MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011779	ATT	3	9	72	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011779	AAT	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011779	TAT	2	6	111	116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011779	ATT	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868770
5	NC_011779	GGA	2	6	194	199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868770
6	NC_011779	AAT	2	6	257	262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868770
7	NC_011779	AAG	2	6	267	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
8	NC_011779	AAG	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
9	NC_011779	AGG	2	6	477	482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868770
10	NC_011779	CTA	2	6	495	500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868770
11	NC_011779	GAA	2	6	503	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
12	NC_011779	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868770
13	NC_011779	AGA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
14	NC_011779	TTC	2	6	549	554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868770
15	NC_011779	TAA	2	6	615	620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868770
16	NC_011779	ATG	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868770
17	NC_011779	CAT	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868770
18	NC_011779	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868770
19	NC_011779	AGC	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218868770
20	NC_011779	TAT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868770
21	NC_011779	ATA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868770
22	NC_011779	TTA	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868770
23	NC_011779	AAG	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
24	NC_011779	GAA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
25	NC_011779	TTA	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868770
26	NC_011779	ATA	3	9	1126	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011779	CTA	2	6	1174	1179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011779	ATA	2	6	1189	1194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011779	AAT	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011779	ATA	2	6	1276	1281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011779	TAA	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011779	CAA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011779	ATT	2	6	1362	1367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011779	AAG	2	6	1399	1404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011779	AGA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011779	ATT	2	6	1587	1592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011779	GTT	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011779	CAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011779	AGA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011779	TTA	2	6	1804	1809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011779	AAG	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011779	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011779	ATT	2	6	2124	2129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011779	AGG	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011779	TGG	3	9	2348	2356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011779	ACT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011779	AGG	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011779	TAA	2	6	2456	2461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011779	GGA	2	6	2464	2469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011779	TAT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011779	AGG	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011779	ATT	3	9	2521	2529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011779	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011779	CTT	2	6	2728	2733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011779	ATT	2	6	2780	2785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011779	TAC	2	6	2795	2800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011779	TAT	2	6	2809	2814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011779	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011779	ACT	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011779	ACT	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011779	TAA	2	6	3312	3317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011779	GAT	2	6	3478	3483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011779	ACT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011779	TCT	2	6	3546	3551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011779	ATC	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011779	CTA	3	9	3637	3645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011779	ATT	2	6	3754	3759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011779	TTC	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011779	TAA	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011779	ATT	2	6	3961	3966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011779	TAA	2	6	3971	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011779	TTA	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011779	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011779	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
75	NC_011779	TAA	2	6	4327	4332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
76	NC_011779	CAA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
77	NC_011779	ACA	2	6	4363	4368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
78	NC_011779	TTC	2	6	4380	4385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868794
79	NC_011779	ATA	2	6	4416	4421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
80	NC_011779	AAC	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
81	NC_011779	ACT	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868794
82	NC_011779	ATT	2	6	4605	4610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868794
83	NC_011779	TAA	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
84	NC_011779	ATA	2	6	4746	4751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
85	NC_011779	ATA	3	9	4755	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
86	NC_011779	AGA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868794
87	NC_011779	TAA	2	6	4806	4811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
88	NC_011779	TTA	2	6	4838	4843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868794
89	NC_011779	TTC	2	6	4851	4856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868794
90	NC_011779	TAA	2	6	4876	4881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
91	NC_011779	CAA	3	9	5015	5023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
92	NC_011779	AAC	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
93	NC_011779	ATA	2	6	5322	5327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
94	NC_011779	TAA	3	9	5335	5343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
95	NC_011779	TTA	3	9	5344	5352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868794
96	NC_011779	ATT	2	6	5356	5361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868794
97	NC_011779	ATA	2	6	5366	5371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
98	NC_011779	AAG	2	6	5397	5402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868794
99	NC_011779	TTA	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
100	NC_011779	ATG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868786
101	NC_011779	TAA	2	6	5566	5571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868786
102	NC_011779	ATT	2	6	5605	5610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
103	NC_011779	GAA	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868786
104	NC_011779	GAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868786
105	NC_011779	TTA	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
106	NC_011779	ATT	2	6	5869	5874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
107	NC_011779	TAT	2	6	5985	5990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
108	NC_011779	GAG	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868777
109	NC_011779	CTT	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868777
110	NC_011779	CAA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868777
111	NC_011779	TAA	2	6	6066	6071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
112	NC_011779	ATC	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868777
113	NC_011779	TAA	2	6	6176	6181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
114	NC_011779	TGT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868777
115	NC_011779	AAG	2	6	6272	6277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868777
116	NC_011779	ATT	2	6	6320	6325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868777
117	NC_011779	AGA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868777
118	NC_011779	TAA	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
119	NC_011779	AAT	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
120	NC_011779	ATT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868777
121	NC_011779	TTA	2	6	6577	6582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868777
122	NC_011779	ATA	2	6	6643	6648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
123	NC_011779	TAC	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868777
124	NC_011779	TAA	3	9	6799	6807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868797
125	NC_011779	GAA	2	6	6846	6851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868797
126	NC_011779	GAT	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868797
127	NC_011779	GAA	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868797
128	NC_011779	TGA	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868797
129	NC_011779	TAA	2	6	7168	7173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868797
130	NC_011779	CAC	2	6	7174	7179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218868797
131	NC_011779	TTA	2	6	7285	7290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868797
132	NC_011779	AGA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868797
133	NC_011779	ATA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011779	TAT	2	6	7469	7474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011779	ATT	2	6	7625	7630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868773
136	NC_011779	TCT	2	6	7671	7676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
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138	NC_011779	CCA	2	6	7937	7942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218868773
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.