MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011834	AAAGA	2	10	81	90	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011834	TTTAA	2	10	200	209	40 %	60 %	0 %	0 %	219681946
3	NC_011834	TTAAT	2	10	1698	1707	40 %	60 %	0 %	0 %	219681946
4	NC_011834	ATTTT	2	10	2761	2770	20 %	80 %	0 %	0 %	219681947
5	NC_011834	TTTTA	2	10	2943	2952	20 %	80 %	0 %	0 %	219681947
6	NC_011834	AAAAT	2	10	5470	5479	80 %	20 %	0 %	0 %	219681951
7	NC_011834	ATTAA	2	10	6030	6039	60 %	40 %	0 %	0 %	219681951
8	NC_011834	ATGAA	2	10	7586	7595	60 %	20 %	20 %	0 %	219681953
9	NC_011834	TTTTC	2	10	9692	9701	0 %	80 %	0 %	20 %	219681955
10	NC_011834	TATAT	2	10	9868	9877	40 %	60 %	0 %	0 %	219681955
11	NC_011834	AAAAT	2	10	10594	10603	80 %	20 %	0 %	0 %	219681955
12	NC_011834	TAAGG	2	10	12212	12221	40 %	20 %	40 %	0 %	219681956
13	NC_011834	TTTTC	2	10	12606	12615	0 %	80 %	0 %	20 %	219681957
14	NC_011834	ATTTC	2	10	13392	13401	20 %	60 %	0 %	20 %	219681957
15	NC_011834	GATAA	2	10	13573	13582	60 %	20 %	20 %	0 %	219681957
16	NC_011834	ATATA	2	10	14086	14095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011834	TACAA	2	10	14753	14762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011834	TTTCT	2	10	15053	15062	0 %	80 %	0 %	20 %	219681959
19	NC_011834	TTAGT	2	10	15188	15197	20 %	60 %	20 %	0 %	219681959
20	NC_011834	TATCT	2	10	16578	16587	20 %	60 %	0 %	20 %	219681959
21	NC_011834	CAAAA	2	10	17575	17584	80 %	0 %	0 %	20 %	219681960
22	NC_011834	ATTAA	2	10	18310	18319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011834	TTTAT	2	10	20368	20377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011834	TATTT	2	10	20681	20690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011834	TACTT	2	10	20917	20926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011834	TATAT	2	10	20933	20942	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011834	AACAA	2	10	21167	21176	80 %	0 %	0 %	20 %	219681963
28	NC_011834	ATTTG	2	10	22976	22985	20 %	60 %	20 %	0 %	219681966
29	NC_011834	ATTTT	2	10	23582	23591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011834	TAAAA	2	10	23695	23704	80 %	20 %	0 %	0 %	219681967
31	NC_011834	TAATT	2	10	24052	24061	40 %	60 %	0 %	0 %	219681967
32	NC_011834	ATACA	2	10	24579	24588	60 %	20 %	0 %	20 %	219681967
33	NC_011834	TTTCT	2	10	27114	27123	0 %	80 %	0 %	20 %	219681969
34	NC_011834	TAAAC	2	10	27911	27920	60 %	20 %	0 %	20 %	219681970
35	NC_011834	AAAAT	2	10	28439	28448	80 %	20 %	0 %	0 %	219681970
36	NC_011834	AAAAT	2	10	29452	29461	80 %	20 %	0 %	0 %	219681971
37	NC_011834	TTTTA	2	10	30720	30729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011834	TTGTA	2	10	30883	30892	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011834	TGATA	2	10	30956	30965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011834	TATAA	2	10	33504	33513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011834	ATCCA	2	10	34061	34070	40 %	20 %	0 %	40 %	219681973
42	NC_011834	TAAAT	2	10	34664	34673	60 %	40 %	0 %	0 %	219681973
43	NC_011834	CTTGT	2	10	37411	37420	0 %	60 %	20 %	20 %	219681975
44	NC_011834	AAATA	2	10	38236	38245	80 %	20 %	0 %	0 %	219681975
45	NC_011834	TACAT	2	10	39959	39968	40 %	40 %	0 %	20 %	219681975
46	NC_011834	CTTTG	2	10	40270	40279	0 %	60 %	20 %	20 %	219681975
47	NC_011834	TGATC	2	10	40463	40472	20 %	40 %	20 %	20 %	219681975
48	NC_011834	TGTTT	2	10	41702	41711	0 %	80 %	20 %	0 %	219681976
49	NC_011834	TCCAT	2	10	42238	42247	20 %	40 %	0 %	40 %	219681976
50	NC_011834	ATTTT	2	10	43815	43824	20 %	80 %	0 %	0 %	219681976
51	NC_011834	ATTTT	2	10	44803	44812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011834	TTTAT	2	10	45702	45711	20 %	80 %	0 %	0 %	219681978
53	NC_011834	GTCAT	2	10	46857	46866	20 %	40 %	20 %	20 %	219681980
