MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 62793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011593	AGG	2	6	43939	43944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690964
1002	NC_011593	AAC	2	6	43954	43959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690964
1003	NC_011593	CCG	2	6	43986	43991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690964
1004	NC_011593	CG	3	6	43997	44002	0 %	0 %	50 %	50 %	213690964
1005	NC_011593	TGG	2	6	44003	44008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690964
1006	NC_011593	CGTCA	2	10	44059	44068	20 %	20 %	20 %	40 %	213690964
1007	NC_011593	CGAA	2	8	44072	44079	50 %	0 %	25 %	25 %	213690964
1008	NC_011593	CGC	2	6	44089	44094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690964
1009	NC_011593	CGA	2	6	44229	44234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690965
1010	NC_011593	TCT	2	6	44237	44242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690965
1011	NC_011593	GCA	3	9	44316	44324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690965
1012	NC_011593	CAA	2	6	44433	44438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690965
1013	NC_011593	TGC	3	9	44597	44605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690965
1014	NC_011593	CTGC	2	8	44613	44620	0 %	25 %	25 %	50 %	213690965
1015	NC_011593	GTG	2	6	44693	44698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690965
1016	NC_011593	GCC	2	6	44725	44730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690965
1017	NC_011593	ACC	2	6	44731	44736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690965
1018	NC_011593	TGC	2	6	44750	44755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690965
1019	NC_011593	ATG	2	6	44774	44779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690965
1020	NC_011593	TGGG	2	8	44788	44795	0 %	25 %	75 %	0 %	213690965
1021	NC_011593	GAC	2	6	44827	44832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690965
1022	NC_011593	TGG	2	6	45002	45007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690965
1023	NC_011593	GCG	2	6	45012	45017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690965
1024	NC_011593	GGT	2	6	45031	45036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690965
1025	NC_011593	ATC	2	6	45043	45048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690965
1026	NC_011593	TTC	2	6	45055	45060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690965
1027	NC_011593	CAG	2	6	45082	45087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690965
1028	NC_011593	ATG	2	6	45092	45097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690965
1029	NC_011593	GTGG	2	8	45210	45217	0 %	25 %	75 %	0 %	213690965
1030	NC_011593	CCA	2	6	45242	45247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690965
1031	NC_011593	CAG	2	6	45358	45363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690965
1032	NC_011593	CG	3	6	45390	45395	0 %	0 %	50 %	50 %	213690965
1033	NC_011593	AAT	2	6	45409	45414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213690965
1034	NC_011593	ATT	2	6	45460	45465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213690965
1035	NC_011593	AT	3	6	45567	45572	50 %	50 %	0 %	0 %	213690965
1036	NC_011593	GCA	2	6	45645	45650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690965
1037	NC_011593	AAG	2	6	45664	45669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690965
1038	NC_011593	CCCG	2	8	45722	45729	0 %	0 %	25 %	75 %	213690965
1039	NC_011593	TGAT	2	8	45733	45740	25 %	50 %	25 %	0 %	213690965
1040	NC_011593	CG	3	6	45760	45765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_011593	GTT	2	6	45786	45791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011593	CGGT	2	8	45854	45861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_011593	AAG	2	6	45894	45899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011593	CCG	2	6	45904	45909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_011593	GGCTA	2	10	45934	45943	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_011593	CCT	2	6	45975	45980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_011593	ATGGGA	2	12	45989	46000	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011593	GGC	2	6	46114	46119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011593	CG	3	6	46135	46140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_011593	AGA	2	6	46172	46177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011593	GCT	2	6	46190	46195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011593	TGT	2	6	46203	46208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011593	CTG	2	6	46264	46269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011593	CAAGA	2	10	46285	46294	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_011593	TGA	2	6	46353	46358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011593	CGAT	2	8	46559	46566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_011593	TAT	2	6	46603	46608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011593	AAG	2	6	46723	46728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011593	GTTT	2	8	46749	46756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011593	TTA	2	6	46764	46769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011593	ATG	2	6	46777	46782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011593	CGA	2	6	46844	46849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011593	GA	3	6	46885	46890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011593	GAT	2	6	46921	46926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011593	TG	3	6	46951	46956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011593	AGG	2	6	46980	46985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011593	AGG	2	6	47017	47022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690966
1068	NC_011593	ACC	2	6	47085	47090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690966
1069	NC_011593	GCC	2	6	47103	47108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690966
1070	NC_011593	GC	3	6	47185	47190	0 %	0 %	50 %	50 %	213690966
