MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus Q1 plasmid pBc239

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011973	TTTCAC	2	12	395	406	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	221642091
2	NC_011973	ACGATT	2	12	5546	5557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221642098
3	NC_011973	TATATG	2	12	18214	18225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011973	TAAAAT	2	12	20096	20107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221642112
5	NC_011973	TGCAGC	2	12	23993	24004	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011973	TGATAT	2	12	24618	24629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	221642117
7	NC_011973	AATTTT	2	12	30125	30136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221642122
8	NC_011973	TTTAAA	2	12	32037	32048	50 %	50 %	0 %	0 %	221642123
9	NC_011973	ATAAAA	2	12	32384	32395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	221642124
10	NC_011973	ACCCCA	2	12	33938	33949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221642125
11	NC_011973	TTTCCA	2	12	37132	37143	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	221642129
12	NC_011973	TTTAAT	2	12	37351	37362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011973	AAATAT	2	12	38431	38442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011973	ATGGAA	2	12	38810	38821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	221642131
15	NC_011973	TAGTGC	2	12	42916	42927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221642136
16	NC_011973	GATGTA	2	12	43013	43024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221642136
17	NC_011973	AAGAAA	2	12	46801	46812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	221642140
18	NC_011973	ATGATA	2	12	47936	47947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011973	ACTTGG	2	12	49325	49336	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221642142
20	NC_011973	GGAATG	2	12	55702	55713	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	221642147
21	NC_011973	TTAAAT	2	12	57238	57249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011973	ATGCCC	2	12	58250	58261	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221642149
23	NC_011973	AAAAGA	2	12	60499	60510	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	221642153
24	NC_011973	ATATAA	2	12	63788	63799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011973	AACAAA	2	12	64750	64761	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011973	TACTAT	2	12	65213	65224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011973	TATTAA	2	12	67374	67385	50 %	50 %	0 %	0 %	221642158
28	NC_011973	GTCATT	2	12	70231	70242	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	221642162
29	NC_011973	GATTAC	2	12	71889	71900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221642163
30	NC_011973	GTTAAT	2	12	74898	74909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	221642164
31	NC_011973	GTTCAT	2	12	74910	74921	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	221642164
32	NC_011973	TGTAAT	2	12	76245	76256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	221642165
33	NC_011973	AGCAGT	2	12	82998	83009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221642165
34	NC_011973	TGCTAT	2	12	83058	83069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	221642165
35	NC_011973	GAAGTA	2	12	83341	83352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	221642165
36	NC_011973	TTCGGG	2	12	85834	85845	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	221642165
37	NC_011973	TACTTG	2	12	85854	85865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	221642165
38	NC_011973	GGGTTT	2	12	87415	87426	0 %	50 %	50 %	0 %	221642165
39	NC_011973	TACCTG	2	12	88400	88411	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221642165
40	NC_011973	GGATTT	2	12	88993	89004	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	221642165
41	NC_011973	AATATA	2	12	90789	90800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221642166
42	NC_011973	GCCACC	2	12	94776	94787	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011973	CTAATA	2	12	95191	95202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011973	TAACCT	2	12	96525	96536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011973	TATTTT	2	12	96654	96665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011973	TAAAGA	2	12	98225	98236	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	221642175
47	NC_011973	AAAGAA	2	12	98766	98777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	221642176
48	NC_011973	AAACAA	2	12	102856	102867	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011973	TTTTCT	2	12	104479	104490	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	221642185
50	NC_011973	ACATAT	2	12	106347	106358	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011973	TAATAC	2	12	108857	108868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	221642190
52	NC_011973	TAAAAT	2	12	108978	108989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221642190
53	NC_011973	CATTTA	2	12	110040	110051	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	221642191
54	NC_011973	CAATTA	2	12	113785	113796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	221642195
55	NC_011973	AGCGCT	2	12	114034	114045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221642195
56	NC_011973	TTATGA	2	12	119365	119376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	221642201
57	NC_011973	CTTTCC	2	12	120365	120376	0 %	50 %	0 %	50 %	221642202
58	NC_011973	CTAATG	2	12	120576	120587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011973	CAGAAC	2	12	121015	121026	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	221642203
60	NC_011973	TCCTTT	2	12	121418	121429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221642203
61	NC_011973	TTCATT	2	12	123014	123025	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	221642206
62	NC_011973	TCAATT	2	12	123033	123044	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	221642206
63	NC_011973	TTTGTT	2	12	129518	129529	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	221642211
64	NC_011973	TATCAA	2	12	130073	130084	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	221642211
65	NC_011973	CTTTAG	2	12	139561	139572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	221642220
66	NC_011973	ATGGAA	2	12	140864	140875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	221642221
67	NC_011973	CCAAAA	2	12	142982	142993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011973	TTAATT	2	12	143230	143241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011973	AAAAAT	2	12	145200	145211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011973	TATAAA	2	12	147587	147598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011973	TCCATA	2	12	148601	148612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221642229
72	NC_011973	TTTCCA	2	12	153638	153649	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	221642234
73	NC_011973	TTTAGG	2	12	154753	154764	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	221642236
74	NC_011973	TCTCAA	2	12	157037	157048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221642239
75	NC_011973	TGTTTA	2	12	157999	158010	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011973	CATATT	2	12	163743	163754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	221642246
77	NC_011973	TCTTTT	2	12	169938	169949	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	221642251
78	NC_011973	GATGGA	2	12	171007	171018	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	221642253
79	NC_011973	TAAAAC	2	12	174480	174491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	221642255
80	NC_011973	TAAGAA	2	12	180933	180944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	221642264
81	NC_011973	AAAACG	2	12	181601	181612	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	221642265
82	NC_011973	GAAAAA	2	12	182400	182411	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	221642265
83	NC_011973	CTTTTG	2	12	188483	188494	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	221642270
84	NC_011973	ATTAAG	2	12	188803	188814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	221642271
85	NC_011973	TTTTTC	2	12	190659	190670	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	221642273
86	NC_011973	GAAAAA	2	12	195663	195674	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	221642279
87	NC_011973	TTTTTC	2	12	198106	198117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	221642280
88	NC_011973	CGTTTT	2	12	198905	198916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	221642280
89	NC_011973	GAATAT	2	12	200634	200645	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011973	TCTTTA	2	12	203665	203676	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011973	CTTTTT	2	12	208941	208952	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	221642293
92	NC_011973	TCTCAT	2	12	211428	211439	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	221642294
93	NC_011973	GCATCT	2	12	212529	212540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221642295
94	NC_011973	ACCAAA	2	12	212597	212608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221642295
95	NC_011973	TGCTGT	2	12	212777	212788	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	221642295
96	NC_011973	CGAAAT	2	12	215362	215373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	221642299
97	NC_011973	TAAATA	2	12	218054	218065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011973	TTTGTT	2	12	218720	218731	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	221642301
99	NC_011973	GAATAA	2	12	220482	220493	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011973	TATCAA	2	12	221737	221748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	221642302
101	NC_011973	CTTTTT	2	12	234468	234479	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.