MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 62793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011593	GCGG	2	8	108899	108906	0 %	0 %	75 %	25 %	213691011
2502	NC_011593	CAG	2	6	109013	109018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691011
2503	NC_011593	CGGC	2	8	109030	109037	0 %	0 %	50 %	50 %	213691011
2504	NC_011593	GC	3	6	109075	109080	0 %	0 %	50 %	50 %	213691011
2505	NC_011593	GGC	2	6	109090	109095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691011
2506	NC_011593	AGC	2	6	109101	109106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691011
2507	NC_011593	AAC	2	6	109199	109204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691011
2508	NC_011593	CGG	2	6	109207	109212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691011
2509	NC_011593	CGC	2	6	109231	109236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691011
2510	NC_011593	CGC	2	6	109318	109323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691011
2511	NC_011593	ACG	2	6	109350	109355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691011
2512	NC_011593	TCG	2	6	109409	109414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691011
2513	NC_011593	CGGCTG	2	12	109432	109443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	213691011
2514	NC_011593	CCCG	2	8	109455	109462	0 %	0 %	25 %	75 %	213691011
2515	NC_011593	ACC	2	6	109494	109499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691011
2516	NC_011593	AC	3	6	109539	109544	50 %	0 %	0 %	50 %	213691011
2517	NC_011593	GCCG	2	8	109576	109583	0 %	0 %	50 %	50 %	213691011
2518	NC_011593	GGC	2	6	109589	109594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691011
2519	NC_011593	CCG	2	6	109614	109619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691011
2520	NC_011593	GAT	2	6	109691	109696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691011
2521	NC_011593	ATG	2	6	109780	109785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691012
2522	NC_011593	CGC	2	6	109824	109829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691012
2523	NC_011593	ATC	2	6	109831	109836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691012
2524	NC_011593	GCC	2	6	109837	109842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691012
2525	NC_011593	ACG	2	6	109916	109921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691012
2526	NC_011593	CCGCG	2	10	109955	109964	0 %	0 %	40 %	60 %	213691012
2527	NC_011593	CGC	3	9	109989	109997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691012
2528	NC_011593	GGT	2	6	110043	110048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691012
2529	NC_011593	CAC	2	6	110058	110063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691012
2530	NC_011593	TCG	2	6	110093	110098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691012
2531	NC_011593	GCC	2	6	110138	110143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691012
2532	NC_011593	GCA	2	6	110166	110171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691012
2533	NC_011593	ACT	2	6	110243	110248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691012
2534	NC_011593	CAC	2	6	110250	110255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691012
2535	NC_011593	CA	3	6	110282	110287	50 %	0 %	0 %	50 %	213691012
2536	NC_011593	GC	3	6	110311	110316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_011593	GC	3	6	110340	110345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_011593	GCC	2	6	110385	110390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_011593	GCA	2	6	110394	110399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_011593	AGTCG	2	10	110450	110459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2541	NC_011593	T	6	6	110463	110468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_011593	GAT	2	6	110496	110501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_011593	CAG	2	6	110550	110555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_011593	GTTC	2	8	110575	110582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2545	NC_011593	TC	3	6	110581	110586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2546	NC_011593	TTGC	2	8	110613	110620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2547	NC_011593	GGC	2	6	110674	110679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691013
2548	NC_011593	GTCT	2	8	110726	110733	0 %	50 %	25 %	25 %	213691013
2549	NC_011593	TTG	2	6	110750	110755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691013
2550	NC_011593	CGC	2	6	111033	111038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691013
2551	NC_011593	ATA	2	6	111095	111100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213691013
2552	NC_011593	TGC	2	6	111109	111114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691013
2553	NC_011593	GCT	2	6	111120	111125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691013
2554	NC_011593	GCA	2	6	111126	111131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691013
2555	NC_011593	CTT	2	6	111172	111177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691013
2556	NC_011593	CTG	2	6	111201	111206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691013
2557	NC_011593	GAA	2	6	111256	111261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691013
2558	NC_011593	ACC	2	6	111382	111387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691013
2559	NC_011593	CTC	2	6	111418	111423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691013
2560	NC_011593	CAC	2	6	111444	111449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691013
2561	NC_011593	CTT	2	6	111468	111473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691013
2562	NC_011593	ATC	2	6	111487	111492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691013
2563	NC_011593	GATT	2	8	111495	111502	25 %	50 %	25 %	0 %	213691013
2564	NC_011593	CTC	2	6	111589	111594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691013
2565	NC_011593	GCTC	2	8	111613	111620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2566	NC_011593	CGA	2	6	111626	111631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_011593	TGC	2	6	111657	111662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691014
2568	NC_011593	AGT	2	6	111700	111705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691014
2569	NC_011593	TTGG	2	8	111764	111771	0 %	50 %	50 %	0 %	213691014
2570	NC_011593	GAA	2	6	111885	111890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691014
2571	NC_011593	TCA	2	6	112012	112017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691014
2572	NC_011593	CT	4	8	112018	112025	0 %	50 %	0 %	50 %	213691014
2573	NC_011593	CCA	2	6	112076	112081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691014
2574	NC_011593	ATC	2	6	112088	112093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691014
2575	NC_011593	CGG	2	6	112142	112147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691014
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2577	NC_011593	GTTG	2	8	112339	112346	0 %	50 %	50 %	0 %	213691014
2578	NC_011593	CTG	3	9	112357	112365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691014
2579	NC_011593	TGAG	2	8	112379	112386	25 %	25 %	50 %	0 %	213691014
2580	NC_011593	TTG	2	6	112434	112439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691014
2581	NC_011593	AGG	2	6	112452	112457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691014
