MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 1471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011835	ACCAC	2	10	1798	1807	40 %	0 %	0 %	60 %	219682500
2	NC_011835	CCGGC	2	10	2815	2824	0 %	0 %	40 %	60 %	219682501
3	NC_011835	CCGTT	2	10	3128	3137	0 %	40 %	20 %	40 %	219682501
4	NC_011835	AACGC	2	10	3346	3355	40 %	0 %	20 %	40 %	219682501
5	NC_011835	CGATC	2	10	5861	5870	20 %	20 %	20 %	40 %	219682504
6	NC_011835	AAGGC	2	10	7675	7684	40 %	0 %	40 %	20 %	219682504
7	NC_011835	GCACG	2	10	14451	14460	20 %	0 %	40 %	40 %	219682509
8	NC_011835	GGTGG	2	10	15096	15105	0 %	20 %	80 %	0 %	219682509
9	NC_011835	GCGAG	2	10	15828	15837	20 %	0 %	60 %	20 %	219682510
10	NC_011835	CGTGC	2	10	15975	15984	0 %	20 %	40 %	40 %	219682510
11	NC_011835	GATTG	2	10	16749	16758	20 %	40 %	40 %	0 %	219682510
12	NC_011835	TTCGA	2	10	17158	17167	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011835	ACCGA	2	10	17815	17824	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011835	TCTGT	2	10	21415	21424	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011835	CGCAC	2	10	24619	24628	20 %	0 %	20 %	60 %	219682517
16	NC_011835	CGACG	2	10	25287	25296	20 %	0 %	40 %	40 %	219682517
17	NC_011835	CGCTG	2	10	25433	25442	0 %	20 %	40 %	40 %	219682517
18	NC_011835	GCCGT	2	10	26098	26107	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011835	GGGGA	2	10	27113	27122	20 %	0 %	80 %	0 %	219682518
20	NC_011835	AGAGA	2	10	28194	28203	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011835	CGGTT	2	10	28243	28252	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011835	GAAGA	2	10	31054	31063	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011835	TTCAC	2	10	31466	31475	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011835	GGGAA	2	10	32993	33002	40 %	0 %	60 %	0 %	219682525
25	NC_011835	TTTTG	2	10	34018	34027	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011835	TGAGT	2	10	34504	34513	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011835	GATGT	2	10	35063	35072	20 %	40 %	40 %	0 %	219682526
28	NC_011835	AAATC	2	10	36038	36047	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011835	TATGC	2	10	38452	38461	20 %	40 %	20 %	20 %	219682528
30	NC_011835	AAAGC	2	10	39701	39710	60 %	0 %	20 %	20 %	219682528
31	NC_011835	CATCA	2	10	40506	40515	40 %	20 %	0 %	40 %	219682529
32	NC_011835	TGCTG	2	10	41096	41105	0 %	40 %	40 %	20 %	219682530
33	NC_011835	GAGAT	2	10	43648	43657	40 %	20 %	40 %	0 %	219682531
34	NC_011835	CAAGC	2	10	44352	44361	40 %	0 %	20 %	40 %	219682532
35	NC_011835	TTCGT	2	10	44864	44873	0 %	60 %	20 %	20 %	219682533
36	NC_011835	GATCG	2	10	45794	45803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011835	GGAAG	2	10	45954	45963	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011835	CGCCA	2	10	46462	46471	20 %	0 %	20 %	60 %	219682535
39	NC_011835	CCGAC	2	10	47696	47705	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_011835	CTCGG	2	10	48414	48423	0 %	20 %	40 %	40 %	219682536
41	NC_011835	GCCAT	2	10	49114	49123	20 %	20 %	20 %	40 %	219682536
42	NC_011835	GCCCG	2	10	49991	50000	0 %	0 %	40 %	60 %	219682536
43	NC_011835	CGGTC	2	10	52574	52583	0 %	20 %	40 %	40 %	219682538
44	NC_011835	GCACG	2	10	53375	53384	20 %	0 %	40 %	40 %	219682538
45	NC_011835	ATTCA	2	10	55395	55404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011835	TGAAT	2	10	55649	55658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011835	ATTCA	2	10	55801	55810	40 %	40 %	0 %	20 %	219682540
