MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_45

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011656	AGTA	2	8	301	308	50 %	25 %	25 %	0 %	217322970
2	NC_011656	ATTT	2	8	573	580	25 %	75 %	0 %	0 %	217322970
3	NC_011656	TATG	2	8	697	704	25 %	50 %	25 %	0 %	217322970
4	NC_011656	GCTT	2	8	817	824	0 %	50 %	25 %	25 %	217322970
5	NC_011656	GATT	2	8	1099	1106	25 %	50 %	25 %	0 %	217322970
6	NC_011656	ATTC	2	8	1856	1863	25 %	50 %	0 %	25 %	217322927
7	NC_011656	TATG	2	8	1917	1924	25 %	50 %	25 %	0 %	217322927
8	NC_011656	AAAT	2	8	1929	1936	75 %	25 %	0 %	0 %	217322927
9	NC_011656	TACT	2	8	2012	2019	25 %	50 %	0 %	25 %	217322927
10	NC_011656	CAGC	2	8	2080	2087	25 %	0 %	25 %	50 %	217322927
11	NC_011656	AGCT	2	8	2391	2398	25 %	25 %	25 %	25 %	217322927
12	NC_011656	GAAT	2	8	2820	2827	50 %	25 %	25 %	0 %	217322944
13	NC_011656	ATCT	2	8	2849	2856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011656	AATC	2	8	3092	3099	50 %	25 %	0 %	25 %	217322951
15	NC_011656	AATG	2	8	3278	3285	50 %	25 %	25 %	0 %	217322951
16	NC_011656	CAAA	2	8	3558	3565	75 %	0 %	0 %	25 %	217322951
17	NC_011656	CAAA	2	8	4317	4324	75 %	0 %	0 %	25 %	217322951
18	NC_011656	AGAC	2	8	4495	4502	50 %	0 %	25 %	25 %	217322951
19	NC_011656	ACGA	2	8	4773	4780	50 %	0 %	25 %	25 %	217322951
20	NC_011656	AGGG	2	8	5570	5577	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011656	AATG	2	8	5771	5778	50 %	25 %	25 %	0 %	217322955
22	NC_011656	AAAG	2	8	6870	6877	75 %	0 %	25 %	0 %	217322933
23	NC_011656	AAAG	2	8	6926	6933	75 %	0 %	25 %	0 %	217322933
24	NC_011656	GCGG	2	8	7654	7661	0 %	0 %	75 %	25 %	217322933
25	NC_011656	GTAT	2	8	8150	8157	25 %	50 %	25 %	0 %	217322933
26	NC_011656	TGGA	2	8	8191	8198	25 %	25 %	50 %	0 %	217322933
27	NC_011656	GCGG	2	8	8476	8483	0 %	0 %	75 %	25 %	217322933
28	NC_011656	TGTA	2	8	8493	8500	25 %	50 %	25 %	0 %	217322933
29	NC_011656	AATG	2	8	8728	8735	50 %	25 %	25 %	0 %	217322933
30	NC_011656	ATTC	2	8	8749	8756	25 %	50 %	0 %	25 %	217322933
31	NC_011656	AAAG	2	8	9024	9031	75 %	0 %	25 %	0 %	217322933
32	NC_011656	GGGA	2	8	10284	10291	25 %	0 %	75 %	0 %	217322925
33	NC_011656	ACGA	2	8	10438	10445	50 %	0 %	25 %	25 %	217322925
34	NC_011656	TTCC	2	8	10559	10566	0 %	50 %	0 %	50 %	217322954
35	NC_011656	TGAA	2	8	11093	11100	50 %	25 %	25 %	0 %	217322954
36	NC_011656	TGAT	2	8	11360	11367	25 %	50 %	25 %	0 %	217322954
37	NC_011656	TAAG	2	8	11719	11726	50 %	25 %	25 %	0 %	217322958
38	NC_011656	AAGG	2	8	11734	11741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011656	CTTC	2	8	11913	11920	0 %	50 %	0 %	50 %	217322943
40	NC_011656	GATC	2	8	11949	11956	25 %	25 %	25 %	25 %	217322943
41	NC_011656	ATGT	2	8	12140	12147	25 %	50 %	25 %	0 %	217322943
42	NC_011656	ACTT	2	8	12447	12454	25 %	50 %	0 %	25 %	217322973
43	NC_011656	CTTT	2	8	12538	12545	0 %	75 %	0 %	25 %	217322973
44	NC_011656	AGAA	2	8	12639	12646	75 %	0 %	25 %	0 %	217322973
45	NC_011656	AGGT	2	8	12921	12928	25 %	25 %	50 %	0 %	217322973
46	NC_011656	TGAT	2	8	13017	13024	25 %	50 %	25 %	0 %	217322973