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1072	NC_011593	GGCA	2	8	47248	47255	25 %	0 %	50 %	25 %	213690966
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1075	NC_011593	TG	3	6	47412	47417	0 %	50 %	50 %	0 %	213690966
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1078	NC_011593	GCA	2	6	47762	47767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690966
1079	NC_011593	GAT	2	6	47796	47801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690966
1080	NC_011593	CTG	2	6	47907	47912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690966
1081	NC_011593	TGG	2	6	47950	47955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690966
1082	NC_011593	GAAAA	2	10	48013	48022	80 %	0 %	20 %	0 %	213690966
1083	NC_011593	CGGA	2	8	48047	48054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_011593	AAGT	2	8	48084	48091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011593	CGAAG	2	10	48106	48115	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1086	NC_011593	TCG	2	6	48155	48160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011593	A	6	6	48171	48176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011593	AAC	2	6	48210	48215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011593	CAA	2	6	48229	48234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011593	ACC	2	6	48239	48244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1092	NC_011593	GAC	2	6	48395	48400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690967
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1095	NC_011593	CCA	2	6	48585	48590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690967
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1099	NC_011593	CAT	2	6	48691	48696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690967
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1101	NC_011593	CAA	2	6	48754	48759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690967
1102	NC_011593	ACC	2	6	48794	48799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690967
1103	NC_011593	CGC	2	6	48856	48861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690967
1104	NC_011593	TGG	2	6	48893	48898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690967
1105	NC_011593	AGG	2	6	48912	48917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690967
1106	NC_011593	TCA	2	6	49080	49085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690967
1107	NC_011593	CAC	2	6	49147	49152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690967
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1109	NC_011593	CTG	2	6	49214	49219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690967
1110	NC_011593	CAC	2	6	49238	49243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690967
1111	NC_011593	CGA	2	6	49282	49287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690967
1112	NC_011593	CGG	2	6	49312	49317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690967
1113	NC_011593	GGCG	2	8	49327	49334	0 %	0 %	75 %	25 %	213690967
1114	NC_011593	ACG	2	6	49350	49355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690967
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1117	NC_011593	ATG	2	6	49398	49403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690967
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1119	NC_011593	CGC	2	6	49429	49434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690967
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1122	NC_011593	ACG	2	6	49530	49535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690967
1123	NC_011593	ATT	2	6	49606	49611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011593	ATCA	2	8	49627	49634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_011593	AAT	2	6	49637	49642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011593	AGA	2	6	49741	49746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011593	TCG	2	6	49843	49848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690968
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1129	NC_011593	TCG	2	6	49915	49920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690968
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1253	NC_011593	CA	3	6	56095	56100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1254	NC_011593	GATTGG	2	12	56113	56124	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_011593	GGA	2	6	56232	56237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690973
1257	NC_011593	GAG	2	6	56298	56303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690973
1258	NC_011593	TGA	2	6	56397	56402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690973
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1263	NC_011593	TCA	2	6	56845	56850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_011593	AAT	2	6	56857	56862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_011593	CT	3	6	56878	56883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1266	NC_011593	ATT	2	6	56898	56903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1303	NC_011593	GT	3	6	58735	58740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1304	NC_011593	GCA	2	6	58766	58771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1377	NC_011593	GAT	2	6	62435	62440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690977
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1384	NC_011593	TGC	2	6	62850	62855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690977
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1453	NC_011593	CCGT	2	8	66252	66259	0 %	25 %	25 %	50 %	213690980
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1456	NC_011593	GC	3	6	66343	66348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1474	NC_011593	CCG	2	6	67374	67379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690981
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1500	NC_011593	CTT	2	6	68516	68521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690981

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