54	NC_011834	ATAAA	2	10	47864	47873	80 %	20 %	0 %	0 %	219681982
55	NC_011834	TAAAA	2	10	48398	48407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011834	ATTAT	2	10	48906	48915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011834	TTTAA	2	10	49016	49025	40 %	60 %	0 %	0 %	219681983
58	NC_011834	ATATT	2	10	49413	49422	40 %	60 %	0 %	0 %	219681983
59	NC_011834	ATTGT	2	10	49607	49616	20 %	60 %	20 %	0 %	219681983
60	NC_011834	GAGCA	2	10	50710	50719	40 %	0 %	40 %	20 %	219681984
61	NC_011834	ATAAA	2	10	50781	50790	80 %	20 %	0 %	0 %	219681984
62	NC_011834	TTTAA	2	10	51064	51073	40 %	60 %	0 %	0 %	219681985
63	NC_011834	AATAA	2	10	51121	51130	80 %	20 %	0 %	0 %	219681985
64	NC_011834	TGTAA	2	10	52245	52254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011834	ATTGT	2	10	52662	52671	20 %	60 %	20 %	0 %	219681986
66	NC_011834	TAATT	2	10	53919	53928	40 %	60 %	0 %	0 %	219681987
67	NC_011834	GGAAA	2	10	54574	54583	60 %	0 %	40 %	0 %	219681988
68	NC_011834	GGAAT	2	10	54653	54662	40 %	20 %	40 %	0 %	219681988
69	NC_011834	AATTA	2	10	57082	57091	60 %	40 %	0 %	0 %	219681990
70	NC_011834	ATTAA	2	10	57607	57616	60 %	40 %	0 %	0 %	219681991
71	NC_011834	ATCTA	2	10	57831	57840	40 %	40 %	0 %	20 %	219681991
72	NC_011834	GAAAA	2	10	58197	58206	80 %	0 %	20 %	0 %	219681992
73	NC_011834	CTTTA	2	10	58321	58330	20 %	60 %	0 %	20 %	219681992
74	NC_011834	ATTTA	2	10	58839	58848	40 %	60 %	0 %	0 %	219681992
75	NC_011834	TTTAT	2	10	58924	58933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011834	ATATT	2	10	61870	61879	40 %	60 %	0 %	0 %	219681994
77	NC_011834	CAATT	2	10	63590	63599	40 %	40 %	0 %	20 %	219681996
78	NC_011834	TACCG	2	10	64669	64678	20 %	20 %	20 %	40 %	219681997
79	NC_011834	TAATA	2	10	64760	64769	60 %	40 %	0 %	0 %	219681997
80	NC_011834	CATTC	2	10	65363	65372	20 %	40 %	0 %	40 %	219681998
81	NC_011834	AGAAT	2	10	66251	66260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011834	AATGC	2	10	66882	66891	40 %	20 %	20 %	20 %	219681999
83	NC_011834	ATATT	2	10	66981	66990	40 %	60 %	0 %	0 %	219681999
84	NC_011834	AATGG	2	10	67768	67777	40 %	20 %	40 %	0 %	219682000
85	NC_011834	ATTTT	2	10	68376	68385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011834	AGAAA	2	10	68911	68920	80 %	0 %	20 %	0 %	219682001
87	NC_011834	ATCCC	2	10	69133	69142	20 %	20 %	0 %	60 %	219682002
88	NC_011834	AAATC	2	10	69280	69289	60 %	20 %	0 %	20 %	219682002
89	NC_011834	CATAT	2	10	72041	72050	40 %	40 %	0 %	20 %	219682004
90	NC_011834	ATTAA	2	10	72242	72251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011834	TAAAT	2	10	73010	73019	60 %	40 %	0 %	0 %	219682005
92	NC_011834	ATGTT	2	10	75045	75054	20 %	60 %	20 %	0 %	219682006
93	NC_011834	GAAAA	2	10	75767	75776	80 %	0 %	20 %	0 %	219682006
94	NC_011834	TTTTA	2	10	75940	75949	20 %	80 %	0 %	0 %	219682006
95	NC_011834	GAAAA	2	10	76131	76140	80 %	0 %	20 %	0 %	219682006
96	NC_011834	GCATG	2	10	76392	76401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011834	AAATT	2	10	76776	76785	60 %	40 %	0 %	0 %	219682007
98	NC_011834	AATAC	2	10	78538	78547	60 %	20 %	0 %	20 %	219682008
99	NC_011834	TAAAT	2	10	79974	79983	60 %	40 %	0 %	0 %	219682010
100	NC_011834	GCTAT	2	10	81196	81205	20 %	40 %	20 %	20 %	219682011
101	NC_011834	GATAT	2	10	81750	81759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011834	ATAAA	2	10	82502	82511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011834	AATTA	2	10	83172	83181	60 %	40 %	0 %	0 %	219682013
104	NC_011834	TTAAT	2	10	83636	83645	40 %	60 %	0 %	0 %	219682014
105	NC_011834	CAAAT	2	10	85415	85424	60 %	20 %	0 %	20 %	219682016
106	NC_011834	TTAAA	2	10	87609	87618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011834	AATAT	2	10	87720	87729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011834	TAATA	2	10	87752	87761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011834	TCAAA	2	10	88565	88574	60 %	20 %	0 %	20 %	219682021
