MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_12

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011654	TAG	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011654	TGA	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011654	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
4	NC_011654	GTT	3	9	303	311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316528
5	NC_011654	TCT	2	6	418	423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316528
6	NC_011654	GAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
7	NC_011654	ACT	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316528
8	NC_011654	GAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
9	NC_011654	TTG	2	6	731	736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316528
10	NC_011654	ATG	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
11	NC_011654	CAA	2	6	746	751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316528
12	NC_011654	GAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
13	NC_011654	ATT	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
14	NC_011654	ATT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
15	NC_011654	TAT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
16	NC_011654	TTC	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316528
17	NC_011654	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
18	NC_011654	AGA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
19	NC_011654	AGA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
20	NC_011654	ATT	2	6	1287	1292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011654	TAT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011654	AGA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011654	ATT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011654	TAT	2	6	1446	1451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011654	GGA	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217316519
26	NC_011654	AGA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
27	NC_011654	GAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
28	NC_011654	TAA	3	9	1609	1617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316519
29	NC_011654	TAT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316519
30	NC_011654	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
31	NC_011654	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316519
32	NC_011654	TAT	2	6	1786	1791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316519
33	NC_011654	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
34	NC_011654	GAA	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
35	NC_011654	GAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
36	NC_011654	TAT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011654	TCA	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316530
38	NC_011654	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316530
39	NC_011654	ATA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316530
40	NC_011654	TCT	2	6	2401	2406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011654	ATT	2	6	2482	2487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316518
42	NC_011654	GTT	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316518
43	NC_011654	TGA	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316518
44	NC_011654	TAA	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316518
45	NC_011654	TGT	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011654	ACA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011654	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011654	AGT	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011654	TTA	2	6	3087	3092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011654	CCT	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011654	AGT	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011654	CTT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316526
53	NC_011654	TTG	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316526
54	NC_011654	GAT	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316526
55	NC_011654	GGA	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011654	ATG	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316522
57	NC_011654	GCG	3	9	3631	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217316522
58	NC_011654	TTA	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316522
59	NC_011654	TAG	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011654	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316520
61	NC_011654	GTT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316520
62	NC_011654	TGT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316520
63	NC_011654	GTG	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011654	ATG	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
65	NC_011654	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316524
66	NC_011654	TAA	2	6	4288	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
67	NC_011654	TGA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
68	NC_011654	TGA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
69	NC_011654	TAA	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
70	NC_011654	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217316524
71	NC_011654	ATA	2	6	4629	4634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
72	NC_011654	GTA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
73	NC_011654	ATG	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
74	NC_011654	ATA	2	6	4722	4727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
75	NC_011654	TAA	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
76	NC_011654	ACG	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217316524
77	NC_011654	TGT	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316524
78	NC_011654	AAG	2	6	4914	4919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
79	NC_011654	AGA	2	6	4924	4929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
80	NC_011654	GAA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
81	NC_011654	ATT	2	6	5498	5503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316516
82	NC_011654	TGT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316516
83	NC_011654	CTA	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316516
84	NC_011654	CTT	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011654	TTG	2	6	5747	5752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011654	TAC	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011654	TTA	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011654	GTT	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011654	GTT	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011654	TGG	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011654	TGT	2	6	6048	6053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011654	TGG	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011654	TGG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011654	TAT	2	6	6452	6457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011654	ATT	2	6	6527	6532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011654	GTT	2	6	6555	6560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011654	GGT	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011654	GGT	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011654	TGA	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
100	NC_011654	GTA	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
101	NC_011654	GAT	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
102	NC_011654	TTA	2	6	6894	6899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316523
103	NC_011654	TTG	2	6	7064	7069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316523
104	NC_011654	TTA	2	6	7078	7083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316523
105	NC_011654	AAT	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316523
106	NC_011654	TAA	2	6	7174	7179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316525
107	NC_011654	TAG	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316525
108	NC_011654	GAA	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316525
109	NC_011654	AGA	2	6	7373	7378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316514
110	NC_011654	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316514
111	NC_011654	GAA	2	6	7398	7403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316514
112	NC_011654	CAA	2	6	7473	7478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316514
113	NC_011654	TTA	2	6	7494	7499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316514
114	NC_011654	ATG	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316514
115	NC_011654	CAA	2	6	7704	7709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316514
116	NC_011654	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
117	NC_011654	TCT	2	6	8001	8006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316529
118	NC_011654	AAC	2	6	8035	8040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316529
119	NC_011654	ATT	2	6	8115	8120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
120	NC_011654	TAT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
121	NC_011654	TAG	2	6	8133	8138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316529
122	NC_011654	ATT	2	6	8155	8160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
123	NC_011654	AAC	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316529
124	NC_011654	GAA	2	6	8290	8295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316529
125	NC_011654	TAT	2	6	8309	8314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
126	NC_011654	GAT	2	6	8431	8436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011654	TGT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316531
128	NC_011654	ATT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316531
129	NC_011654	GTA	2	6	8624	8629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316535
130	NC_011654	AAG	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011654	GAA	2	6	9020	9025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011654	TAC	2	6	9059	9064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011654	AAG	2	6	9122	9127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316527
134	NC_011654	AAT	2	6	9145	9150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316527
135	NC_011654	GAT	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
136	NC_011654	GAA	2	6	9194	9199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316527
137	NC_011654	ATG	2	6	9267	9272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
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139	NC_011654	TGT	2	6	9343	9348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316527
140	NC_011654	GTA	2	6	9351	9356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
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148	NC_011654	GAT	3	9	9938	9946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.