MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-4

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011785	TAA	2	6	32	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011785	AAG	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011785	AAC	2	6	402	407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906786
4	NC_011785	TAC	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906786
5	NC_011785	AAC	2	6	556	561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906786
6	NC_011785	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906786
7	NC_011785	CTT	2	6	638	643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906786
8	NC_011785	AAT	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906786
9	NC_011785	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906786
10	NC_011785	CTA	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906786
11	NC_011785	AAT	2	6	966	971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011785	TAT	2	6	993	998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011785	ATT	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
14	NC_011785	ATT	2	6	1065	1070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
15	NC_011785	TTA	2	6	1071	1076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
16	NC_011785	AAT	2	6	1110	1115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906795
17	NC_011785	TTA	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
18	NC_011785	AGA	2	6	1373	1378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906795
19	NC_011785	ATC	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906795
20	NC_011785	TAG	3	9	1538	1546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906795
21	NC_011785	TAC	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906795
22	NC_011785	ATA	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011785	AAC	2	6	1765	1770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011785	ATT	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011785	AAT	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011785	CAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011785	ATA	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011785	TAT	2	6	2010	2015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011785	ACT	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011785	ACA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011785	CTA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011785	GAA	2	6	2218	2223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011785	TAA	2	6	2288	2293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906798
34	NC_011785	ACA	2	6	2312	2317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
35	NC_011785	TAG	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906798
36	NC_011785	ACA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
37	NC_011785	TTA	2	6	2434	2439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906798
38	NC_011785	AAC	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
39	NC_011785	TAA	2	6	2484	2489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906798
40	NC_011785	TAC	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906798
41	NC_011785	ACT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906798
42	NC_011785	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011785	AAT	2	6	2708	2713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011785	TTA	3	9	2875	2883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011785	TAA	2	6	2954	2959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011785	ATA	2	6	2993	2998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011785	TTA	2	6	3059	3064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011785	ACA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
49	NC_011785	AAC	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
50	NC_011785	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906780
51	NC_011785	CAA	2	6	3167	3172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
52	NC_011785	CTA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906780
53	NC_011785	ATC	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011785	ATA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906782
55	NC_011785	ATT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011785	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011785	ATA	2	6	3963	3968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011785	TAA	2	6	3979	3984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011785	TAA	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
60	NC_011785	AGA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
61	NC_011785	ATT	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906790
62	NC_011785	AGA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
63	NC_011785	AGA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
64	NC_011785	ATA	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
65	NC_011785	ACA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906790
66	NC_011785	TAA	2	6	4565	4570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
67	NC_011785	ATC	2	6	4592	4597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906790
68	NC_011785	AGA	2	6	4617	4622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
69	NC_011785	ATC	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906790
70	NC_011785	CAA	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906790
71	NC_011785	AAT	2	6	4738	4743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
72	NC_011785	GAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906790
73	NC_011785	CTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906790
74	NC_011785	TAG	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906790
75	NC_011785	TCT	2	6	4874	4879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011785	TAG	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011785	TAA	2	6	4968	4973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011785	TTA	2	6	4974	4979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011785	TTA	2	6	4987	4992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011785	TTC	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011785	TAA	2	6	5024	5029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011785	TCT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011785	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011785	ATT	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906792
85	NC_011785	TAA	2	6	5166	5171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906792
86	NC_011785	TAA	2	6	5254	5259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906792
87	NC_011785	TCA	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011785	GAT	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011785	AGC	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011785	GTA	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011785	AAT	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011785	TAA	2	6	5563	5568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011785	TGA	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011785	AAC	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011785	GAA	3	9	5988	5996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011785	GGC	2	6	6083	6088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011785	TAT	2	6	6325	6330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011785	CCA	2	6	6416	6421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011785	AAT	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011785	TAA	2	6	6571	6576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011785	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906797
102	NC_011785	AGA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906797
103	NC_011785	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011785	AAT	2	6	7177	7182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011785	AAT	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011785	ATA	2	6	7223	7228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011785	TAT	2	6	7251	7256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011785	AGA	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011785	ATT	2	6	7390	7395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011785	ATT	2	6	7526	7531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011785	ATT	2	6	7567	7572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011785	TGT	2	6	7574	7579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011785	ATG	2	6	7697	7702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011785	AGC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011785	ACT	2	6	7806	7811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011785	ACA	2	6	7844	7849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011785	ACA	2	6	7861	7866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011785	GAT	2	6	7932	7937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011785	TAA	2	6	8072	8077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011785	AAC	2	6	8119	8124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011785	CAA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011785	AGA	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011785	GAA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011785	TAT	2	6	8296	8301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011785	TTA	2	6	8333	8338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011785	TAA	2	6	8382	8387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011785	ATT	2	6	8396	8401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011785	TAA	2	6	8419	8424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011785	AAT	2	6	8441	8446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011785	TAA	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011785	TAA	2	6	8654	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011785	AGG	2	6	8690	8695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011785	AGA	3	9	8857	8865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
134	NC_011785	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
135	NC_011785	GAA	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
136	NC_011785	CAA	2	6	8906	8911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
137	NC_011785	GAA	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
138	NC_011785	CAA	2	6	8933	8938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
139	NC_011785	GAA	2	6	8939	8944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
140	NC_011785	ACA	2	6	8965	8970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.