MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33

Total Repeats: 1015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011253	TCT	2	6	16259	16264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288392
502	NC_011253	TGG	2	6	16303	16308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288392
503	NC_011253	TAA	2	6	16373	16378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288392
504	NC_011253	TTA	2	6	16442	16447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011253	TGG	2	6	16645	16650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011253	AATTA	2	10	16660	16669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011253	T	7	7	16703	16709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011253	TG	3	6	16722	16727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011253	TGA	2	6	16732	16737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011253	TAA	2	6	16745	16750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011253	AAT	2	6	16754	16759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011253	AAGGA	2	10	16796	16805	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011253	AGA	2	6	16899	16904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011253	AGGTA	2	10	16929	16938	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011253	GAA	2	6	16969	16974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011253	AGC	2	6	16986	16991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011253	GTT	2	6	17032	17037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011253	AAT	2	6	17040	17045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011253	TTA	2	6	17058	17063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011253	CT	3	6	17079	17084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_011253	T	7	7	17084	17090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011253	TA	3	6	17111	17116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011253	T	6	6	17133	17138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011253	A	8	8	17158	17165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011253	TAA	2	6	17166	17171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011253	A	8	8	17170	17177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011253	AGG	2	6	17180	17185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011253	AG	4	8	17198	17205	50 %	0 %	50 %	0 %	203288393
529	NC_011253	A	6	6	17206	17211	100 %	0 %	0 %	0 %	203288393
530	NC_011253	AGT	2	6	17229	17234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288393
531	NC_011253	TGA	3	9	17246	17254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288393
532	NC_011253	TGAG	2	8	17306	17313	25 %	25 %	50 %	0 %	203288393
533	NC_011253	AGT	2	6	17451	17456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288393
534	NC_011253	AGA	2	6	17481	17486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288393
535	NC_011253	TAAG	2	8	17540	17547	50 %	25 %	25 %	0 %	203288393
536	NC_011253	GAA	2	6	17551	17556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288393
537	NC_011253	AGC	2	6	17568	17573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288393
538	NC_011253	GTG	2	6	17576	17581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288393
539	NC_011253	GTG	2	6	17585	17590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288393
540	NC_011253	AGG	2	6	17591	17596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288393
541	NC_011253	CTA	2	6	17609	17614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288393
542	NC_011253	AGT	2	6	17691	17696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288393
543	NC_011253	GAT	2	6	17740	17745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288393
544	NC_011253	ATTT	2	8	17762	17769	25 %	75 %	0 %	0 %	203288393
545	NC_011253	ATG	2	6	17774	17779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288393
546	NC_011253	AGT	2	6	17835	17840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288393
547	NC_011253	GTG	2	6	17843	17848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288393
548	NC_011253	AT	3	6	17852	17857	50 %	50 %	0 %	0 %	203288393
549	NC_011253	TAC	2	6	17898	17903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288393
550	NC_011253	GCA	2	6	17929	17934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288393
551	NC_011253	AAG	2	6	17965	17970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288393
552	NC_011253	AAAG	2	8	17991	17998	75 %	0 %	25 %	0 %	203288393
553	NC_011253	ATAA	2	8	18178	18185	75 %	25 %	0 %	0 %	203288393
554	NC_011253	GA	3	6	18194	18199	50 %	0 %	50 %	0 %	203288393
555	NC_011253	TATAA	2	10	18265	18274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011253	CT	3	6	18317	18322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_011253	T	7	7	18322	18328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011253	GTATT	2	10	18336	18345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011253	TA	3	6	18366	18371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011253	CCT	2	6	18386	18391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_011253	TAA	2	6	18392	18397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011253	A	6	6	18408	18413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011253	A	7	7	18426	18432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011253	AGG	2	6	18435	18440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011253	GAA	2	6	18442	18447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011253	AG	3	6	18486	18491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011253	AG	4	8	18496	18503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011253	AGAATG	2	12	18530	18541	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011253	AAT	2	6	18547	18552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011253	GAT	2	6	18557	18562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011253	AGG	3	9	18614	18622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011253	ATG	2	6	18648	18653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011253	GAG	2	6	18664	18669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011253	AG	4	8	18673	18680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011253	GGT	2	6	18779	18784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011253	A	6	6	18862	18867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011253	AGGT	2	8	18960	18967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011253	TC	3	6	18975	18980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_011253	AAAG	2	8	19015	19022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011253	CAG	2	6	19053	19058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011253	ATA	2	6	19119	19124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011253	GCG	2	6	19166	19171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011253	GA	3	6	19179	19184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011253	AGC	3	9	19186	19194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011253	ATC	2	6	19201	19206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011253	GAA	2	6	19217	19222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011253	GCA	2	6	19259	19264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011253	AGGG	2	8	19311	19318	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011253	AGG	2	6	19369	19374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011253	GCT	2	6	19412	19417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_011253	ATG	3	9	19425	19433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011253	AAAT	2	8	19468	19475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011253	TAG	2	6	19479	19484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011253	AAG	2	6	19539	19544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011253	GCA	2	6	19576	19581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011253	AG	3	6	19628	19633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011253	CT	3	6	19643	19648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_011253	TTAT	2	8	19649	19656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011253	TTA	2	6	19686	19691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011253	TAC	2	6	19709	19714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011253	T	8	8	19718	19725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011253	TTA	4	12	19756	19767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011253	T	8	8	19768	19775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011253	AAT	2	6	19790	19795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011253	TCA	2	6	19817	19822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011253	GAA	2	6	19843	19848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011253	TTA	2	6	19897	19902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011253	TAT	2	6	19920	19925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011253	CAT	2	6	19972	19977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_011253	TAT	3	9	19981	19989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011253	AATT	2	8	20032	20039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011253	TA	3	6	20045	20050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011253	TTACA	2	10	20083	20092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
614	NC_011253	ATT	3	9	20098	20106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011253	TGT	2	6	20108	20113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011253	ATT	3	9	20127	20135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011253	TAG	2	6	20154	20159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011253	AT	3	6	20191	20196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011253	TTG	2	6	20198	20203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011253	T	6	6	20272	20277	0 %	100 %	0 %	0 %	203288394
621	NC_011253	T	6	6	20279	20284	0 %	100 %	0 %	0 %	203288394
622	NC_011253	TTC	2	6	20304	20309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288394
623	NC_011253	TC	3	6	20331	20336	0 %	50 %	0 %	50 %	203288394
624	NC_011253	TAT	2	6	20378	20383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288394
625	NC_011253	TG	3	6	20424	20429	0 %	50 %	50 %	0 %	203288394
626	NC_011253	TCA	2	6	20443	20448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288394
627	NC_011253	TAA	2	6	20461	20466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288394
628	NC_011253	TCT	2	6	20470	20475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288394
629	NC_011253	TAT	2	6	20484	20489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288394
630	NC_011253	ATT	3	9	20502	20510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288394
631	NC_011253	TA	3	6	20531	20536	50 %	50 %	0 %	0 %	203288394
632	NC_011253	AATT	2	8	20549	20556	50 %	50 %	0 %	0 %	203288394
633	NC_011253	TTC	2	6	20568	20573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288394
634	NC_011253	ATT	2	6	20583	20588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288394
635	NC_011253	TAA	2	6	20600	20605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288394
636	NC_011253	TA	3	6	20612	20617	50 %	50 %	0 %	0 %	203288394
637	NC_011253	CTT	2	6	20627	20632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288394
638	NC_011253	AATTTA	2	12	20698	20709	50 %	50 %	0 %	0 %	203288394
639	NC_011253	ACT	2	6	20721	20726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288394
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