MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 1690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011260	TC	3	6	16172	16177	0 %	50 %	0 %	50 %	203288447
502	NC_011260	AT	3	6	16192	16197	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
503	NC_011260	TA	3	6	16211	16216	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
504	NC_011260	TTA	2	6	16221	16226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288447
505	NC_011260	GCTA	2	8	16244	16251	25 %	25 %	25 %	25 %	203288447
506	NC_011260	TCT	2	6	16266	16271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288447
507	NC_011260	A	6	6	16290	16295	100 %	0 %	0 %	0 %	203288447
508	NC_011260	CAA	2	6	16319	16324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288447
509	NC_011260	AT	3	6	16367	16372	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
510	NC_011260	TAA	2	6	16409	16414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288447
511	NC_011260	ACT	2	6	16466	16471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288447
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513	NC_011260	TAT	2	6	16520	16525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288447
514	NC_011260	TAA	2	6	16547	16552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288447
515	NC_011260	TAAA	2	8	16582	16589	75 %	25 %	0 %	0 %	203288447
516	NC_011260	CTT	2	6	16646	16651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288447
517	NC_011260	ATTAAT	2	12	16670	16681	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
518	NC_011260	ATT	2	6	16682	16687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288447
519	NC_011260	T	6	6	16686	16691	0 %	100 %	0 %	0 %	203288447
520	NC_011260	AT	4	8	16700	16707	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
521	NC_011260	ACA	2	6	16716	16721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288447
522	NC_011260	TAA	2	6	16747	16752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288447
523	NC_011260	TAG	2	6	16759	16764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288447
524	NC_011260	CAA	2	6	16814	16819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288447
525	NC_011260	ATT	2	6	16881	16886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288447
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528	NC_011260	TAA	2	6	16927	16932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288448
529	NC_011260	TTTC	2	8	16933	16940	0 %	75 %	0 %	25 %	203288448
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531	NC_011260	T	7	7	17012	17018	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
532	NC_011260	T	6	6	17020	17025	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
533	NC_011260	AC	3	6	17058	17063	50 %	0 %	0 %	50 %	203288448
534	NC_011260	T	6	6	17068	17073	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
535	NC_011260	TA	3	6	17086	17091	50 %	50 %	0 %	0 %	203288448
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542	NC_011260	TTA	2	6	17291	17296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288448
543	NC_011260	CTA	2	6	17345	17350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288448
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588	NC_011260	TATT	2	8	18524	18531	25 %	75 %	0 %	0 %	203288449
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593	NC_011260	AAGAGA	2	12	18822	18833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_011260	TA	3	6	19052	19057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_011260	TA	4	8	19165	19172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_011260	TAA	2	6	19322	19327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011260	CATTA	2	10	19328	19337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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614	NC_011260	TAA	2	6	19412	19417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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616	NC_011260	GTA	2	6	19595	19600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_011260	ATA	2	6	19729	19734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011260	T	8	8	19756	19763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011260	ATC	2	6	19784	19789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011260	TTG	2	6	19829	19834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011260	ATT	3	9	19838	19846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011260	AT	3	6	19853	19858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_011260	T	7	7	19958	19964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011260	A	6	6	19994	19999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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633	NC_011260	TA	3	6	20076	20081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011260	ATT	2	6	20103	20108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288450
635	NC_011260	AATA	2	8	20251	20258	75 %	25 %	0 %	0 %	203288450
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637	NC_011260	TATT	2	8	20343	20350	25 %	75 %	0 %	0 %	203288450
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643	NC_011260	TAT	2	6	20544	20549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288450
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662	NC_011260	CTTT	2	8	21247	21254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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776	NC_011260	T	6	6	24994	24999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_011260	AAC	2	6	29082	29087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288453
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925	NC_011260	CACT	2	8	29186	29193	25 %	25 %	0 %	50 %	203288453
926	NC_011260	TACT	2	8	29207	29214	25 %	50 %	0 %	25 %	203288453
927	NC_011260	CTT	2	6	29228	29233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288453
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941	NC_011260	CTTC	2	8	29567	29574	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
942	NC_011260	CTT	2	6	29616	29621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288453
943	NC_011260	CAC	2	6	29763	29768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288453
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946	NC_011260	CTTC	2	8	29823	29830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
947	NC_011260	TCT	2	6	29834	29839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
948	NC_011260	ACA	2	6	29866	29871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
949	NC_011260	AAC	2	6	29872	29877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
950	NC_011260	CTAT	2	8	29888	29895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
951	NC_011260	CAG	2	6	29926	29931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
952	NC_011260	TG	3	6	29946	29951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
953	NC_011260	A	6	6	29953	29958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
954	NC_011260	TTAAAT	2	12	30030	30041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
955	NC_011260	AGTA	2	8	30132	30139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
956	NC_011260	ATCA	2	8	30143	30150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
957	NC_011260	GTA	2	6	30220	30225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
958	NC_011260	TGAA	2	8	30231	30238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
959	NC_011260	ATA	2	6	30242	30247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
960	NC_011260	AAATA	2	10	30263	30272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
961	NC_011260	T	7	7	30273	30279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
962	NC_011260	A	7	7	30289	30295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
963	NC_011260	TTATT	3	15	30349	30363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
964	NC_011260	T	7	7	30362	30368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
965	NC_011260	TAGCAT	2	12	30434	30445	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288454
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972	NC_011260	CAG	2	6	30683	30688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288454
973	NC_011260	AAC	2	6	30708	30713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288454
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981	NC_011260	CCA	2	6	31072	31077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288454
982	NC_011260	TTATC	2	10	31079	31088	20 %	60 %	0 %	20 %	203288454
983	NC_011260	TTCTT	2	10	31144	31153	0 %	80 %	0 %	20 %	203288454
984	NC_011260	TTCAT	2	10	31156	31165	20 %	60 %	0 %	20 %	203288454
985	NC_011260	TTA	2	6	31174	31179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288454
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988	NC_011260	TTC	2	6	31351	31356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288454
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996	NC_011260	AAAT	2	8	31509	31516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
997	NC_011260	CAT	2	6	31561	31566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1000	NC_011260	ATT	2	6	31674	31679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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