MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl27

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011265	GTAA	2	8	151	158	50 %	25 %	25 %	0 %	203288912
2	NC_011265	GAAT	2	8	198	205	50 %	25 %	25 %	0 %	203288912
3	NC_011265	AATT	2	8	314	321	50 %	50 %	0 %	0 %	203288912
4	NC_011265	TATT	2	8	429	436	25 %	75 %	0 %	0 %	203288912
5	NC_011265	GTAG	2	8	508	515	25 %	25 %	50 %	0 %	203288912
6	NC_011265	TGGT	2	8	546	553	0 %	50 %	50 %	0 %	203288912
7	NC_011265	AATA	2	8	2846	2853	75 %	25 %	0 %	0 %	203288915
8	NC_011265	TATT	2	8	2938	2945	25 %	75 %	0 %	0 %	203288915
9	NC_011265	GTTT	2	8	3146	3153	0 %	75 %	25 %	0 %	203288915
10	NC_011265	ATCT	2	8	3245	3252	25 %	50 %	0 %	25 %	203288915
11	NC_011265	TAAA	2	8	3302	3309	75 %	25 %	0 %	0 %	203288915
12	NC_011265	ATTT	2	8	3577	3584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011265	TTCT	2	8	3676	3683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011265	CTTT	2	8	3843	3850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011265	TATT	2	8	4379	4386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011265	AATT	2	8	4433	4440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011265	ATGT	2	8	4571	4578	25 %	50 %	25 %	0 %	203288917
18	NC_011265	TAAA	2	8	5144	5151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011265	TTAT	2	8	5507	5514	25 %	75 %	0 %	0 %	203288918
20	NC_011265	AGAT	2	8	6637	6644	50 %	25 %	25 %	0 %	203288919
21	NC_011265	AGAT	2	8	6790	6797	50 %	25 %	25 %	0 %	203288919
22	NC_011265	AATT	2	8	7360	7367	50 %	50 %	0 %	0 %	203288920
23	NC_011265	CTAT	2	8	7605	7612	25 %	50 %	0 %	25 %	203288920
24	NC_011265	AGAT	2	8	7617	7624	50 %	25 %	25 %	0 %	203288920
25	NC_011265	ACTT	2	8	7960	7967	25 %	50 %	0 %	25 %	203288920
26	NC_011265	CAAA	2	8	8529	8536	75 %	0 %	0 %	25 %	203288921
27	NC_011265	AGAT	2	8	8799	8806	50 %	25 %	25 %	0 %	203288921
28	NC_011265	AGAA	2	8	8879	8886	75 %	0 %	25 %	0 %	203288921
29	NC_011265	GGTT	2	8	9434	9441	0 %	50 %	50 %	0 %	203288922
30	NC_011265	AGAA	2	8	9818	9825	75 %	0 %	25 %	0 %	203288923
31	NC_011265	TTGG	2	8	12233	12240	0 %	50 %	50 %	0 %	203288927
32	NC_011265	CCAT	2	8	12692	12699	25 %	25 %	0 %	50 %	203288928
33	NC_011265	AAGT	2	8	13187	13194	50 %	25 %	25 %	0 %	203288929
34	NC_011265	ATTC	2	8	13672	13679	25 %	50 %	0 %	25 %	203288929
35	NC_011265	TCAA	2	8	14142	14149	50 %	25 %	0 %	25 %	203288930
36	NC_011265	TAGT	2	8	14239	14246	25 %	50 %	25 %	0 %	203288930
37	NC_011265	AACA	2	8	14648	14655	75 %	0 %	0 %	25 %	203288931
38	NC_011265	TCTA	2	8	15152	15159	25 %	50 %	0 %	25 %	203288932
39	NC_011265	GAAA	2	8	15325	15332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011265	CAAA	2	8	15349	15356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011265	ATTA	2	8	15769	15776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011265	GAAA	2	8	16463	16470	75 %	0 %	25 %	0 %	203288933
43	NC_011265	TCAA	2	8	16474	16481	50 %	25 %	0 %	25 %	203288933
44	NC_011265	TTCA	2	8	16569	16576	25 %	50 %	0 %	25 %	203288933
45	NC_011265	TTAG	2	8	16719	16726	25 %	50 %	25 %	0 %	203288933
46	NC_011265	TAAC	2	8	16816	16823	50 %	25 %	0 %	25 %	203288933
47	NC_011265	AAAG	2	8	16830	16837	75 %	0 %	25 %	0 %	203288933
48	NC_011265	ACTA	2	8	17280	17287	50 %	25 %	0 %	25 %	203288934
49	NC_011265	AGTT	2	8	18045	18052	25 %	50 %	25 %	0 %	203288934
50	NC_011265	ACTT	2	8	18983	18990	25 %	50 %	0 %	25 %	203288936
51	NC_011265	CTAT	2	8	19399	19406	25 %	50 %	0 %	25 %	203288937
52	NC_011265	TGAA	2	8	19808	19815	50 %	25 %	25 %	0 %	203288937
53	NC_011265	CATT	2	8	20399	20406	25 %	50 %	0 %	25 %	203288938
54	NC_011265	GAAT	2	8	20595	20602	50 %	25 %	25 %	0 %	203288938
55	NC_011265	ATCA	2	8	20905	20912	50 %	25 %	0 %	25 %	203288939
56	NC_011265	AAAC	2	8	21992	21999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011265	ATGG	2	8	22004	22011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011265	CATA	2	8	23147	23154	50 %	25 %	0 %	25 %	203288942
59	NC_011265	TTGT	2	8	23250	23257	0 %	75 %	25 %	0 %	203288942
60	NC_011265	AATG	2	8	23542	23549	50 %	25 %	25 %	0 %	203288942
61	NC_011265	TTGT	2	8	23800	23807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011265	AATA	2	8	23898	23905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011265	AATT	2	8	23916	23923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011265	ACAT	2	8	24170	24177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011265	AATT	2	8	24721	24728	50 %	50 %	0 %	0 %	203288943
66	NC_011265	TTTC	2	8	25420	25427	0 %	75 %	0 %	25 %	203288944
67	NC_011265	TGAT	2	8	25600	25607	25 %	50 %	25 %	0 %	203288944
68	NC_011265	AAAT	2	8	25951	25958	75 %	25 %	0 %	0 %	203288945
69	NC_011265	TCAT	2	8	26051	26058	25 %	50 %	0 %	25 %	203288945
70	NC_011265	TGTT	2	8	26914	26921	0 %	75 %	25 %	0 %	203288946
71	NC_011265	TATT	2	8	27257	27264	25 %	75 %	0 %	0 %	203288946
72	NC_011265	ATTT	2	8	27439	27446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.