MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011777	CTTTCC	2	12	2720	2731	0 %	50 %	0 %	50 %	218848298
2	NC_011777	AAACGG	2	12	2962	2973	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218848205
3	NC_011777	CAGAAC	2	12	3370	3381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218848459
4	NC_011777	CAAGCA	2	12	4654	4665	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218848211
5	NC_011777	AAGTGA	2	12	5777	5788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011777	CCATAA	2	12	6272	6283	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218848424
7	NC_011777	TTCATT	2	12	6728	6739	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218848402
8	NC_011777	TTCAAT	2	12	6746	6757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848402
9	NC_011777	CTTTTT	2	12	8148	8159	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218848296
10	NC_011777	TTTTCC	2	12	8315	8326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218848219
11	NC_011777	TTTGTT	2	12	10738	10749	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	218848300
12	NC_011777	TATCAA	2	12	11293	11304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218848300
13	NC_011777	TCACCT	2	12	14658	14669	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218848251
14	NC_011777	TTTCTA	2	12	22590	22601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218848222
15	NC_011777	AAATAA	2	12	22617	22628	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218848222
16	NC_011777	ACGCCA	2	12	23847	23858	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	218848447
17	NC_011777	AAAATA	2	12	25695	25706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218848350
18	NC_011777	ACTTTA	2	12	31316	31327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848380
19	NC_011777	GAAAAA	2	12	32682	32693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848193
20	NC_011777	TCCACA	2	12	33400	33411	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218848193
21	NC_011777	AATCGT	2	12	36746	36757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218848342
22	NC_011777	TCCTTT	2	12	37573	37584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218848342
23	NC_011777	ATTGAT	2	12	40760	40771	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848366
24	NC_011777	TAGGAC	2	12	49104	49115	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218848327
25	NC_011777	GTTCCT	2	12	59124	59135	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218848377
26	NC_011777	TTATTC	2	12	61613	61624	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011777	AACAAA	2	12	63376	63387	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	218848453
28	NC_011777	ATTGAT	2	12	65638	65649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848480
29	NC_011777	GATTTC	2	12	66758	66769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218848480
30	NC_011777	ACAGCA	2	12	67951	67962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218848477
31	NC_011777	AGGAGC	2	12	67989	68000	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218848477
32	NC_011777	TTTGGT	2	12	68128	68139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218848477
33	NC_011777	TATAAT	2	12	69413	69424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011777	ATCCAG	2	12	70538	70549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218848238
35	NC_011777	AAAAAG	2	12	72007	72018	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848332
36	NC_011777	ACGTGT	2	12	73411	73422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218848261
37	NC_011777	AACAGG	2	12	75353	75364	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218848303
38	NC_011777	GTTATT	2	12	77798	77809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218848410
39	NC_011777	ATAAGA	2	12	78935	78946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848467
40	NC_011777	AGAACA	2	12	78955	78966	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218848467
41	NC_011777	GATTGT	2	12	81956	81967	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218848482
42	NC_011777	CATCAA	2	12	83661	83672	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218848489
43	NC_011777	GAAATT	2	12	84906	84917	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218848244
44	NC_011777	AATATT	2	12	87268	87279	50 %	50 %	0 %	0 %	218848307
45	NC_011777	CGTAGA	2	12	88468	88479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011777	TGTGAT	2	12	88516	88527	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011777	CGTGAT	2	12	88555	88566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011777	GTTCTT	2	12	89366	89377	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218848254
49	NC_011777	TATGAA	2	12	90793	90804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218848208
50	NC_011777	ATATTT	2	12	92831	92842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011777	TAAAAA	2	12	97033	97044	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011777	AGATGT	2	12	100873	100884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218848429
53	NC_011777	GAAAAA	2	12	103471	103482	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848504
54	NC_011777	TCAAAT	2	12	103606	103617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218848504
55	NC_011777	TGAAAA	2	12	105441	105452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848426
56	NC_011777	CAAAAG	2	12	105892	105903	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218848357
57	NC_011777	TTAGTC	2	12	107898	107909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218848399
58	NC_011777	AAGAGA	2	12	109333	109344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218848212
59	NC_011777	ACGCAA	2	12	110397	110408	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218848212
60	NC_011777	AAATCA	2	12	111215	111226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218848212
61	NC_011777	TGGAGA	2	12	113011	113022	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	218848197
62	NC_011777	CAAAAA	2	12	114109	114120	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	218848436
63	NC_011777	AATTAG	2	12	115454	115465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218848290
64	NC_011777	AAAAGA	2	12	116180	116191	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848214
65	NC_011777	ATGGAA	2	12	118282	118293	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218848324
