MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012133	T	6	6	137	142	0 %	100 %	0 %	0 %	224586581
3	NC_012133	T	6	6	562	567	0 %	100 %	0 %	0 %	224586581
4	NC_012133	A	6	6	588	593	100 %	0 %	0 %	0 %	224586581
5	NC_012133	T	6	6	631	636	0 %	100 %	0 %	0 %	224586581
6	NC_012133	T	6	6	754	759	0 %	100 %	0 %	0 %	224586581
7	NC_012133	A	7	7	1294	1300	100 %	0 %	0 %	0 %	224586581
8	NC_012133	A	6	6	1307	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	224586601
9	NC_012133	A	8	8	1325	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	224586601
10	NC_012133	A	6	6	1800	1805	100 %	0 %	0 %	0 %	224586601
11	NC_012133	A	6	6	2055	2060	100 %	0 %	0 %	0 %	224586606
12	NC_012133	T	6	6	2149	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	224586606
13	NC_012133	A	6	6	2775	2780	100 %	0 %	0 %	0 %	224586592
14	NC_012133	A	6	6	2846	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	224586592
15	NC_012133	A	7	7	3333	3339	100 %	0 %	0 %	0 %	224586592
16	NC_012133	A	7	7	3428	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	224586577
17	NC_012133	A	6	6	4116	4121	100 %	0 %	0 %	0 %	224586597
18	NC_012133	A	6	6	4420	4425	100 %	0 %	0 %	0 %	224586597
19	NC_012133	A	6	6	4518	4523	100 %	0 %	0 %	0 %	224586597
20	NC_012133	A	6	6	4530	4535	100 %	0 %	0 %	0 %	224586597
21	NC_012133	A	7	7	5245	5251	100 %	0 %	0 %	0 %	224586600
22	NC_012133	A	7	7	6092	6098	100 %	0 %	0 %	0 %	224586583
23	NC_012133	T	6	6	6974	6979	0 %	100 %	0 %	0 %	224586611
24	NC_012133	T	7	7	7172	7178	0 %	100 %	0 %	0 %	224586611
25	NC_012133	A	6	6	7529	7534	100 %	0 %	0 %	0 %	224586611
26	NC_012133	A	6	6	7852	7857	100 %	0 %	0 %	0 %	224586610
27	NC_012133	A	6	6	8260	8265	100 %	0 %	0 %	0 %	224586610
28	NC_012133	A	7	7	8601	8607	100 %	0 %	0 %	0 %	224586612
29	NC_012133	A	6	6	8804	8809	100 %	0 %	0 %	0 %	224586578
30	NC_012133	A	6	6	8834	8839	100 %	0 %	0 %	0 %	224586578
31	NC_012133	A	6	6	9047	9052	100 %	0 %	0 %	0 %	224586585
32	NC_012133	A	6	6	9099	9104	100 %	0 %	0 %	0 %	224586585
33	NC_012133	A	6	6	9548	9553	100 %	0 %	0 %	0 %	224586585
34	NC_012133	T	6	6	9623	9628	0 %	100 %	0 %	0 %	224586585
35	NC_012133	A	7	7	9692	9698	100 %	0 %	0 %	0 %	224586585
36	NC_012133	A	6	6	10474	10479	100 %	0 %	0 %	0 %	224586579
37	NC_012133	A	7	7	10942	10948	100 %	0 %	0 %	0 %	224586586
38	NC_012133	A	6	6	11153	11158	100 %	0 %	0 %	0 %	224586586
39	NC_012133	A	7	7	11169	11175	100 %	0 %	0 %	0 %	224586586
40	NC_012133	A	7	7	11406	11412	100 %	0 %	0 %	0 %	224586586
41	NC_012133	A	6	6	11728	11733	100 %	0 %	0 %	0 %	224586586
42	NC_012133	A	6	6	12035	12040	100 %	0 %	0 %	0 %	224586588
43	NC_012133	A	6	6	12616	12621	100 %	0 %	0 %	0 %	224586589
44	NC_012133	T	8	8	12707	12714	0 %	100 %	0 %	0 %	224586589
45	NC_012133	A	6	6	12814	12819	100 %	0 %	0 %	0 %	224586603
46	NC_012133	T	7	7	12937	12943	0 %	100 %	0 %	0 %	224586603
47	NC_012133	T	6	6	13432	13437	0 %	100 %	0 %	0 %	224586603
48	NC_012133	A	8	8	13540	13547	100 %	0 %	0 %	0 %	224586603
49	NC_012133	T	6	6	13646	13651	0 %	100 %	0 %	0 %	224586608
50	NC_012133	A	6	6	13652	13657	100 %	0 %	0 %	0 %	224586608
51	NC_012133	A	9	9	13757	13765	100 %	0 %	0 %	0 %	224586608
52	NC_012133	T	6	6	13813	13818	0 %	100 %	0 %	0 %	224586608
53	NC_012133	A	8	8	14051	14058	100 %	0 %	0 %	0 %	224586608
54	NC_012133	T	6	6	14393	14398	0 %	100 %	0 %	0 %	224586595
55	NC_012133	A	6	6	14506	14511	100 %	0 %	0 %	0 %	224586595
56	NC_012133	A	6	6	14668	14673	100 %	0 %	0 %	0 %	224586595
57	NC_012133	A	7	7	14769	14775	100 %	0 %	0 %	0 %	224586595
58	NC_012133	A	6	6	15010	15015	100 %	0 %	0 %	0 %	224586595
59	NC_012133	T	8	8	15063	15070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012133	A	6	6	15114	15119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012133	A	7	7	15135	15141	100 %	0 %	0 %	0 %	224586604
62	NC_012133	A	6	6	15322	15327	100 %	0 %	0 %	0 %	224586604
63	NC_012133	A	6	6	15562	15567	100 %	0 %	0 %	0 %	224586598
64	NC_012133	A	7	7	15601	15607	100 %	0 %	0 %	0 %	224586598
65	NC_012133	T	6	6	15792	15797	0 %	100 %	0 %	0 %	224586594
66	NC_012133	A	6	6	16240	16245	100 %	0 %	0 %	0 %	224586587
67	NC_012133	A	7	7	16301	16307	100 %	0 %	0 %	0 %	224586587
68	NC_012133	A	7	7	16364	16370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012133	T	6	6	16592	16597	0 %	100 %	0 %	0 %	224586609
70	NC_012133	T	6	6	16599	16604	0 %	100 %	0 %	0 %	224586609
71	NC_012133	T	6	6	16645	16650	0 %	100 %	0 %	0 %	224586609
72	NC_012133	T	6	6	16761	16766	0 %	100 %	0 %	0 %	224586609
