MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-2-7

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012131	AAAT	2	8	1510	1517	75 %	25 %	0 %	0 %	224586490
2	NC_012131	TATT	2	8	1635	1642	25 %	75 %	0 %	0 %	224586490
3	NC_012131	TTTC	2	8	1903	1910	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
4	NC_012131	CTTT	2	8	2379	2386	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
5	NC_012131	CTTT	2	8	3228	3235	0 %	75 %	0 %	25 %	224586490
6	NC_012131	GCAA	2	8	3366	3373	50 %	0 %	25 %	25 %	224586490
7	NC_012131	ATTT	2	8	3454	3461	25 %	75 %	0 %	0 %	224586490
8	NC_012131	ACAA	2	8	4889	4896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012131	TTAC	2	8	5030	5037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012131	ACTT	2	8	5310	5317	25 %	50 %	0 %	25 %	224586493
11	NC_012131	TATT	2	8	5594	5601	25 %	75 %	0 %	0 %	224586494
12	NC_012131	AAAC	2	8	6798	6805	75 %	0 %	0 %	25 %	224586497
13	NC_012131	CTGG	2	8	6817	6824	0 %	25 %	50 %	25 %	224586497
14	NC_012131	AAAT	2	8	7172	7179	75 %	25 %	0 %	0 %	224586497
15	NC_012131	TATT	2	8	7201	7208	25 %	75 %	0 %	0 %	224586497
16	NC_012131	CAAA	2	8	7309	7316	75 %	0 %	0 %	25 %	224586497
17	NC_012131	ATCT	2	8	7879	7886	25 %	50 %	0 %	25 %	224586498
18	NC_012131	ATTA	2	8	7949	7956	50 %	50 %	0 %	0 %	224586498
19	NC_012131	GTTT	2	8	8862	8869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012131	CTTA	2	8	8947	8954	25 %	50 %	0 %	25 %	224586502
21	NC_012131	ATTT	2	8	9228	9235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012131	ATCT	2	8	9511	9518	25 %	50 %	0 %	25 %	224586503
23	NC_012131	CTAT	2	8	9530	9537	25 %	50 %	0 %	25 %	224586503
24	NC_012131	CTAT	2	8	9563	9570	25 %	50 %	0 %	25 %	224586503
25	NC_012131	CTAT	2	8	9596	9603	25 %	50 %	0 %	25 %	224586503
26	NC_012131	ATTA	2	8	9649	9656	50 %	50 %	0 %	0 %	224586503
27	NC_012131	CTTT	2	8	9947	9954	0 %	75 %	0 %	25 %	224586504
28	NC_012131	TAAA	2	8	10464	10471	75 %	25 %	0 %	0 %	224586505
29	NC_012131	ATTC	2	8	11241	11248	25 %	50 %	0 %	25 %	224586506
30	NC_012131	TTCT	2	8	11471	11478	0 %	75 %	0 %	25 %	224586506
31	NC_012131	ATCT	2	8	11606	11613	25 %	50 %	0 %	25 %	224586507
32	NC_012131	TTTC	2	8	12092	12099	0 %	75 %	0 %	25 %	224586508
33	NC_012131	ATTT	2	8	12101	12108	25 %	75 %	0 %	0 %	224586508
34	NC_012131	TTTC	2	8	12307	12314	0 %	75 %	0 %	25 %	224586508
35	NC_012131	AATT	2	8	12711	12718	50 %	50 %	0 %	0 %	224586508
36	NC_012131	GTTT	2	8	12728	12735	0 %	75 %	25 %	0 %	224586508
37	NC_012131	ACCT	2	8	12979	12986	25 %	25 %	0 %	50 %	224586509
38	NC_012131	GAAA	2	8	14925	14932	75 %	0 %	25 %	0 %	224586513
39	NC_012131	AAAC	2	8	15037	15044	75 %	0 %	0 %	25 %	224586513
40	NC_012131	AAAC	2	8	15076	15083	75 %	0 %	0 %	25 %	224586513
41	NC_012131	TTGG	2	8	15103	15110	0 %	50 %	50 %	0 %	224586513
42	NC_012131	AGAT	2	8	15182	15189	50 %	25 %	25 %	0 %	224586513
43	NC_012131	TAAT	2	8	15219	15226	50 %	50 %	0 %	0 %	224586513
44	NC_012131	TAAT	2	8	15318	15325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012131	GATT	2	8	15614	15621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012131	AGAT	2	8	15646	15653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012131	ATAG	2	8	15681	15688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012131	ATCT	2	8	16874	16881	25 %	50 %	0 %	25 %	224586516
49	NC_012131	AGGT	2	8	17616	17623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012131	AAAC	2	8	17876	17883	75 %	0 %	0 %	25 %	224586518
51	NC_012131	AATT	2	8	17893	17900	50 %	50 %	0 %	0 %	224586518
52	NC_012131	GAAA	2	8	18509	18516	75 %	0 %	25 %	0 %	224586518
53	NC_012131	AGAT	2	8	18995	19002	50 %	25 %	25 %	0 %	224586519
54	NC_012131	GAAT	2	8	19360	19367	50 %	25 %	25 %	0 %	224586519
55	NC_012131	ATTT	2	8	20136	20143	25 %	75 %	0 %	0 %	224586520
56	NC_012131	TAAA	2	8	20238	20245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012131	AAAG	2	8	20654	20661	75 %	0 %	25 %	0 %	224586521
58	NC_012131	TAAT	2	8	20952	20959	50 %	50 %	0 %	0 %	224586522
59	NC_012131	ATAG	2	8	21005	21012	50 %	25 %	25 %	0 %	224586522
60	NC_012131	ATAG	2	8	21038	21045	50 %	25 %	25 %	0 %	224586522
61	NC_012131	ATAG	2	8	21071	21078	50 %	25 %	25 %	0 %	224586522
62	NC_012131	AGAT	2	8	21090	21097	50 %	25 %	25 %	0 %	224586522
63	NC_012131	AATA	2	8	21224	21231	75 %	25 %	0 %	0 %	224586522
64	NC_012131	AAAT	2	8	21373	21380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012131	TAAG	2	8	21654	21661	50 %	25 %	25 %	0 %	224586523
66	NC_012131	AAAC	2	8	21739	21746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012131	TAAT	2	8	22682	22689	50 %	50 %	0 %	0 %	224586527
68	NC_012131	AGAT	2	8	22752	22759	50 %	25 %	25 %	0 %	224586527
69	NC_012131	TGGC	2	8	23414	23421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012131	AAAT	3	12	23433	23444	75 %	25 %	0 %	0 %	224586529
71	NC_012131	ATTT	2	8	23463	23470	25 %	75 %	0 %	0 %	224586529
72	NC_012131	ATTA	2	8	24419	24426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012131	TTGT	2	8	25219	25226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012131	ATTA	2	8	25241	25248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012131	TAAG	2	8	25356	25363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012131	TAAA	2	8	25753	25760	75 %	25 %	0 %	0 %	224586531
77	NC_012131	CAAA	2	8	25946	25953	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012131	AATT	2	8	26035	26042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012131	TTAC	2	8	26189	26196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012131	TGAT	2	8	26349	26356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012131	TTAC	2	8	27101	27108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012131	AAAG	2	8	27253	27260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.