48	NC_011835	TCCGC	2	10	56022	56031	0 %	20 %	20 %	60 %	219682540
49	NC_011835	TGAAT	2	10	56857	56866	40 %	40 %	20 %	0 %	219682540
50	NC_011835	GGATC	2	10	57513	57522	20 %	20 %	40 %	20 %	219682540
51	NC_011835	GGGAA	2	10	64830	64839	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011835	ATCGC	2	10	66830	66839	20 %	20 %	20 %	40 %	219682550
53	NC_011835	TGGGG	2	10	67529	67538	0 %	20 %	80 %	0 %	219682551
54	NC_011835	GGCGC	2	10	70029	70038	0 %	0 %	60 %	40 %	219682552
55	NC_011835	GCTCG	2	10	73193	73202	0 %	20 %	40 %	40 %	219682554
56	NC_011835	GCTGA	2	10	75356	75365	20 %	20 %	40 %	20 %	219682556
57	NC_011835	CATCG	2	10	77156	77165	20 %	20 %	20 %	40 %	219682556
58	NC_011835	TTGTA	2	10	77567	77576	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011835	CGGTC	2	10	79764	79773	0 %	20 %	40 %	40 %	219682558
60	NC_011835	GCACG	2	10	80565	80574	20 %	0 %	40 %	40 %	219682558
61	NC_011835	CGGTG	2	10	81155	81164	0 %	20 %	60 %	20 %	219682559
62	NC_011835	TCATT	2	10	82071	82080	20 %	60 %	0 %	20 %	219682559
63	NC_011835	CCAAA	2	10	82554	82563	60 %	0 %	0 %	40 %	219682560
64	NC_011835	CCGGG	2	10	83047	83056	0 %	0 %	60 %	40 %	219682561
65	NC_011835	CGGCT	2	10	88213	88222	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_011835	CGAAC	2	10	89838	89847	40 %	0 %	20 %	40 %	219682566
67	NC_011835	GAGAA	2	10	90302	90311	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011835	GCTCG	2	10	91319	91328	0 %	20 %	40 %	40 %	219682568
69	NC_011835	ATACA	2	10	91923	91932	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011835	GGTGC	2	10	96600	96609	0 %	20 %	60 %	20 %	219682572
71	NC_011835	GTCTT	2	10	103066	103075	0 %	60 %	20 %	20 %	219682577
72	NC_011835	GCGCC	2	10	107385	107394	0 %	0 %	40 %	60 %	219682579
73	NC_011835	CGCCC	2	10	107873	107882	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
74	NC_011835	GCCGC	2	10	108341	108350	0 %	0 %	40 %	60 %	219682580
75	NC_011835	AGGAA	2	10	109136	109145	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011835	TGTTT	2	10	111890	111899	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011835	GCAAA	2	10	112318	112327	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011835	CGGCG	2	10	115488	115497	0 %	0 %	60 %	40 %	219682586
79	NC_011835	TGGCG	2	10	115512	115521	0 %	20 %	60 %	20 %	219682586
80	NC_011835	ACGGC	2	10	115604	115613	20 %	0 %	40 %	40 %	219682586
81	NC_011835	GACGA	2	10	115660	115669	40 %	0 %	40 %	20 %	219682586
82	NC_011835	CCGAG	2	10	115886	115895	20 %	0 %	40 %	40 %	219682586
83	NC_011835	CGATT	2	10	116121	116130	20 %	40 %	20 %	20 %	219682586
84	NC_011835	ACCTG	2	10	117342	117351	20 %	20 %	20 %	40 %	219682587
85	NC_011835	GCCCG	2	10	118049	118058	0 %	0 %	40 %	60 %	219682587
86	NC_011835	AGTCG	2	10	118397	118406	20 %	20 %	40 %	20 %	219682587
87	NC_011835	GTGCG	2	10	119425	119434	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011835	TGGTG	2	10	122292	122301	0 %	40 %	60 %	0 %	219682590
89	NC_011835	GTTCG	2	10	124408	124417	0 %	40 %	40 %	20 %	219682592
90	NC_011835	TCGAA	2	10	126039	126048	40 %	20 %	20 %	20 %	219682593
91	NC_011835	AGGTG	2	10	126149	126158	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011835	TGGCA	2	10	128525	128534	20 %	20 %	40 %	20 %	219682599
93	NC_011835	GCCGA	2	10	128564	128573	20 %	0 %	40 %	40 %	219682599