73	NC_012133	T	8	8	16850	16857	0 %	100 %	0 %	0 %	224586609
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75	NC_012133	A	6	6	17416	17421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012133	T	8	8	17435	17442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012133	A	6	6	17445	17450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012133	T	6	6	17451	17456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012133	A	6	6	17459	17464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012133	A	7	7	17628	17634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83	NC_012133	A	6	6	17877	17882	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
84	NC_012133	A	7	7	18072	18078	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
85	NC_012133	A	6	6	18088	18093	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
86	NC_012133	A	8	8	18112	18119	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
87	NC_012133	A	6	6	18133	18138	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
88	NC_012133	A	7	7	18269	18275	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
89	NC_012133	A	7	7	18371	18377	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
90	NC_012133	A	8	8	18455	18462	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
91	NC_012133	A	7	7	18490	18496	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
92	NC_012133	A	6	6	18532	18537	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
93	NC_012133	A	6	6	18639	18644	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
94	NC_012133	A	7	7	18655	18661	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
95	NC_012133	A	6	6	18710	18715	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
96	NC_012133	A	6	6	18786	18791	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
97	NC_012133	A	8	8	18841	18848	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
98	NC_012133	A	7	7	18860	18866	100 %	0 %	0 %	0 %	224586584
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103	NC_012133	A	7	7	19198	19204	100 %	0 %	0 %	0 %	224586607
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105	NC_012133	A	6	6	19260	19265	100 %	0 %	0 %	0 %	224586607
106	NC_012133	T	6	6	19273	19278	0 %	100 %	0 %	0 %	224586607
107	NC_012133	A	6	6	19308	19313	100 %	0 %	0 %	0 %	224586607
108	NC_012133	A	6	6	19315	19320	100 %	0 %	0 %	0 %	224586607
109	NC_012133	A	7	7	19394	19400	100 %	0 %	0 %	0 %	224586607
110	NC_012133	A	6	6	19436	19441	100 %	0 %	0 %	0 %	224586607
111	NC_012133	A	7	7	19586	19592	100 %	0 %	0 %	0 %	224586593
112	NC_012133	A	7	7	20075	20081	100 %	0 %	0 %	0 %	224586593
113	NC_012133	A	8	8	20281	20288	100 %	0 %	0 %	0 %	224586582
114	NC_012133	A	6	6	20330	20335	100 %	0 %	0 %	0 %	224586582
115	NC_012133	A	6	6	20354	20359	100 %	0 %	0 %	0 %	224586582
116	NC_012133	T	6	6	20365	20370	0 %	100 %	0 %	0 %	224586582
117	NC_012133	A	6	6	20610	20615	100 %	0 %	0 %	0 %	224586582
118	NC_012133	A	6	6	20840	20845	100 %	0 %	0 %	0 %	224586580
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120	NC_012133	A	7	7	21037	21043	100 %	0 %	0 %	0 %	224586580
121	NC_012133	A	7	7	21070	21076	100 %	0 %	0 %	0 %	224586580
122	NC_012133	A	7	7	21103	21109	100 %	0 %	0 %	0 %	224586580
123	NC_012133	A	7	7	21157	21163	100 %	0 %	0 %	0 %	224586580
124	NC_012133	A	6	6	21209	21214	100 %	0 %	0 %	0 %	224586580
125	NC_012133	T	6	6	21489	21494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012133	T	7	7	21514	21520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012133	A	7	7	21569	21575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012133	T	9	9	21650	21658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012133	A	6	6	21661	21666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012133	T	6	6	21667	21672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012133	A	6	6	21675	21680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012133	T	6	6	21695	21700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012133	A	6	6	21866	21871	100 %	0 %	0 %	0 %	224586596
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135	NC_012133	A	7	7	22219	22225	100 %	0 %	0 %	0 %	224586596
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138	NC_012133	T	7	7	22779	22785	0 %	100 %	0 %	0 %	224586596
139	NC_012133	A	7	7	23084	23090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_012133	T	6	6	23822	23827	0 %	100 %	0 %	0 %	224586591
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.