MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_10

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011771	TCG	2	6	33	38	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011771	TTGT	2	8	127	134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011771	TGTC	2	8	163	170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011771	A	6	6	180	185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011771	A	6	6	198	203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011771	T	7	7	219	225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011771	TAC	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011771	TA	4	8	293	300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011771	GAA	2	6	308	313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011771	A	6	6	321	326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011771	TAA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011771	A	11	11	398	408	100 %	0 %	0 %	0 %	218847804
13	NC_011771	CTT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
14	NC_011771	T	7	7	464	470	0 %	100 %	0 %	0 %	218847804
15	NC_011771	TTC	2	6	477	482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
16	NC_011771	TGT	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847804
17	NC_011771	ACA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847804
18	NC_011771	ATA	2	6	559	564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847804
19	NC_011771	AC	3	6	594	599	50 %	0 %	0 %	50 %	218847804
20	NC_011771	TCT	2	6	607	612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
21	NC_011771	GTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847804
22	NC_011771	T	7	7	648	654	0 %	100 %	0 %	0 %	218847804
23	NC_011771	TAAA	2	8	791	798	75 %	25 %	0 %	0 %	218847804
24	NC_011771	A	6	6	796	801	100 %	0 %	0 %	0 %	218847804
25	NC_011771	CTT	3	9	803	811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
26	NC_011771	TAC	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847804
27	NC_011771	AAT	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847804
28	NC_011771	ATT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847804
29	NC_011771	T	6	6	898	903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011771	A	7	7	963	969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011771	TC	3	6	982	987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011771	TTG	2	6	1012	1017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011771	AGC	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011771	TCTA	2	8	1100	1107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011771	TCA	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011771	CTG	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011771	AT	3	6	1160	1165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011771	AAC	2	6	1200	1205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847798
39	NC_011771	TTCC	2	8	1211	1218	0 %	50 %	0 %	50 %	218847798
40	NC_011771	T	7	7	1257	1263	0 %	100 %	0 %	0 %	218847798
41	NC_011771	TTC	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847798
42	NC_011771	ATTT	2	8	1287	1294	25 %	75 %	0 %	0 %	218847798
43	NC_011771	CTT	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847798
44	NC_011771	ATC	2	6	1458	1463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847798
45	NC_011771	TGA	2	6	1530	1535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847798
46	NC_011771	TCTAA	2	10	1606	1615	40 %	40 %	0 %	20 %	218847798
47	NC_011771	TA	4	8	1698	1705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011771	TTG	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011771	AT	4	8	1730	1737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011771	T	6	6	1785	1790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011771	AATTA	2	10	1824	1833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011771	ATG	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847807
53	NC_011771	TAAAT	2	10	1967	1976	60 %	40 %	0 %	0 %	218847807
54	NC_011771	AAT	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
55	NC_011771	AAT	2	6	2042	2047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
56	NC_011771	TAG	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847807
57	NC_011771	ATAA	2	8	2073	2080	75 %	25 %	0 %	0 %	218847807
58	NC_011771	AAT	2	6	2108	2113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
59	NC_011771	TAT	2	6	2164	2169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011771	TA	3	6	2177	2182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011771	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011771	AAT	2	6	2232	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011771	TAA	2	6	2312	2317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011771	CAC	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011771	A	6	6	2335	2340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011771	TTAT	2	8	2350	2357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011771	TA	3	6	2361	2366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011771	TAT	2	6	2383	2388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011771	ATTT	2	8	2398	2405	25 %	75 %	0 %	0 %	218847802
70	NC_011771	GAC	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218847802
71	NC_011771	GCT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218847802
72	NC_011771	TTC	2	6	2511	2516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847802
73	NC_011771	TTA	2	6	2519	2524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
74	NC_011771	TTG	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847802
75	NC_011771	AATT	2	8	2577	2584	50 %	50 %	0 %	0 %	218847802
76	NC_011771	ATA	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847802
77	NC_011771	TAT	2	6	2628	2633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
78	NC_011771	CTA	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847802
79	NC_011771	TTC	2	6	2731	2736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847802
80	NC_011771	A	6	6	2786	2791	100 %	0 %	0 %	0 %	218847802
81	NC_011771	ATT	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
82	NC_011771	TCC	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218847802
83	NC_011771	TCC	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011771	TA	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011771	CTT	2	6	2975	2980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011771	CTT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011771	AGA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011771	T	6	6	3030	3035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011771	T	7	7	3054	3060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011771	TAA	2	6	3089	3094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011771	TAA	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847799
92	NC_011771	TCT	2	6	3139	3144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847799
93	NC_011771	ATGA	2	8	3188	3195	50 %	25 %	25 %	0 %	218847799
94	NC_011771	GGA	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218847799
95	NC_011771	AT	3	6	3207	3212	50 %	50 %	0 %	0 %	218847799
96	NC_011771	ATT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847799
97	NC_011771	ATC	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847799
98	NC_011771	TAT	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847799
99	NC_011771	TTTGC	2	10	3485	3494	0 %	60 %	20 %	20 %	218847799
100	NC_011771	AAC	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847799
101	NC_011771	A	7	7	3573	3579	100 %	0 %	0 %	0 %	218847799
102	NC_011771	ATTGGT	2	12	3649	3660	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218847799
103	NC_011771	ATA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011771	AAAG	2	8	3796	3803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011771	ACAAT	2	10	3850	3859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011771	A	7	7	3880	3886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011771	CAA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011771	TCA	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011771	T	6	6	3935	3940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011771	T	6	6	3959	3964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011771	CAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011771	ACAA	2	8	4038	4045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011771	TTA	2	6	4062	4067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011771	TGC	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011771	TAA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011771	AAT	2	6	4197	4202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011771	TA	4	8	4247	4254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011771	TAT	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011771	TACCAA	2	12	4284	4295	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218847800
120	NC_011771	GATTT	2	10	4359	4368	20 %	60 %	20 %	0 %	218847800
121	NC_011771	T	7	7	4366	4372	0 %	100 %	0 %	0 %	218847800
122	NC_011771	TGT	2	6	4429	4434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847800
123	NC_011771	AGC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218847800
124	NC_011771	ATA	2	6	4461	4466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847800
125	NC_011771	ATG	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847800
126	NC_011771	AAT	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847800
127	NC_011771	AT	3	6	4733	4738	50 %	50 %	0 %	0 %	218847800
128	NC_011771	CTC	2	6	4740	4745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218847800
129	NC_011771	ATC	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847800
130	NC_011771	A	6	6	4851	4856	100 %	0 %	0 %	0 %	218847803
131	NC_011771	AT	3	6	4885	4890	50 %	50 %	0 %	0 %	218847803
132	NC_011771	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	218847803
133	NC_011771	ACCA	2	8	4977	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	218847803
134	NC_011771	TCCTTC	2	12	5001	5012	0 %	50 %	0 %	50 %	218847803
135	NC_011771	TCA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847803
136	NC_011771	CAA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011771	GTT	2	6	5129	5134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011771	A	6	6	5165	5170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011771	ATGA	2	8	5183	5190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011771	AGG	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011771	AAT	2	6	5426	5431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847805
142	NC_011771	AAAAG	2	10	5473	5482	80 %	0 %	20 %	0 %	218847805
143	NC_011771	GT	3	6	5583	5588	0 %	50 %	50 %	0 %	218847805
144	NC_011771	ACA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847805
145	NC_011771	ATA	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847805
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261	NC_011771	TCC	2	6	10287	10292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_011771	ACTT	2	8	10293	10300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.