MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	ATCTTT	2	12	5083	5094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203288891
2	NC_011264	GCACCA	3	18	6579	6596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	203288892
3	NC_011264	TCTCAA	2	12	8768	8779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
4	NC_011264	TAGCAT	2	12	9766	9777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011264	CATCAC	2	12	12870	12881	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	203288894
6	NC_011264	CTGCCT	2	12	13558	13569	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	203288895
7	NC_011264	ATATTA	2	12	14447	14458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011264	TTAAAT	2	12	16006	16017	50 %	50 %	0 %	0 %	203288898
9	NC_011264	AGATGA	2	12	17659	17670	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	203288900
10	NC_011264	AATATA	2	12	17905	17916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011264	GATATT	2	12	20874	20885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203288902
12	NC_011264	TTGCAT	2	12	21920	21931	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	203288904
13	NC_011264	TTTAAG	2	12	22410	22421	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011264	ATAGAA	2	12	22953	22964	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011264	ATTGTT	2	12	24636	24647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011264	TAAAGT	2	12	25925	25936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011264	AAAGAA	4	24	27815	27838	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203288906
18	NC_011264	AAGATA	2	12	28547	28558	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	203288906
19	NC_011264	TAAATA	2	12	29322	29333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011264	AAGGAG	2	12	29735	29746	50 %	0 %	50 %	0 %	203288907
21	NC_011264	AAAGAG	2	12	31321	31332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288910

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.