MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl35

Total Repeats: 1042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011255	AT	3	6	17191	17196	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
502	NC_011255	AAT	2	6	17248	17253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288408
503	NC_011255	TA	3	6	17371	17376	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
504	NC_011255	CCA	2	6	17389	17394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288408
505	NC_011255	ATT	2	6	17435	17440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288408
506	NC_011255	CAG	2	6	17456	17461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288408
507	NC_011255	T	6	6	17497	17502	0 %	100 %	0 %	0 %	203288408
508	NC_011255	T	8	8	17531	17538	0 %	100 %	0 %	0 %	203288408
509	NC_011255	TTA	2	6	17540	17545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288408
510	NC_011255	ATA	2	6	17561	17566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288408
511	NC_011255	ATT	2	6	17577	17582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288408
512	NC_011255	ATTC	2	8	17590	17597	25 %	50 %	0 %	25 %	203288408
513	NC_011255	T	6	6	17607	17612	0 %	100 %	0 %	0 %	203288408
514	NC_011255	ATA	2	6	17660	17665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288408
515	NC_011255	TTTTGA	2	12	17667	17678	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	203288408
516	NC_011255	TA	3	6	17686	17691	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
517	NC_011255	TTAA	2	8	17710	17717	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
518	NC_011255	T	7	7	17718	17724	0 %	100 %	0 %	0 %	203288408
519	NC_011255	ATTA	2	8	17731	17738	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
520	NC_011255	AATATA	2	12	17768	17779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011255	TAA	3	9	17870	17878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288409
522	NC_011255	GAA	2	6	17880	17885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288409
523	NC_011255	A	6	6	17915	17920	100 %	0 %	0 %	0 %	203288409
524	NC_011255	TAA	2	6	17954	17959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288409
525	NC_011255	TAT	2	6	18003	18008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288409
526	NC_011255	A	6	6	18044	18049	100 %	0 %	0 %	0 %	203288409
527	NC_011255	ATT	2	6	18079	18084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288409
528	NC_011255	GCA	2	6	18093	18098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288409
529	NC_011255	AGA	2	6	18104	18109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288409
530	NC_011255	AGA	2	6	18119	18124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288409
531	NC_011255	TTG	2	6	18165	18170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288409
532	NC_011255	CAAAA	2	10	18202	18211	80 %	0 %	0 %	20 %	203288409
533	NC_011255	A	8	8	18267	18274	100 %	0 %	0 %	0 %	203288409
534	NC_011255	T	6	6	18290	18295	0 %	100 %	0 %	0 %	203288409
535	NC_011255	AT	3	6	18397	18402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011255	AT	3	6	18433	18438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011255	T	8	8	18449	18456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011255	TTTA	2	8	18474	18481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011255	TGT	2	6	18487	18492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011255	TTG	2	6	18502	18507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011255	ATC	2	6	18529	18534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011255	T	6	6	18576	18581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011255	ATGC	2	8	18589	18596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_011255	TAA	2	6	18641	18646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011255	GTT	2	6	18651	18656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011255	T	6	6	18671	18676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011255	TAT	2	6	18697	18702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011255	T	7	7	18716	18722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011255	AGT	2	6	18744	18749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011255	TAT	2	6	18759	18764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011255	A	7	7	18811	18817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011255	TAA	2	6	18819	18824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011255	GAAT	2	8	18836	18843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011255	CAA	2	6	18844	18849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011255	CAA	2	6	18862	18867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_011255	TTA	2	6	18869	18874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011255	ATA	3	9	18911	18919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011255	GTAA	2	8	18931	18938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011255	TGG	2	6	19039	19044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011255	GCT	2	6	19049	19054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_011255	AAG	2	6	19096	19101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011255	A	6	6	19128	19133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011255	TGA	2	6	19160	19165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011255	TATT	2	8	19175	19182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011255	ATA	2	6	19186	19191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011255	GTAG	2	8	19254	19261	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011255	TTG	2	6	19273	19278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011255	CAA	2	6	19282	19287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011255	TGGT	2	8	19292	19299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011255	AAT	2	6	19305	19310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011255	T	6	6	19397	19402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011255	TGA	2	6	19528	19533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011255	AAT	2	6	19559	19564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011255	ATG	2	6	19580	19585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011255	TCT	2	6	19630	19635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011255	ATT	2	6	19699	19704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011255	ATT	2	6	19722	19727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011255	AATTA	2	10	19740	19749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011255	CAGA	2	8	19850	19857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_011255	A	6	6	19861	19866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011255	AT	3	6	19926	19931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011255	ATA	2	6	19965	19970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011255	AT	3	6	19992	19997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011255	ATTA	2	8	20041	20048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011255	TTA	2	6	20062	20067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011255	TA	3	6	20102	20107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_011255	GAT	2	6	20158	20163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011255	TAA	2	6	20172	20177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011255	TAA	2	6	20187	20192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011255	TA	3	6	20215	20220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011255	ATT	2	6	20237	20242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011255	A	6	6	20243	20248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011255	ACA	2	6	20267	20272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011255	ATG	2	6	20280	20285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011255	ATG	3	9	20343	20351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011255	TAA	2	6	20372	20377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011255	TAG	2	6	20423	20428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011255	TAA	2	6	20462	20467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011255	GTGA	2	8	20488	20495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011255	T	6	6	20511	20516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011255	TAT	2	6	20524	20529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011255	GTT	3	9	20580	20588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011255	TAT	2	6	20610	20615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011255	ATT	2	6	20652	20657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011255	TA	3	6	20798	20803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011255	AT	3	6	20816	20821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011255	ACA	2	6	20828	20833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011255	ATA	2	6	20839	20844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011255	GTT	2	6	20873	20878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011255	ATT	2	6	20894	20899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011255	ATT	2	6	20951	20956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011255	ATTA	2	8	20986	20993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011255	T	7	7	21024	21030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011255	TTA	2	6	21032	21037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011255	CAA	2	6	21140	21145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_011255	ATA	2	6	21146	21151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011255	ATC	2	6	21200	21205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011255	AT	3	6	21247	21252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011255	AT	3	6	21264	21269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011255	T	7	7	21297	21303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011255	ATT	2	6	21312	21317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011255	AATT	2	8	21341	21348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011255	T	7	7	21369	21375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011255	TAAAA	2	10	21398	21407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011255	A	6	6	21404	21409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011255	CTT	2	6	21431	21436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011255	GTA	2	6	21448	21453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011255	AT	3	6	21454	21459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011255	ATGTT	2	10	21467	21476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011255	TA	3	6	21486	21491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011255	ATT	2	6	21513	21518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011255	GTT	2	6	21593	21598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011255	AATA	2	8	21661	21668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011255	AT	3	6	21678	21683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011255	TATT	2	8	21753	21760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011255	TAT	2	6	21762	21767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011255	T	6	6	21786	21791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011255	TTA	2	6	21879	21884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_011255	CTT	2	6	21913	21918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_011255	GTTT	2	8	21961	21968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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