94	NC_011835	TCGCG	2	10	129464	129473	0 %	20 %	40 %	40 %	219682600
95	NC_011835	GCGCC	2	10	133832	133841	0 %	0 %	40 %	60 %	219682604
96	NC_011835	TGGGT	2	10	134952	134961	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011835	CGCAT	2	10	135672	135681	20 %	20 %	20 %	40 %	219682607
98	NC_011835	TGGAT	2	10	137216	137225	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011835	TGAGG	2	10	138481	138490	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011835	TGCTC	2	10	139625	139634	0 %	40 %	20 %	40 %	219682612
101	NC_011835	CGGCT	2	10	141484	141493	0 %	20 %	40 %	40 %	219682614
102	NC_011835	TCTCA	2	10	144461	144470	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_011835	ATCTC	2	10	147374	147383	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_011835	CTCGC	2	10	147639	147648	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_011835	AACAG	2	10	147793	147802	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011835	CAAGA	2	10	148080	148089	60 %	0 %	20 %	20 %	219682619
107	NC_011835	GACAA	2	10	150304	150313	60 %	0 %	20 %	20 %	219682621
108	NC_011835	CCCGA	2	10	150481	150490	20 %	0 %	20 %	60 %	219682621
109	NC_011835	ATGAG	2	10	152198	152207	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011835	CGACG	2	10	152960	152969	20 %	0 %	40 %	40 %	219682623
111	NC_011835	GCACC	2	10	156394	156403	20 %	0 %	20 %	60 %	219682625
112	NC_011835	GCTCG	2	10	157299	157308	0 %	20 %	40 %	40 %	219682626
113	NC_011835	CGGCA	2	10	157959	157968	20 %	0 %	40 %	40 %	219682626
114	NC_011835	CGACC	2	10	159028	159037	20 %	0 %	20 %	60 %	219682627
115	NC_011835	GCTCG	2	10	159348	159357	0 %	20 %	40 %	40 %	219682628
116	NC_011835	TCCCG	2	10	160481	160490	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_011835	CACCG	2	10	162042	162051	20 %	0 %	20 %	60 %	219682630
118	NC_011835	TGGCA	2	10	162684	162693	20 %	20 %	40 %	20 %	219682630
119	NC_011835	GCGAA	2	10	164318	164327	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011835	AGTGT	2	10	164815	164824	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011835	GCGCC	2	10	165285	165294	0 %	0 %	40 %	60 %	219682633
122	NC_011835	CCGCG	2	10	165969	165978	0 %	0 %	40 %	60 %	219682633
123	NC_011835	CGGCG	2	10	166976	166985	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011835	GTGCG	2	10	168113	168122	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011835	GGAGG	2	10	172098	172107	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011835	TGCCG	2	10	174452	174461	0 %	20 %	40 %	40 %	219682638
127	NC_011835	TGCCC	2	10	177222	177231	0 %	20 %	20 %	60 %	219682641
128	NC_011835	CTCAT	2	10	177825	177834	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011835	TGCGC	2	10	178234	178243	0 %	20 %	40 %	40 %	219682642
130	NC_011835	GCGTG	2	10	178847	178856	0 %	20 %	60 %	20 %	219682643
131	NC_011835	CCACG	2	10	179753	179762	20 %	0 %	20 %	60 %	219682643
132	NC_011835	TGAGG	2	10	180251	180260	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011835	GCACC	2	10	181995	182004	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_011835	CTCGC	2	10	184534	184543	0 %	20 %	20 %	60 %	219682647
135	NC_011835	CGCCA	2	10	186142	186151	20 %	0 %	20 %	60 %	219682648
136	NC_011835	CGTGG	2	10	186833	186842	0 %	20 %	60 %	20 %	219682648
137	NC_011835	TCGCC	2	10	188874	188883	0 %	20 %	20 %	60 %	219682649
