MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-3

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011781	AAAAT	2	10	312	321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011781	AAATC	2	10	862	871	60 %	20 %	0 %	20 %	218875471
3	NC_011781	AAATA	2	10	2805	2814	80 %	20 %	0 %	0 %	218875465
4	NC_011781	ATTTT	2	10	3518	3527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011781	ACCAA	2	10	4586	4595	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011781	TAAAA	2	10	4955	4964	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011781	TTCTT	2	10	7021	7030	0 %	80 %	0 %	20 %	218875469
8	NC_011781	AATAT	2	10	7204	7213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011781	ATTAT	2	10	7779	7788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011781	AATTA	2	10	7973	7982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011781	ATTAA	2	10	8449	8458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011781	TTATT	2	10	8558	8567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011781	TTTTG	2	10	8966	8975	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011781	AATTT	2	10	9636	9645	40 %	60 %	0 %	0 %	218875473
15	NC_011781	TACTT	2	10	10676	10685	20 %	60 %	0 %	20 %	218875476
16	NC_011781	GTATA	2	10	11046	11055	40 %	40 %	20 %	0 %	218875476
17	NC_011781	TTATT	2	10	11240	11249	20 %	80 %	0 %	0 %	218875468
18	NC_011781	CTTAG	2	10	11359	11368	20 %	40 %	20 %	20 %	218875468
19	NC_011781	TTGGT	2	10	12019	12028	0 %	60 %	40 %	0 %	218875468
20	NC_011781	TAAAA	3	15	12201	12215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011781	ATATC	2	10	12588	12597	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011781	ATTCT	2	10	16305	16314	20 %	60 %	0 %	20 %	218875472
23	NC_011781	AATAA	2	10	16921	16930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011781	AAAAT	2	10	17368	17377	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011781	AAAGC	2	10	17553	17562	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011781	AATAA	2	10	17853	17862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011781	ATTTA	2	10	18284	18293	40 %	60 %	0 %	0 %	218875464
28	NC_011781	ATTTA	2	10	18338	18347	40 %	60 %	0 %	0 %	218875464
29	NC_011781	ATTTA	2	10	18392	18401	40 %	60 %	0 %	0 %	218875464
30	NC_011781	ATTTA	2	10	18446	18455	40 %	60 %	0 %	0 %	218875464
31	NC_011781	TAATT	2	10	19053	19062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011781	ATTTT	2	10	19657	19666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011781	TTTAT	2	10	21409	21418	20 %	80 %	0 %	0 %	218875459
34	NC_011781	AAGAA	2	10	21432	21441	80 %	0 %	20 %	0 %	218875459
35	NC_011781	AATAT	2	10	21460	21469	60 %	40 %	0 %	0 %	218875459
36	NC_011781	AAAAT	2	10	23198	23207	80 %	20 %	0 %	0 %	218875459
37	NC_011781	AATTA	2	10	23676	23685	60 %	40 %	0 %	0 %	218875459
38	NC_011781	GTTTA	2	10	26756	26765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011781	TAGTT	2	10	27171	27180	20 %	60 %	20 %	0 %	218875463

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.