66	NC_011777	CTCTTG	2	12	119145	119156	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218848215
67	NC_011777	GGATTA	2	12	123672	123683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218848229
68	NC_011777	TGTAAG	2	12	123755	123766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218848229
69	NC_011777	TTCTAT	2	12	125672	125683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011777	AGAAAA	2	12	126223	126234	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848206
71	NC_011777	AGAAAA	2	12	128343	128354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848383
72	NC_011777	TTTATT	2	12	131143	131154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011777	CTTGTT	2	12	131167	131178	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011777	TGTTCA	2	12	132954	132965	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218848484
75	NC_011777	ATCCCA	2	12	136684	136695	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218848236
76	NC_011777	TTTCCA	2	12	137645	137656	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218848471
77	NC_011777	CTTAAT	2	12	139481	139492	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848448
78	NC_011777	CAAAAG	2	12	139801	139812	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218848389
79	NC_011777	AAGCAA	2	12	140350	140361	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218848389
80	NC_011777	GCTGGT	2	12	140595	140606	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218848389
81	NC_011777	AAATAG	2	12	146794	146805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848349
82	NC_011777	TCAACT	2	12	149670	149681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218848285
83	NC_011777	GAATTG	2	12	149726	149737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218848285
84	NC_011777	ACTATA	2	12	150279	150290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218848285
85	NC_011777	ATCTTT	2	12	153649	153660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218848330
86	NC_011777	AAATAA	2	12	155381	155392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218848505
87	NC_011777	ATTAAT	2	12	156686	156697	50 %	50 %	0 %	0 %	218848485
88	NC_011777	GATGGA	2	12	160473	160484	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	218848400
89	NC_011777	TAAAAC	2	12	163944	163955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218848479
90	NC_011777	GATTTC	2	12	166399	166410	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218848317
91	NC_011777	CTTTCT	2	12	170393	170404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218848456
92	NC_011777	TAAGAA	2	12	171871	171882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848243
93	NC_011777	ATTTGT	2	12	175890	175901	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218848353
94	NC_011777	AAATAT	2	12	178787	178798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218848281
95	NC_011777	GACTGT	2	12	183645	183656	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218848333
96	NC_011777	GAAGGA	2	12	184147	184158	50 %	0 %	50 %	0 %	218848333
97	NC_011777	AGTTAA	2	12	185264	185275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218848396
98	NC_011777	CTTTGA	2	12	186085	186096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218848487
99	NC_011777	TGATTT	2	12	191719	191730	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218848491
100	NC_011777	AAAAGA	2	12	193922	193933	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848361
101	NC_011777	ATTTTT	2	12	194089	194100	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011777	CAATTT	2	12	198986	198997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848463
103	NC_011777	AAGAAA	2	12	201865	201876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848249
104	NC_011777	ATGATT	2	12	203022	203033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848338
105	NC_011777	ATGAAA	2	12	203417	203428	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848338
106	NC_011777	AAAATA	2	12	205768	205779	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218848452
107	NC_011777	CTAGAC	2	12	208497	208508	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218848250
108	NC_011777	GAAAAA	2	12	211812	211823	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848291
109	NC_011777	AGTAAA	2	12	212009	212020	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848291
110	NC_011777	GCAGGA	2	12	213000	213011	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218848500
111	NC_011777	CTGCTC	2	12	217946	217957	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218848437
112	NC_011777	TAGAAA	2	12	220995	221006	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011777	TAAAAG	2	12	223991	224002	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848351
114	NC_011777	ATTATG	2	12	227504	227515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011777	TTTAGA	2	12	231590	231601	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848433
116	NC_011777	TTAGAG	2	12	239431	239442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218848322
117	NC_011777	ATGCTA	2	12	240538	240549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218848370
118	NC_011777	AGAGCA	2	12	243380	243391	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218848248
119	NC_011777	ATTTTT	2	12	244235	244246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011777	AGCTGA	2	12	251715	251726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218848204
121	NC_011777	AGTATT	2	12	254433	254444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848234
122	NC_011777	TTGTAA	2	12	257606	257617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848329
123	NC_011777	ACTTTA	2	12	258126	258137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848277
124	NC_011777	GTACAG	2	12	258507	258518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218848378
125	NC_011777	GAAAAA	2	12	260316	260327	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218848308
126	NC_011777	ATAAAA	2	12	260350	260361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218848308
127	NC_011777	TACTTC	2	12	261622	261633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218848461
128	NC_011777	TACTCT	2	12	262080	262091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218848461
129	NC_011777	ACATAT	2	12	267576	267587	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218848195

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.