110	NC_011834	TTAAA	2	10	89019	89028	60 %	40 %	0 %	0 %	219682021
111	NC_011834	TTTAC	2	10	89090	89099	20 %	60 %	0 %	20 %	219682021
112	NC_011834	TAAAA	2	10	90430	90439	80 %	20 %	0 %	0 %	219682021
113	NC_011834	AAATT	2	10	90731	90740	60 %	40 %	0 %	0 %	219682021
114	NC_011834	AATAT	2	10	91544	91553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011834	CCATG	2	10	93157	93166	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011834	GCAAT	2	10	94989	94998	40 %	20 %	20 %	20 %	219682024
117	NC_011834	GAATT	2	10	95121	95130	40 %	40 %	20 %	0 %	219682024
118	NC_011834	AGATC	2	10	96053	96062	40 %	20 %	20 %	20 %	219682025
119	NC_011834	ATATT	2	10	96549	96558	40 %	60 %	0 %	0 %	219682025
120	NC_011834	GATAT	2	10	97282	97291	40 %	40 %	20 %	0 %	219682026
121	NC_011834	TTTTA	2	10	100843	100852	20 %	80 %	0 %	0 %	219682028
122	NC_011834	AATAT	2	10	101440	101449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011834	AATTA	2	10	101815	101824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011834	CAGAA	2	10	102461	102470	60 %	0 %	20 %	20 %	219682029
125	NC_011834	TAAAT	2	10	103239	103248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011834	TATTT	2	10	103334	103343	20 %	80 %	0 %	0 %	219682030
127	NC_011834	TATTT	2	10	103930	103939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011834	GAATT	2	10	106655	106664	40 %	40 %	20 %	0 %	219682033
129	NC_011834	TAAAA	2	10	107809	107818	80 %	20 %	0 %	0 %	219682034
130	NC_011834	TAAAA	2	10	107908	107917	80 %	20 %	0 %	0 %	219682034
131	NC_011834	ATTTT	2	10	108966	108975	20 %	80 %	0 %	0 %	219682035
132	NC_011834	TAATT	2	10	110196	110205	40 %	60 %	0 %	0 %	219682037
133	NC_011834	ATTAT	2	10	110523	110532	40 %	60 %	0 %	0 %	219682037
134	NC_011834	ATTTA	2	10	111160	111169	40 %	60 %	0 %	0 %	219682038
135	NC_011834	TTTTA	2	10	111511	111520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011834	TGTTT	2	10	116742	116751	0 %	80 %	20 %	0 %	219682042
137	NC_011834	AGTAA	2	10	116833	116842	60 %	20 %	20 %	0 %	219682042
138	NC_011834	TAATT	2	10	117006	117015	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011834	ATATA	2	10	117152	117161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011834	GAAAA	2	10	117264	117273	80 %	0 %	20 %	0 %	219682043
141	NC_011834	TATTT	2	10	117893	117902	20 %	80 %	0 %	0 %	219682044
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254	NC_011834	TGAAT	2	10	217137	217146	40 %	40 %	20 %	0 %	219682130
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269	NC_011834	CTTTT	2	10	230597	230606	0 %	80 %	0 %	20 %	219682139
270	NC_011834	TGATA	2	10	231374	231383	40 %	40 %	20 %	0 %	219682140
271	NC_011834	TTGGA	2	10	232131	232140	20 %	40 %	40 %	0 %	219682141
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273	NC_011834	GTATT	2	10	235427	235436	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_011834	TGATT	2	10	236186	236195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_011834	TAATA	2	10	236848	236857	60 %	40 %	0 %	0 %	219682144
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284	NC_011834	TATAT	2	10	248758	248767	40 %	60 %	0 %	0 %	219682153
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287	NC_011834	ATGTT	2	10	250705	250714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_011834	ATATT	2	10	358009	358018	40 %	60 %	0 %	0 %	219682238
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404	NC_011834	TATAA	2	10	359532	359541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_011834	TAGTT	2	10	360863	360872	20 %	60 %	20 %	0 %	219682241
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