MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	CCTT	2	8	2	9	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011264	ATTA	2	8	316	323	50 %	50 %	0 %	0 %	203288889
3	NC_011264	CATT	2	8	360	367	25 %	50 %	0 %	25 %	203288889
4	NC_011264	TTGT	2	8	389	396	0 %	75 %	25 %	0 %	203288889
5	NC_011264	TTCT	2	8	441	448	0 %	75 %	0 %	25 %	203288889
6	NC_011264	TAAA	2	8	870	877	75 %	25 %	0 %	0 %	203288889
7	NC_011264	AAAT	2	8	1060	1067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011264	TTTA	2	8	1491	1498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011264	TTTA	2	8	1808	1815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011264	TTCC	2	8	2684	2691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011264	TCTT	2	8	2998	3005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011264	TTTC	2	8	3356	3363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011264	CTAT	2	8	3449	3456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011264	TTAA	2	8	3644	3651	50 %	50 %	0 %	0 %	203288890
15	NC_011264	TTCC	2	8	4548	4555	0 %	50 %	0 %	50 %	203288890
16	NC_011264	ATTC	2	8	4645	4652	25 %	50 %	0 %	25 %	203288890
17	NC_011264	AAAT	2	8	4707	4714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011264	TTAT	2	8	4892	4899	25 %	75 %	0 %	0 %	203288891
19	NC_011264	CTTA	2	8	4957	4964	25 %	50 %	0 %	25 %	203288891
20	NC_011264	ATTT	2	8	5601	5608	25 %	75 %	0 %	0 %	203288891
21	NC_011264	TTAC	2	8	5934	5941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011264	CTTA	2	8	6092	6099	25 %	50 %	0 %	25 %	203288892
23	NC_011264	ATTT	2	8	6694	6701	25 %	75 %	0 %	0 %	203288892
24	NC_011264	ATTC	2	8	7055	7062	25 %	50 %	0 %	25 %	203288892
25	NC_011264	AAAT	2	8	7128	7135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011264	ATTA	2	8	7251	7258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011264	TTAT	2	8	7304	7311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011264	CTCC	2	8	7910	7917	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_011264	CTTA	2	8	7923	7930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011264	CTTA	2	8	7995	8002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011264	AATA	2	8	8334	8341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011264	TAAA	2	8	8384	8391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011264	ACTT	2	8	8449	8456	25 %	50 %	0 %	25 %	203288893
34	NC_011264	ACTA	2	8	8832	8839	50 %	25 %	0 %	25 %	203288893
35	NC_011264	CTTC	2	8	9266	9273	0 %	50 %	0 %	50 %	203288893
36	NC_011264	TTTA	2	8	9679	9686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011264	TCGC	2	8	9949	9956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011264	ATTT	2	8	10386	10393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011264	ATTC	2	8	10750	10757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011264	CTTT	2	8	10830	10837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011264	TACA	2	8	10900	10907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011264	ATTA	2	8	11001	11008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011264	ATTA	2	8	11016	11023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011264	TTAT	2	8	11069	11076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011264	TCTT	2	8	11255	11262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011264	TCTT	2	8	11279	11286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011264	CTTT	2	8	11540	11547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011264	TTTA	2	8	11770	11777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011264	ATTT	2	8	12079	12086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011264	TACT	2	8	12782	12789	25 %	50 %	0 %	25 %	203288894
51	NC_011264	TCCT	2	8	12840	12847	0 %	50 %	0 %	50 %	203288894
52	NC_011264	ATTA	2	8	13135	13142	50 %	50 %	0 %	0 %	203288895
53	NC_011264	TCCT	2	8	13385	13392	0 %	50 %	0 %	50 %	203288895
54	NC_011264	TCTT	2	8	13398	13405	0 %	75 %	0 %	25 %	203288895
55	NC_011264	ATTT	2	8	14168	14175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011264	AAAC	2	8	15003	15010	75 %	0 %	0 %	25 %	203288896
57	NC_011264	ATCC	2	8	15047	15054	25 %	25 %	0 %	50 %	203288896
58	NC_011264	ATTT	2	8	15081	15088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011264	ATTA	2	8	15273	15280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011264	TTCT	2	8	15569	15576	0 %	75 %	0 %	25 %	203288897
61	NC_011264	AAAG	2	8	15848	15855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011264	CTTC	2	8	16566	16573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011264	TATT	2	8	16756	16763	25 %	75 %	0 %	0 %	203288899
64	NC_011264	CTTG	2	8	16789	16796	0 %	50 %	25 %	25 %	203288899
65	NC_011264	TAAT	2	8	16828	16835	50 %	50 %	0 %	0 %	203288899