2582	NC_011593	CCAG	2	8	112512	112519	25 %	0 %	25 %	50 %	213691014
2583	NC_011593	AT	3	6	112522	112527	50 %	50 %	0 %	0 %	213691014
2584	NC_011593	GAG	2	6	112539	112544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691014
2585	NC_011593	TTG	2	6	112629	112634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691014
2586	NC_011593	CCACG	2	10	112685	112694	20 %	0 %	20 %	60 %	213691014
2587	NC_011593	AGCC	2	8	112699	112706	25 %	0 %	25 %	50 %	213691014
2588	NC_011593	TGC	2	6	112854	112859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_011593	GC	3	6	112891	112896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_011593	TCC	2	6	112897	112902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2591	NC_011593	T	6	6	112920	112925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_011593	GGC	2	6	112926	112931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_011593	CAC	3	9	113109	113117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691015
2594	NC_011593	CGTC	2	8	113120	113127	0 %	25 %	25 %	50 %	213691015
2595	NC_011593	CGG	2	6	113229	113234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691015
2596	NC_011593	GCG	2	6	113298	113303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691015
2597	NC_011593	CG	3	6	113302	113307	0 %	0 %	50 %	50 %	213691015
2598	NC_011593	GC	3	6	113318	113323	0 %	0 %	50 %	50 %	213691015
2599	NC_011593	CCG	2	6	113402	113407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691015
2600	NC_011593	CG	3	6	113456	113461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2601	NC_011593	ACG	2	6	113708	113713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691016
2602	NC_011593	GGT	2	6	113719	113724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691016
2603	NC_011593	CGC	2	6	113776	113781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691016
2604	NC_011593	GTC	2	6	113783	113788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691016
2605	NC_011593	GT	3	6	113844	113849	0 %	50 %	50 %	0 %	213691016
2606	NC_011593	GCACA	2	10	113893	113902	40 %	0 %	20 %	40 %	213691016
2607	NC_011593	CCG	2	6	113910	113915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691016
2608	NC_011593	ACG	2	6	113930	113935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691016
2609	NC_011593	GAGC	2	8	113941	113948	25 %	0 %	50 %	25 %	213691016
2610	NC_011593	CAG	2	6	113959	113964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691016
2611	NC_011593	CGC	2	6	113992	113997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691016
2612	NC_011593	CGC	2	6	114040	114045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691016
2613	NC_011593	GCG	2	6	114127	114132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691016
2614	NC_011593	TGC	2	6	114148	114153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691016
2615	NC_011593	CTTGG	2	10	114154	114163	0 %	40 %	40 %	20 %	213691016
2616	NC_011593	CG	3	6	114199	114204	0 %	0 %	50 %	50 %	213691016
2617	NC_011593	GCG	2	6	114212	114217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691016
2618	NC_011593	GTC	2	6	114257	114262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691016
2619	NC_011593	GCG	2	6	114263	114268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691016
2620	NC_011593	CGC	2	6	114274	114279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691016
2621	NC_011593	CCGTG	2	10	114280	114289	0 %	20 %	40 %	40 %	213691016
2622	NC_011593	GTA	2	6	114364	114369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_011593	GCG	2	6	114374	114379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_011593	CGGCAA	2	12	114393	114404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_011593	CGC	2	6	114438	114443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2626	NC_011593	GCC	2	6	114494	114499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2627	NC_011593	AAGGTC	2	12	114521	114532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2628	NC_011593	CGG	3	9	114600	114608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_011593	CG	3	6	114640	114645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_011593	TTGA	2	8	114655	114662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2750	NC_011593	CAG	2	6	120142	120147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2751	NC_011593	GGC	2	6	120148	120153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691023
2752	NC_011593	CAA	2	6	120162	120167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691023
2753	NC_011593	GCCCA	2	10	120169	120178	20 %	0 %	20 %	60 %	213691023
2754	NC_011593	GCA	2	6	120180	120185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2755	NC_011593	CTA	2	6	120246	120251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691023
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2757	NC_011593	CGCAGC	2	12	120302	120313	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	213691023
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2759	NC_011593	CAG	2	6	120367	120372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
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2766	NC_011593	TCCA	2	8	120718	120725	25 %	25 %	0 %	50 %	213691023
2767	NC_011593	CAT	2	6	120765	120770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691023
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2855	NC_011593	CAT	2	6	124124	124129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691024
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2857	NC_011593	CCATCG	2	12	124159	124170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	213691024
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2866	NC_011593	GATC	2	8	124334	124341	25 %	25 %	25 %	25 %	213691024
2867	NC_011593	CGC	2	6	124361	124366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2868	NC_011593	GCCG	2	8	124382	124389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2869	NC_011593	GCG	2	6	124411	124416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2870	NC_011593	T	6	6	124426	124431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2871	NC_011593	GTC	2	6	124432	124437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2873	NC_011593	CGATGC	2	12	124475	124486	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2877	NC_011593	CGT	2	6	124675	124680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2991	NC_011593	CGT	2	6	129502	129507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691029
2992	NC_011593	TCT	2	6	129513	129518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691029
2993	NC_011593	CGG	2	6	129522	129527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691029
2994	NC_011593	CAG	2	6	129535	129540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691029
2995	NC_011593	TGA	2	6	129578	129583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691029
2996	NC_011593	TCG	2	6	129683	129688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691029
2997	NC_011593	CTA	2	6	129726	129731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691029
2998	NC_011593	CGC	2	6	129738	129743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691029
2999	NC_011593	GGC	2	6	129769	129774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691029
3000	NC_011593	CGGG	2	8	129832	129839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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