47	NC_011656	AGTT	2	8	13482	13489	25 %	50 %	25 %	0 %	217322973
48	NC_011656	TTGT	2	8	13565	13572	0 %	75 %	25 %	0 %	217322973
49	NC_011656	TCTT	2	8	13775	13782	0 %	75 %	0 %	25 %	217322973
50	NC_011656	ATCA	2	8	14553	14560	50 %	25 %	0 %	25 %	217322973
51	NC_011656	GAAA	2	8	15155	15162	75 %	0 %	25 %	0 %	217322966
52	NC_011656	ATTT	2	8	16167	16174	25 %	75 %	0 %	0 %	217322946
53	NC_011656	AAAG	2	8	16972	16979	75 %	0 %	25 %	0 %	217322946
54	NC_011656	AAGT	2	8	17943	17950	50 %	25 %	25 %	0 %	217322946
55	NC_011656	GGAT	2	8	18233	18240	25 %	25 %	50 %	0 %	217322934
56	NC_011656	GGAT	2	8	18290	18297	25 %	25 %	50 %	0 %	217322934
57	NC_011656	CAAT	2	8	18550	18557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011656	TATT	2	8	18748	18755	25 %	75 %	0 %	0 %	217322945
59	NC_011656	AATC	2	8	19517	19524	50 %	25 %	0 %	25 %	217322945
60	NC_011656	AGGT	2	8	19606	19613	25 %	25 %	50 %	0 %	217322945
61	NC_011656	GAAA	2	8	19722	19729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011656	CAGA	2	8	19839	19846	50 %	0 %	25 %	25 %	217322969
63	NC_011656	AACA	2	8	19989	19996	75 %	0 %	0 %	25 %	217322969
64	NC_011656	TAAT	2	8	21006	21013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011656	AGTA	2	8	22087	22094	50 %	25 %	25 %	0 %	217322936
66	NC_011656	TCAT	2	8	22110	22117	25 %	50 %	0 %	25 %	217322936
67	NC_011656	TAAA	2	8	22157	22164	75 %	25 %	0 %	0 %	217322936
68	NC_011656	CATG	2	8	22818	22825	25 %	25 %	25 %	25 %	217322953
69	NC_011656	AAAC	2	8	23144	23151	75 %	0 %	0 %	25 %	217322953
70	NC_011656	TTGT	2	8	24054	24061	0 %	75 %	25 %	0 %	217322939
71	NC_011656	GAAA	2	8	24518	24525	75 %	0 %	25 %	0 %	217322932
72	NC_011656	CCAA	2	8	24561	24568	50 %	0 %	0 %	50 %	217322932
73	NC_011656	GATG	2	8	25267	25274	25 %	25 %	50 %	0 %	217322932
74	NC_011656	ACAA	2	8	25912	25919	75 %	0 %	0 %	25 %	217322976
75	NC_011656	AACC	2	8	26024	26031	50 %	0 %	0 %	50 %	217322976
76	NC_011656	TTAA	2	8	26431	26438	50 %	50 %	0 %	0 %	217322976
77	NC_011656	GATT	2	8	27926	27933	25 %	50 %	25 %	0 %	217322971
78	NC_011656	GATT	2	8	28261	28268	25 %	50 %	25 %	0 %	217322975
79	NC_011656	CAAG	2	8	28493	28500	50 %	0 %	25 %	25 %	217322930
80	NC_011656	AAGG	2	8	28709	28716	50 %	0 %	50 %	0 %	217322930
81	NC_011656	ATAA	2	8	28969	28976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011656	AAGA	2	8	29218	29225	75 %	0 %	25 %	0 %	217322956
83	NC_011656	AAAG	2	8	29350	29357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011656	ACTT	2	8	29637	29644	25 %	50 %	0 %	25 %	217322926
85	NC_011656	GAAA	2	8	30072	30079	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011656	GGAA	2	8	30935	30942	50 %	0 %	50 %	0 %	217322977
87	NC_011656	TAAA	2	8	32199	32206	75 %	25 %	0 %	0 %	217322949
88	NC_011656	AGGG	2	8	32295	32302	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011656	CAAA	2	8	32572	32579	75 %	0 %	0 %	25 %	217322928
90	NC_011656	AAAG	2	8	32814	32821	75 %	0 %	25 %	0 %	217322981
91	NC_011656	GGAA	2	8	33259	33266	50 %	0 %	50 %	0 %	217322942
