MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	TATTTA	2	12	698	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586490
2	NC_012131	TTCATT	2	12	815	826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224586490
3	NC_012131	TTAAAT	2	12	4711	4722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012131	ACTTAA	2	12	5664	5675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224586494
5	NC_012131	TTACTT	2	12	6536	6547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012131	TAAAAA	2	12	6707	6718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224586497
7	NC_012131	AATTTT	2	12	7982	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012131	CAACTC	2	12	8173	8184	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012131	ATTTAA	2	12	12213	12224	50 %	50 %	0 %	0 %	224586508
10	NC_012131	ATAAGT	2	12	13259	13270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224586510
11	NC_012131	TATCAT	2	12	14494	14505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224586512
12	NC_012131	TAATGA	2	12	16098	16109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224586514
13	NC_012131	ATACTT	2	12	17331	17342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224586517
14	NC_012131	TATTAA	2	12	17715	17726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012131	AATTTA	2	12	18381	18392	50 %	50 %	0 %	0 %	224586518
16	NC_012131	ATTTTT	2	12	21359	21370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012131	ACTAAA	2	12	22854	22865	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012131	AAGTAA	2	12	24096	24107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012131	GGAGTA	2	12	24483	24494	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012131	AAGCTA	2	12	25603	25614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	224586531
21	NC_012131	TAAGAA	2	12	27353	27364	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.