MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-3+10

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011720	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011720	TA	3	6	147	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011720	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011720	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	218202753
5	NC_011720	CA	3	6	2309	2314	50 %	0 %	0 %	50 %	218202748
6	NC_011720	TA	3	6	2432	2437	50 %	50 %	0 %	0 %	218202748
7	NC_011720	AG	3	6	2548	2553	50 %	0 %	50 %	0 %	218202748
8	NC_011720	AT	3	6	2744	2749	50 %	50 %	0 %	0 %	218202737
9	NC_011720	AT	3	6	2978	2983	50 %	50 %	0 %	0 %	218202737
10	NC_011720	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	218202768
11	NC_011720	AT	3	6	4057	4062	50 %	50 %	0 %	0 %	218202730
12	NC_011720	TA	3	6	5366	5371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011720	AT	3	6	5679	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011720	AT	3	6	6088	6093	50 %	50 %	0 %	0 %	218202759
15	NC_011720	AT	3	6	6256	6261	50 %	50 %	0 %	0 %	218202759
16	NC_011720	AT	3	6	6561	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	218202727
17	NC_011720	TA	3	6	7261	7266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011720	AT	3	6	7335	7340	50 %	50 %	0 %	0 %	218202755
19	NC_011720	AT	3	6	7579	7584	50 %	50 %	0 %	0 %	218202755
20	NC_011720	AT	3	6	7633	7638	50 %	50 %	0 %	0 %	218202755
21	NC_011720	AT	3	6	7687	7692	50 %	50 %	0 %	0 %	218202755
22	NC_011720	AT	3	6	8532	8537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011720	TA	3	6	9502	9507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011720	TA	3	6	10870	10875	50 %	50 %	0 %	0 %	218202757
25	NC_011720	TA	3	6	11457	11462	50 %	50 %	0 %	0 %	218202739
26	NC_011720	TA	3	6	11881	11886	50 %	50 %	0 %	0 %	218202784
27	NC_011720	TA	3	6	12196	12201	50 %	50 %	0 %	0 %	218202784
28	NC_011720	AG	3	6	12637	12642	50 %	0 %	50 %	0 %	218202780
29	NC_011720	AT	3	6	13011	13016	50 %	50 %	0 %	0 %	218202745
30	NC_011720	AT	3	6	13615	13620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011720	AT	8	16	13731	13746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011720	TA	3	6	13894	13899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011720	TA	3	6	14288	14293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011720	AG	3	6	14329	14334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011720	TA	3	6	14369	14374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011720	AG	3	6	14786	14791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011720	AG	3	6	14854	14859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011720	GA	3	6	15920	15925	50 %	0 %	50 %	0 %	218202743
39	NC_011720	TA	3	6	16174	16179	50 %	50 %	0 %	0 %	218202743
40	NC_011720	CA	3	6	16706	16711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011720	TG	3	6	16729	16734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011720	AT	3	6	16735	16740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011720	GT	3	6	16916	16921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011720	GA	3	6	18163	18168	50 %	0 %	50 %	0 %	218202736
45	NC_011720	AT	3	6	18985	18990	50 %	50 %	0 %	0 %	218202744
46	NC_011720	GA	3	6	19478	19483	50 %	0 %	50 %	0 %	218202744
47	NC_011720	AT	3	6	19645	19650	50 %	50 %	0 %	0 %	218202744
48	NC_011720	TA	4	8	19963	19970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011720	TG	3	6	19999	20004	0 %	50 %	50 %	0 %	218202742
50	NC_011720	TA	3	6	20050	20055	50 %	50 %	0 %	0 %	218202742
51	NC_011720	AC	3	6	20257	20262	50 %	0 %	0 %	50 %	218202742
52	NC_011720	AT	3	6	20436	20441	50 %	50 %	0 %	0 %	218202742
53	NC_011720	CT	3	6	20607	20612	0 %	50 %	0 %	50 %	218202742
54	NC_011720	TA	3	6	21344	21349	50 %	50 %	0 %	0 %	218202751