66	NC_011264	TACT	2	8	17113	17120	25 %	50 %	0 %	25 %	203288899
67	NC_011264	TCCT	2	8	17287	17294	0 %	50 %	0 %	50 %	203288899
68	NC_011264	TAAA	2	8	17476	17483	75 %	25 %	0 %	0 %	203288899
69	NC_011264	AATC	2	8	17566	17573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011264	ATTT	2	8	17832	17839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011264	ATCT	2	8	17923	17930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011264	CTTT	2	8	18175	18182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011264	CTTA	2	8	18185	18192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011264	TTGC	2	8	18212	18219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011264	TCCA	2	8	18421	18428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011264	ATCA	2	8	18855	18862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011264	CTAT	2	8	19463	19470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011264	TTAT	2	8	19511	19518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011264	TAAG	2	8	20033	20040	50 %	25 %	25 %	0 %	203288901
80	NC_011264	TTTC	2	8	20170	20177	0 %	75 %	0 %	25 %	203288901
81	NC_011264	TTGA	2	8	21034	21041	25 %	50 %	25 %	0 %	203288902
82	NC_011264	GAAT	2	8	21204	21211	50 %	25 %	25 %	0 %	203288903
83	NC_011264	ATCT	2	8	21370	21377	25 %	50 %	0 %	25 %	203288903
84	NC_011264	TAAA	2	8	21394	21401	75 %	25 %	0 %	0 %	203288903
85	NC_011264	TTGT	2	8	21948	21955	0 %	75 %	25 %	0 %	203288904
86	NC_011264	TATT	2	8	21988	21995	25 %	75 %	0 %	0 %	203288904
87	NC_011264	TATG	2	8	22008	22015	25 %	50 %	25 %	0 %	203288904
88	NC_011264	TTAG	2	8	22126	22133	25 %	50 %	25 %	0 %	203288904
89	NC_011264	ATTT	2	8	22431	22438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011264	TAAT	2	8	22530	22537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011264	AGAT	2	8	22777	22784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011264	AGAT	2	8	22843	22850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011264	ATTT	2	8	23348	23355	25 %	75 %	0 %	0 %	203288905
94	NC_011264	GATA	2	8	23397	23404	50 %	25 %	25 %	0 %	203288905
95	NC_011264	TGAT	2	8	23924	23931	25 %	50 %	25 %	0 %	203288905
96	NC_011264	ATTA	2	8	23934	23941	50 %	50 %	0 %	0 %	203288905
97	NC_011264	TGAT	2	8	24254	24261	25 %	50 %	25 %	0 %	203288905
98	NC_011264	TTTG	2	8	24606	24613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011264	ATTT	2	8	24673	24680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011264	AGGA	2	8	24696	24703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011264	AATT	2	8	24773	24780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011264	AAGA	2	8	25784	25791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011264	AAAG	2	8	25941	25948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011264	AATC	2	8	26210	26217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011264	TAAG	2	8	26456	26463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011264	AGCT	2	8	26496	26503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011264	ATAA	6	24	26579	26602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011264	TTAT	2	8	26627	26634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011264	GAAT	2	8	26669	26676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011264	TTGG	2	8	27069	27076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011264	CAAG	2	8	27275	27282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011264	AAAT	2	8	27298	27305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011264	TGTT	2	8	27696	27703	0 %	75 %	25 %	0 %	203288906
114	NC_011264	AGAA	2	8	27813	27820	75 %	0 %	25 %	0 %	203288906
115	NC_011264	ATGA	2	8	28163	28170	50 %	25 %	25 %	0 %	203288906
116	NC_011264	TAAC	2	8	28737	28744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011264	AATT	2	8	29299	29306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011264	GAAG	2	8	29652	29659	50 %	0 %	50 %	0 %	203288907
119	NC_011264	AATT	2	8	29978	29985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011264	AATT	2	8	30048	30055	50 %	50 %	0 %	0 %	203288908
121	NC_011264	AATA	2	8	30067	30074	75 %	25 %	0 %	0 %	203288908
122	NC_011264	GATT	2	8	30235	30242	25 %	50 %	25 %	0 %	203288908
123	NC_011264	AGAT	2	8	30252	30259	50 %	25 %	25 %	0 %	203288908
124	NC_011264	AGAT	2	8	30285	30292	50 %	25 %	25 %	0 %	203288908
125	NC_011264	AATT	2	8	30487	30494	50 %	50 %	0 %	0 %	203288908
126	NC_011264	AAGT	2	8	30514	30521	50 %	25 %	25 %	0 %	203288908
127	NC_011264	ATTT	2	8	30742	30749	25 %	75 %	0 %	0 %	203288909
128	NC_011264	TGAT	2	8	30773	30780	25 %	50 %	25 %	0 %	203288909
129	NC_011264	TAAT	2	8	31572	31579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.