138	NC_011835	GTTCT	2	10	191611	191620	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011835	CAGCG	2	10	193222	193231	20 %	0 %	40 %	40 %	219682651
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142	NC_011835	TCGAA	2	10	194941	194950	40 %	20 %	20 %	20 %	219682652
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257	NC_011835	TGCGG	2	10	337790	337799	0 %	20 %	60 %	20 %	219682755
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264	NC_011835	ATGAG	2	10	348710	348719	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
265	NC_011835	CTGGG	2	10	348736	348745	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_011835	ATCGA	2	10	349250	349259	40 %	20 %	20 %	20 %	219682766
268	NC_011835	TCGGG	2	10	349806	349815	0 %	20 %	60 %	20 %	219682766
269	NC_011835	CTCGC	2	10	350357	350366	0 %	20 %	20 %	60 %	219682767
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271	NC_011835	GGCAT	2	10	352017	352026	20 %	20 %	40 %	20 %	219682768
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399	NC_011835	ATGGC	2	10	525313	525322	20 %	20 %	40 %	20 %	219682915
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401	NC_011835	ATGCG	2	10	528463	528472	20 %	20 %	40 %	20 %	219682917
402	NC_011835	GGTCA	2	10	528959	528968	20 %	20 %	40 %	20 %	219682917
403	NC_011835	GCGCC	2	10	529652	529661	0 %	0 %	40 %	60 %	219682918
404	NC_011835	CCGCG	2	10	534043	534052	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
405	NC_011835	GACCC	2	10	535731	535740	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
406	NC_011835	TCGGC	2	10	535955	535964	0 %	20 %	40 %	40 %	219682921
407	NC_011835	TGGCA	2	10	537265	537274	20 %	20 %	40 %	20 %	219682921
408	NC_011835	GCATC	2	10	540112	540121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
409	NC_011835	TCGCA	2	10	540722	540731	20 %	20 %	20 %	40 %	219682924
410	NC_011835	GCAAT	2	10	543642	543651	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
411	NC_011835	TCGTC	2	10	544206	544215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
412	NC_011835	CATGC	2	10	544236	544245	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
413	NC_011835	TCGAT	2	10	545124	545133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
414	NC_011835	GAGAG	2	10	545942	545951	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
415	NC_011835	GCCGT	2	10	546133	546142	0 %	20 %	40 %	40 %	219682930
416	NC_011835	CGCAT	2	10	546190	546199	20 %	20 %	20 %	40 %	219682930
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431	NC_011835	TATCG	2	10	569222	569231	20 %	40 %	20 %	20 %	219682946
432	NC_011835	GTCGT	2	10	571692	571701	0 %	40 %	40 %	20 %	219682948
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434	NC_011835	GATGC	2	10	572473	572482	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
435	NC_011835	ATCGA	2	10	575234	575243	40 %	20 %	20 %	20 %	219682953
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442	NC_011835	GGGCA	2	10	590815	590824	20 %	0 %	60 %	20 %	219682964
443	NC_011835	CGACC	2	10	593787	593796	20 %	0 %	20 %	60 %	219682966
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452	NC_011835	CTTTC	2	10	606228	606237	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
453	NC_011835	CCGAA	2	10	606438	606447	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
454	NC_011835	CGGCT	2	10	607470	607479	0 %	20 %	40 %	40 %	219682978
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