MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-4

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011785	AATC	2	8	230	237	50 %	25 %	0 %	25 %	218906786
2	NC_011785	ATTC	2	8	245	252	25 %	50 %	0 %	25 %	218906786
3	NC_011785	CTAT	2	8	489	496	25 %	50 %	0 %	25 %	218906786
4	NC_011785	ATTA	2	8	510	517	50 %	50 %	0 %	0 %	218906786
5	NC_011785	TCAA	2	8	718	725	50 %	25 %	0 %	25 %	218906786
6	NC_011785	AATC	2	8	1443	1450	50 %	25 %	0 %	25 %	218906795
7	NC_011785	ATTA	2	8	2019	2026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011785	CAAT	2	8	2528	2535	50 %	25 %	0 %	25 %	218906798
9	NC_011785	AGCC	2	8	3395	3402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011785	TTAA	2	8	3660	3667	50 %	50 %	0 %	0 %	218906782
11	NC_011785	ACAA	2	8	3901	3908	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011785	AAAT	2	8	4085	4092	75 %	25 %	0 %	0 %	218906790
13	NC_011785	AAAT	2	8	4280	4287	75 %	25 %	0 %	0 %	218906790
14	NC_011785	AAAT	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	218906790
15	NC_011785	TTAA	2	8	4807	4814	50 %	50 %	0 %	0 %	218906790
16	NC_011785	TTAA	2	8	4826	4833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011785	GATT	2	8	5359	5366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011785	TGTT	2	8	5768	5775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011785	AAAT	2	8	5858	5865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011785	AAAT	2	8	6784	6791	75 %	25 %	0 %	0 %	218906797
21	NC_011785	ATAA	2	8	6846	6853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011785	CAAA	2	8	7073	7080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011785	TATG	2	8	7652	7659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011785	GATA	2	8	7776	7783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011785	ATAG	2	8	7890	7897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011785	ATAA	2	8	8473	8480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011785	ATCA	2	8	8516	8523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011785	ATTT	2	8	8568	8575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011785	ATAA	3	12	8662	8673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011785	GAAG	2	8	8947	8954	50 %	0 %	50 %	0 %	218906794
31	NC_011785	ATAA	2	8	9233	9240	75 %	25 %	0 %	0 %	218906794
32	NC_011785	GGTA	2	8	9648	9655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011785	TATC	2	8	9770	9777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011785	ATTG	2	8	9989	9996	25 %	50 %	25 %	0 %	218906789
35	NC_011785	ATTT	2	8	10560	10567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011785	ATTA	2	8	10695	10702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011785	TAAA	2	8	10857	10864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011785	CAAA	2	8	10890	10897	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011785	CTAA	2	8	11123	11130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011785	AAAT	2	8	11609	11616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011785	TTTA	2	8	11774	11781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011785	CAAC	2	8	12000	12007	50 %	0 %	0 %	50 %	218906784
43	NC_011785	ATCA	2	8	12156	12163	50 %	25 %	0 %	25 %	218906784
44	NC_011785	CAAG	2	8	12195	12202	50 %	0 %	25 %	25 %	218906784
45	NC_011785	GTTT	2	8	12474	12481	0 %	75 %	25 %	0 %	218906784
46	NC_011785	GAAA	2	8	12503	12510	75 %	0 %	25 %	0 %	218906784
47	NC_011785	CAAA	2	8	12912	12919	75 %	0 %	0 %	25 %	218906784
48	NC_011785	AATG	2	8	13097	13104	50 %	25 %	25 %	0 %	218906785
49	NC_011785	TAAA	2	8	14126	14133	75 %	25 %	0 %	0 %	218906781
50	NC_011785	ATTA	2	8	14392	14399	50 %	50 %	0 %	0 %	218906787
51	NC_011785	AAAT	2	8	14466	14473	75 %	25 %	0 %	0 %	218906787
52	NC_011785	TAAC	2	8	15337	15344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011785	TAAA	2	8	15664	15671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011785	TAAA	2	8	15864	15871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011785	TAAA	2	8	16286	16293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011785	TTTA	2	8	16325	16332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011785	ATAA	2	8	16348	16355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011785	TTTA	2	8	17070	17077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011785	GCAA	2	8	17083	17090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011785	TATT	2	8	17314	17321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011785	ATGA	2	8	17694	17701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011785	TTTA	2	8	17712	17719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011785	ATTT	2	8	17930	17937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011785	TACT	2	8	18030	18037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011785	ATTT	2	8	18923	18930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011785	ATTT	2	8	19016	19023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011785	TTTA	2	8	19174	19181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011785	TGTT	2	8	19322	19329	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011785	ATTT	2	8	19412	19419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011785	TTAA	2	8	19450	19457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011785	GCTT	2	8	19764	19771	0 %	50 %	25 %	25 %	218906800
72	NC_011785	ATTA	2	8	19803	19810	50 %	50 %	0 %	0 %	218906800
73	NC_011785	TATC	2	8	19952	19959	25 %	50 %	0 %	25 %	218906800
74	NC_011785	TTGT	2	8	19975	19982	0 %	75 %	25 %	0 %	218906800
75	NC_011785	ATTT	2	8	20446	20453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011785	ATTA	2	8	20557	20564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011785	TTTA	2	8	20625	20632	25 %	75 %	0 %	0 %	218906799
78	NC_011785	AAAT	2	8	20966	20973	75 %	25 %	0 %	0 %	218906799
79	NC_011785	AAAT	2	8	21361	21368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011785	AATA	2	8	21675	21682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011785	ACAA	2	8	22052	22059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011785	TCTT	2	8	22604	22611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011785	TAAT	2	8	22710	22717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011785	TTTC	2	8	22741	22748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011785	TTAT	2	8	22831	22838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011785	TGTT	2	8	24857	24864	0 %	75 %	25 %	0 %	218906793
87	NC_011785	TTTG	2	8	25247	25254	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011785	AATT	2	8	25929	25936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011785	TATT	2	8	26267	26274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011785	AAAT	2	8	26278	26285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011785	AAAG	2	8	26971	26978	75 %	0 %	25 %	0 %	218906791
92	NC_011785	GATA	2	8	26994	27001	50 %	25 %	25 %	0 %	218906791
93	NC_011785	TTAT	2	8	27187	27194	25 %	75 %	0 %	0 %	218906791
94	NC_011785	ATTT	2	8	27740	27747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011785	CTTT	2	8	27991	27998	0 %	75 %	0 %	25 %	218906788
96	NC_011785	ATCA	2	8	28059	28066	50 %	25 %	0 %	25 %	218906788
97	NC_011785	CTAT	2	8	28090	28097	25 %	50 %	0 %	25 %	218906788
98	NC_011785	ATTT	2	8	28127	28134	25 %	75 %	0 %	0 %	218906788
99	NC_011785	TAAT	2	8	28259	28266	50 %	50 %	0 %	0 %	218906788
100	NC_011785	ATTA	2	8	28458	28465	50 %	50 %	0 %	0 %	218906788
101	NC_011785	AAAC	2	8	28665	28672	75 %	0 %	0 %	25 %	218906788
102	NC_011785	TTAA	2	8	28738	28745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011785	TAAA	2	8	28782	28789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.