MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011731	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011731	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	218442279
3	NC_011731	TAAAT	2	10	2418	2427	60 %	40 %	0 %	0 %	218442299
4	NC_011731	GAAAA	2	10	6918	6927	80 %	0 %	20 %	0 %	218442272
5	NC_011731	CAAAA	2	10	9482	9491	80 %	0 %	0 %	20 %	218442271
6	NC_011731	AATCT	2	10	12177	12186	40 %	40 %	0 %	20 %	218442292
7	NC_011731	GGACT	2	10	12559	12568	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011731	AACTT	2	10	12644	12653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011731	TACTT	2	10	13202	13211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011731	AAAGT	2	10	13302	13311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011731	AGAAA	2	10	14069	14078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011731	ATTAA	2	10	15144	15153	60 %	40 %	0 %	0 %	218442300
13	NC_011731	AGTAA	2	10	15781	15790	60 %	20 %	20 %	0 %	218442294
14	NC_011731	TCACT	2	10	15938	15947	20 %	40 %	0 %	40 %	218442294
15	NC_011731	TTGTT	2	10	16035	16044	0 %	80 %	20 %	0 %	218442293
16	NC_011731	TATGT	2	10	16145	16154	20 %	60 %	20 %	0 %	218442293
17	NC_011731	TTAAA	2	10	19088	19097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011731	GATTT	2	10	21576	21585	20 %	60 %	20 %	0 %	218442285
19	NC_011731	ATTTT	2	10	21627	21636	20 %	80 %	0 %	0 %	218442285
20	NC_011731	CAAAA	2	10	22089	22098	80 %	0 %	0 %	20 %	218442277
21	NC_011731	TTTTG	2	10	22357	22366	0 %	80 %	20 %	0 %	218442278
22	NC_011731	TAAGC	2	10	23128	23137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011731	GAGTT	2	10	24370	24379	20 %	40 %	40 %	0 %	218442304
24	NC_011731	ATAAA	2	10	24815	24824	80 %	20 %	0 %	0 %	218442302
25	NC_011731	ACTTG	2	10	25164	25173	20 %	40 %	20 %	20 %	218442302
26	NC_011731	ATTTT	2	10	25916	25925	20 %	80 %	0 %	0 %	218442295
27	NC_011731	AATTT	2	10	26246	26255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011731	TAAAA	2	10	27314	27323	80 %	20 %	0 %	0 %	218442289
29	NC_011731	ATAAA	2	10	27561	27570	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011731	TTACA	2	10	30162	30171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.