MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	ATTGT	2	10	2162	2171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011256	AATAA	2	10	3555	3564	80 %	20 %	0 %	0 %	203288754
3	NC_011256	AAGTA	2	10	4231	4240	60 %	20 %	20 %	0 %	203288754
4	NC_011256	TTTGA	2	10	5185	5194	20 %	60 %	20 %	0 %	203288754
5	NC_011256	TTCAT	2	10	6479	6488	20 %	60 %	0 %	20 %	203288754
6	NC_011256	CAATA	2	10	7233	7242	60 %	20 %	0 %	20 %	203288755
7	NC_011256	CTTGA	2	10	7720	7729	20 %	40 %	20 %	20 %	203288756
8	NC_011256	CTTCT	2	10	10270	10279	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011256	GTTTT	2	10	14414	14423	0 %	80 %	20 %	0 %	203288763
10	NC_011256	CTTGA	2	10	17971	17980	20 %	40 %	20 %	20 %	203288767
11	NC_011256	TGAGT	2	10	18789	18798	20 %	40 %	40 %	0 %	203288767
12	NC_011256	AAGAA	2	10	19674	19683	80 %	0 %	20 %	0 %	203288768
13	NC_011256	ATCAA	2	10	20531	20540	60 %	20 %	0 %	20 %	203288770
14	NC_011256	ACAAT	2	10	21520	21529	60 %	20 %	0 %	20 %	203288772
15	NC_011256	AAAAT	2	10	21734	21743	80 %	20 %	0 %	0 %	203288772
16	NC_011256	ATAAA	2	10	21785	21794	80 %	20 %	0 %	0 %	203288772
17	NC_011256	AAATG	2	10	22875	22884	60 %	20 %	20 %	0 %	203288773
18	NC_011256	GAAAA	2	10	23526	23535	80 %	0 %	20 %	0 %	203288773
19	NC_011256	ATTAT	2	10	26213	26222	40 %	60 %	0 %	0 %	203288776
20	NC_011256	ATATT	2	10	26308	26317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011256	ACGTT	2	10	30662	30671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011256	TTTAA	2	10	30868	30877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011256	CTTTA	2	10	31353	31362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011256	TTAAC	2	10	31402	31411	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011256	TAAAA	2	10	31473	31482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011256	TCAAA	2	10	32601	32610	60 %	20 %	0 %	20 %	203288779
27	NC_011256	TAAAA	2	10	32682	32691	80 %	20 %	0 %	0 %	203288779
28	NC_011256	TAATT	2	10	35367	35376	40 %	60 %	0 %	0 %	203288780
29	NC_011256	AAAAT	2	10	36604	36613	80 %	20 %	0 %	0 %	203288781
30	NC_011256	TTATT	2	10	38302	38311	20 %	80 %	0 %	0 %	203288783
31	NC_011256	ATTAT	2	10	38526	38535	40 %	60 %	0 %	0 %	203288783
32	NC_011256	ATTTT	2	10	39574	39583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011256	ATTTT	2	10	39678	39687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011256	GAAGG	2	10	43483	43492	40 %	0 %	60 %	0 %	203288787
35	NC_011256	AGATA	2	10	44355	44364	60 %	20 %	20 %	0 %	203288787
36	NC_011256	TAAAT	2	10	44460	44469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011256	ATTAA	2	10	46254	46263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011256	ATTTT	2	10	46787	46796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011256	GATAA	2	10	47295	47304	60 %	20 %	20 %	0 %	203288789
40	NC_011256	AAAGT	2	10	48020	48029	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011256	TTTTA	2	10	48068	48077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011256	TTTAT	2	10	48166	48175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011256	ATTTT	2	10	48464	48473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011256	AAAAG	2	10	48487	48496	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011256	AGATA	2	10	49179	49188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011256	AGGTG	2	10	50261	50270	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011256	TATGT	2	10	50978	50987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011256	AGAGA	2	10	51145	51154	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011256	AGGAG	2	10	51160	51169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011256	AGATA	2	10	51457	51466	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011256	AAATT	2	10	52162	52171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011256	GATAA	2	10	53627	53636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011256	ATAAG	2	10	53910	53919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011256	AAAAT	2	10	54387	54396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011256	AGTTA	2	10	55594	55603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011256	TTTTA	2	10	55612	55621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011256	TGTTA	2	10	55705	55714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011256	ATATT	2	10	55740	55749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011256	ATTTT	2	10	56916	56925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011256	AGGGA	2	10	58228	58237	40 %	0 %	60 %	0 %	203288793
61	NC_011256	GGAAG	2	10	58369	58378	40 %	0 %	60 %	0 %	203288793
62	NC_011256	GATAA	2	10	58643	58652	60 %	20 %	20 %	0 %	203288793
63	NC_011256	TTTTA	2	10	59388	59397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011256	AGGTG	2	10	60212	60221	20 %	20 %	60 %	0 %	203288794
65	NC_011256	ATAAA	2	10	60644	60653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011256	GGAAG	2	10	61164	61173	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011256	AAGTA	2	10	62221	62230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011256	ATGGT	2	10	62236	62245	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011256	GCAAT	2	10	63918	63927	40 %	20 %	20 %	20 %	203288796
70	NC_011256	ACAAA	2	10	64196	64205	80 %	0 %	0 %	20 %	203288796
71	NC_011256	GAAAT	2	10	64403	64412	60 %	20 %	20 %	0 %	203288796
72	NC_011256	ATTGT	2	10	65048	65057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011256	TATAT	2	10	65782	65791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.