6	7760	7765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796537
121	NC_012169	TAA	2	6	7796	7801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
122	NC_012169	TCA	2	6	7861	7866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796537
123	NC_012169	TAC	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796537
124	NC_012169	GCT	2	6	7907	7912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796537
125	NC_012169	ATA	3	9	7918	7926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
126	NC_012169	TAT	2	6	7947	7952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796537
127	NC_012169	TAA	2	6	7953	7958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796537
128	NC_012169	ACA	2	6	7967	7972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796537
129	NC_012169	ATT	2	6	8068	8073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796544
130	NC_012169	GAT	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796544
131	NC_012169	CAA	2	6	8136	8141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796544
132	NC_012169	TAA	2	6	8172	8177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796544
133	NC_012169	CTT	2	6	8182	8187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796544
134	NC_012169	CAA	2	6	8268	8273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796544
135	NC_012169	TCT	2	6	8345	8350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796544
136	NC_012169	AAT	2	6	8365	8370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796544
137	NC_012169	TAC	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796544
138	NC_012169	ATT	2	6	8527	8532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796544
139	NC_012169	AAC	2	6	8605	8610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796544
140	NC_012169	ATA	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796544
141	NC_012169	ATT	2	6	8735	8740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796544
142	NC_012169	TAA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
143	NC_012169	GAA	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796530
144	NC_012169	ATA	2	6	8846	8851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
145	NC_012169	TAA	2	6	8860	8865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796530
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147	NC_012169	ATC	2	6	9102	9107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
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149	NC_012169	ATT	2	6	9138	9143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796530
150	NC_012169	TTA	2	6	9144	9149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796530
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157	NC_012169	ATT	2	6	9737	9742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796530
158	NC_012169	ACT	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
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160	NC_012169	ACT	2	6	9873	9878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
161	NC_012169	CAT	2	6	9902	9907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
162	NC_012169	CAT	2	6	9953	9958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796530
163	NC_012169	TCT	2	6	9986	9991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796531
164	NC_012169	TTC	2	6	10016	10021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796531
165	NC_012169	AGT	2	6	10184	10189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796531
166	NC_012169	TTA	2	6	10296	10301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796531
167	NC_012169	TTC	2	6	10369	10374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796534
168	NC_012169	TTA	2	6	10462	10467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796534
169	NC_012169	TTC	2	6	10530	10535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796534
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173	NC_012169	AAG	2	6	10781	10786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796534
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176	NC_012169	AAT	2	6	10895	10900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796534
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179	NC_012169	TTC	2	6	11031	11036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796534
180	NC_012169	CAT	2	6	11060	11065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796534
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188	NC_012169	TTA	2	6	11837	11842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796536
189	NC_012169	AAT	2	6	11850	11855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796536
190	NC_012169	ATT	2	6	11869	11874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796536
191	NC_012169	ACC	2	6	11973	11978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
192	NC_012169	TAA	2	6	12056	12061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_012169	TTA	2	6	12068	12073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012169	AGA	2	6	12240	12245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796529
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208	NC_012169	TAA	2	6	13153	13158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_012169	ATT	2	6	13178	13183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_012169	ATA	2	6	13359	13364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_012169	TTA	6	18	16004	16021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796546
241	NC_012169	TAA	2	6	16169	16174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796546
242	NC_012169	TAA	2	6	16208	16213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796546
243	NC_012169	GTT	2	6	16217	16222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224796546
244	NC_012169	ATA	2	6	16315	16320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796546
245	NC_012169	ATA	2	6	16522	16527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_012169	GCA	2	6	16622	16627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796540
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249	NC_012169	CAG	2	6	16698	16703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796540
250	NC_012169	CAA	2	6	16707	16712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796540
251	NC_012169	TAT	2	6	16720	16725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796540
252	NC_012169	CAG	3	9	16750	16758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
253	NC_012169	CAG	2	6	16777	16782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
254	NC_012169	ACC	3	9	16787	16795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796532
255	NC_012169	AAC	2	6	16809	16814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
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257	NC_012169	ACC	2	6	16883	16888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796532
258	NC_012169	CAG	2	6	16897	16902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
259	NC_012169	CAA	2	6	16906	16911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796532
260	NC_012169	CTC	2	6	16946	16951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796532
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262	NC_012169	CAG	3	9	16996	17004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796532
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.