55	NC_011720	AG	5	10	21445	21454	50 %	0 %	50 %	0 %	218202751
56	NC_011720	AG	3	6	24645	24650	50 %	0 %	50 %	0 %	218202760
57	NC_011720	AT	3	6	25563	25568	50 %	50 %	0 %	0 %	218202778
58	NC_011720	AT	3	6	25866	25871	50 %	50 %	0 %	0 %	218202756
59	NC_011720	TA	3	6	25882	25887	50 %	50 %	0 %	0 %	218202756
60	NC_011720	TA	3	6	26356	26361	50 %	50 %	0 %	0 %	218202750
61	NC_011720	TA	3	6	27454	27459	50 %	50 %	0 %	0 %	218202734
62	NC_011720	AG	3	6	29125	29130	50 %	0 %	50 %	0 %	218202747
63	NC_011720	CT	3	6	29727	29732	0 %	50 %	0 %	50 %	218202747
64	NC_011720	AC	3	6	30028	30033	50 %	0 %	0 %	50 %	218202747
65	NC_011720	AT	3	6	30137	30142	50 %	50 %	0 %	0 %	218202747
66	NC_011720	TA	3	6	30553	30558	50 %	50 %	0 %	0 %	218202738
67	NC_011720	AT	3	6	31074	31079	50 %	50 %	0 %	0 %	218202731
68	NC_011720	TA	3	6	31571	31576	50 %	50 %	0 %	0 %	218202731
69	NC_011720	TA	3	6	32083	32088	50 %	50 %	0 %	0 %	218202782
70	NC_011720	AT	3	6	32629	32634	50 %	50 %	0 %	0 %	218202746
71	NC_011720	TA	4	8	33020	33027	50 %	50 %	0 %	0 %	218202786
72	NC_011720	AT	3	6	33299	33304	50 %	50 %	0 %	0 %	218202786
73	NC_011720	AT	3	6	33708	33713	50 %	50 %	0 %	0 %	218202775
74	NC_011720	AT	3	6	33905	33910	50 %	50 %	0 %	0 %	218202775
75	NC_011720	CA	3	6	34820	34825	50 %	0 %	0 %	50 %	218202776
76	NC_011720	TA	4	8	34917	34924	50 %	50 %	0 %	0 %	218202776
77	NC_011720	TA	3	6	35022	35027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011720	AT	4	8	35028	35035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011720	AT	3	6	35737	35742	50 %	50 %	0 %	0 %	218202752
80	NC_011720	AT	3	6	36141	36146	50 %	50 %	0 %	0 %	218202779
81	NC_011720	AT	3	6	36407	36412	50 %	50 %	0 %	0 %	218202733
82	NC_011720	TA	3	6	36701	36706	50 %	50 %	0 %	0 %	218202733
83	NC_011720	TA	3	6	37339	37344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011720	TC	4	8	38242	38249	0 %	50 %	0 %	50 %	218202740
85	NC_011720	TA	3	6	38812	38817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011720	AT	3	6	39282	39287	50 %	50 %	0 %	0 %	218202772
87	NC_011720	AC	3	6	39485	39490	50 %	0 %	0 %	50 %	218202777
88	NC_011720	TA	4	8	40421	40428	50 %	50 %	0 %	0 %	218202767
89	NC_011720	TA	3	6	40475	40480	50 %	50 %	0 %	0 %	218202767
90	NC_011720	AT	3	6	40899	40904	50 %	50 %	0 %	0 %	218202773
91	NC_011720	AT	3	6	41341	41346	50 %	50 %	0 %	0 %	218202773
92	NC_011720	TA	3	6	41451	41456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011720	TA	3	6	41600	41605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011720	TG	3	6	41698	41703	0 %	50 %	50 %	0 %	218202761
95	NC_011720	AG	3	6	42030	42035	50 %	0 %	50 %	0 %	218202761
96	NC_011720	CA	3	6	42505	42510	50 %	0 %	0 %	50 %	218202761
97	NC_011720	GT	3	6	43108	43113	0 %	50 %	50 %	0 %	218202766
98	NC_011720	TA	3	6	43433	43438	50 %	50 %	0 %	0 %	218202766
99	NC_011720	GA	3	6	43619	43624	50 %	0 %	50 %	0 %	218202785
100	NC_011720	TA	3	6	43873	43878	50 %	50 %	0 %	0 %	218202785
101	NC_011720	CA	3	6	44405	44410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011720	TG	3	6	44428	44433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011720	AT	3	6	44434	44439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011720	GA	3	6	44509	44514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011720	TA	3	6	44581	44586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011720	AC	3	6	44858	44863	50 %	0 %	0 %	50 %	218202774
107	NC_011720	TG	3	6	46357	46362	0 %	50 %	50 %	0 %	218202770
108	NC_011720	AT	3	6	46699	46704	50 %	50 %	0 %	0 %	218202770
109	NC_011720	AT	3	6	46883	46888	50 %	50 %	0 %	0 %	218202781
110	NC_011720	AT	3	6	47223	47228	50 %	50 %	0 %	0 %	218202781
111	NC_011720	TA	3	6	47540	47545	50 %	50 %	0 %	0 %	218202781
112	NC_011720	AG	3	6	48127	48132	50 %	0 %	50 %	0 %	218202781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.