92	NC_011656	GCTT	2	8	33434	33441	0 %	50 %	25 %	25 %	217322942
93	NC_011656	GGCG	2	8	33726	33733	0 %	0 %	75 %	25 %	217322979
94	NC_011656	AGAA	2	8	33778	33785	75 %	0 %	25 %	0 %	217322979
95	NC_011656	AAAG	2	8	34195	34202	75 %	0 %	25 %	0 %	217322979
96	NC_011656	AAAT	2	8	34284	34291	75 %	25 %	0 %	0 %	217322979
97	NC_011656	CAAG	2	8	34626	34633	50 %	0 %	25 %	25 %	217322979
98	NC_011656	AATA	2	8	34849	34856	75 %	25 %	0 %	0 %	217322979
99	NC_011656	TGAT	2	8	35154	35161	25 %	50 %	25 %	0 %	217322979
100	NC_011656	TGAA	2	8	35298	35305	50 %	25 %	25 %	0 %	217322979
101	NC_011656	GTAT	2	8	36006	36013	25 %	50 %	25 %	0 %	217322979
102	NC_011656	ATGA	2	8	36079	36086	50 %	25 %	25 %	0 %	217322978
103	NC_011656	AACG	2	8	36678	36685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011656	TACA	2	8	36795	36802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011656	TTTA	2	8	37050	37057	25 %	75 %	0 %	0 %	217322941
106	NC_011656	TATT	2	8	37709	37716	25 %	75 %	0 %	0 %	217322963
107	NC_011656	TATT	2	8	37854	37861	25 %	75 %	0 %	0 %	217322963
108	NC_011656	ATCA	2	8	37885	37892	50 %	25 %	0 %	25 %	217322963
109	NC_011656	ATTC	2	8	37899	37906	25 %	50 %	0 %	25 %	217322963
110	NC_011656	GTTT	2	8	38041	38048	0 %	75 %	25 %	0 %	217322963
111	NC_011656	AGGA	2	8	38100	38107	50 %	0 %	50 %	0 %	217322963
112	NC_011656	AACC	2	8	38216	38223	50 %	0 %	0 %	50 %	217322963
113	NC_011656	TCTT	2	8	38412	38419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011656	TTTG	2	8	38714	38721	0 %	75 %	25 %	0 %	217322964
115	NC_011656	CTTT	2	8	38964	38971	0 %	75 %	0 %	25 %	217322938
116	NC_011656	ATAC	2	8	39001	39008	50 %	25 %	0 %	25 %	217322938
117	NC_011656	TTTC	2	8	39214	39221	0 %	75 %	0 %	25 %	217322938
118	NC_011656	AGAT	2	8	39581	39588	50 %	25 %	25 %	0 %	217322938
119	NC_011656	AGGT	2	8	39775	39782	25 %	25 %	50 %	0 %	217322938
120	NC_011656	AATA	2	8	39874	39881	75 %	25 %	0 %	0 %	217322938
121	NC_011656	TAAT	2	8	40381	40388	50 %	50 %	0 %	0 %	217322952
122	NC_011656	CCTT	2	8	40485	40492	0 %	50 %	0 %	50 %	217322968
123	NC_011656	TACA	2	8	40879	40886	50 %	25 %	0 %	25 %	217322968
124	NC_011656	CTTT	2	8	41256	41263	0 %	75 %	0 %	25 %	217322935
125	NC_011656	TAAA	2	8	41504	41511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011656	TTTG	2	8	41662	41669	0 %	75 %	25 %	0 %	217322923
127	NC_011656	TGTT	2	8	42202	42209	0 %	75 %	25 %	0 %	217322972
128	NC_011656	CATG	2	8	42345	42352	25 %	25 %	25 %	25 %	217322972
129	NC_011656	GATA	2	8	42373	42380	50 %	25 %	25 %	0 %	217322972
130	NC_011656	TTAA	2	8	42593	42600	50 %	50 %	0 %	0 %	217322972
131	NC_011656	GAGG	2	8	43089	43096	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011656	TAAA	2	8	43431	43438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011656	ATTT	2	8	43659	43666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011656	TTTC	2	8	44003	44010	0 %	75 %	0 %	25 %	217322959
135	NC_011656	TCTT	2	8	44132	44139	0 %	75 %	0 %	25 %	217322959
136	NC_011656	TGAA	2	8	45067	45074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.