MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl40

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011250	AT	3	6	12	17	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011250	TC	3	6	538	543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011250	TA	4	8	1168	1175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011250	AT	3	6	1399	1404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011250	AG	3	6	2391	2396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011250	TA	3	6	3932	3937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011250	TC	3	6	4087	4092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011250	TC	3	6	4534	4539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011250	AT	3	6	5050	5055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011250	CT	3	6	5415	5420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011250	TA	3	6	6931	6936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011250	TC	3	6	6976	6981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011250	TC	3	6	7100	7105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011250	AT	3	6	7987	7992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011250	AC	3	6	8002	8007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011250	TA	3	6	8086	8091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011250	CT	3	6	8880	8885	0 %	50 %	0 %	50 %	203288685
18	NC_011250	CT	5	10	9199	9208	0 %	50 %	0 %	50 %	203288685
19	NC_011250	CT	4	8	9211	9218	0 %	50 %	0 %	50 %	203288685
20	NC_011250	TA	3	6	9345	9350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011250	AC	4	8	9351	9358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011250	TC	3	6	9500	9505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011250	TC	3	6	10272	10277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011250	CT	3	6	10278	10283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011250	CT	4	8	10287	10294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011250	CT	4	8	10299	10306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011250	AT	3	6	10563	10568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011250	AT	3	6	12150	12155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011250	TC	3	6	12700	12705	0 %	50 %	0 %	50 %	203288687
30	NC_011250	AT	3	6	13521	13526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011250	TA	3	6	14165	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011250	TC	5	10	14350	14359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011250	TA	3	6	14968	14973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011250	TA	3	6	15260	15265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011250	AT	3	6	15288	15293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011250	CT	3	6	15400	15405	0 %	50 %	0 %	50 %	203288688
37	NC_011250	AT	3	6	16861	16866	50 %	50 %	0 %	0 %	203288688
38	NC_011250	AT	3	6	17632	17637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011250	AT	3	6	17928	17933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011250	AT	3	6	17940	17945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011250	TA	3	6	18074	18079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011250	AT	3	6	18415	18420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011250	AT	3	6	19046	19051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011250	AT	3	6	19342	19347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011250	TA	3	6	19357	19362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011250	TC	3	6	19894	19899	0 %	50 %	0 %	50 %	203288689
47	NC_011250	AT	3	6	20482	20487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011250	CT	3	6	20862	20867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011250	TA	3	6	21191	21196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011250	TA	3	6	21898	21903	50 %	50 %	0 %	0 %	203288690
51	NC_011250	GA	3	6	22067	22072	50 %	0 %	50 %	0 %	203288690
52	NC_011250	TC	3	6	22380	22385	0 %	50 %	0 %	50 %	203288690
53	NC_011250	AG	3	6	22465	22470	50 %	0 %	50 %	0 %	203288690
54	NC_011250	AG	3	6	22632	22637	50 %	0 %	50 %	0 %	203288690
55	NC_011250	TA	3	6	23083	23088	50 %	50 %	0 %	0 %	203288691
56	NC_011250	AT	3	6	23665	23670	50 %	50 %	0 %	0 %	203288692
57	NC_011250	AT	4	8	23686	23693	50 %	50 %	0 %	0 %	203288692
58	NC_011250	TA	3	6	23886	23891	50 %	50 %	0 %	0 %	203288692
59	NC_011250	TA	3	6	23952	23957	50 %	50 %	0 %	0 %	203288692
60	NC_011250	TA	3	6	24201	24206	50 %	50 %	0 %	0 %	203288692
61	NC_011250	AT	3	6	24262	24267	50 %	50 %	0 %	0 %	203288692
62	NC_011250	TA	3	6	24555	24560	50 %	50 %	0 %	0 %	203288693
63	NC_011250	AT	3	6	24629	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	203288693
64	NC_011250	TA	3	6	24678	24683	50 %	50 %	0 %	0 %	203288693
65	NC_011250	GA	3	6	24911	24916	50 %	0 %	50 %	0 %	203288693
66	NC_011250	AT	3	6	26214	26219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011250	TA	3	6	26975	26980	50 %	50 %	0 %	0 %	203288694
68	NC_011250	GA	5	10	27977	27986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011250	AT	4	8	28165	28172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011250	AG	3	6	29204	29209	50 %	0 %	50 %	0 %	203288695
71	NC_011250	TA	3	6	29901	29906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011250	CT	3	6	29960	29965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011250	GA	3	6	30129	30134	50 %	0 %	50 %	0 %	203288696
74	NC_011250	AG	4	8	30138	30145	50 %	0 %	50 %	0 %	203288696
75	NC_011250	GA	3	6	31130	31135	50 %	0 %	50 %	0 %	203288696
76	NC_011250	TA	3	6	31186	31191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011250	CT	3	6	31252	31257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011250	TA	3	6	31277	31282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011250	AT	3	6	32556	32561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011250	AT	3	6	33341	33346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011250	GT	3	6	33448	33453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011250	AT	3	6	33463	33468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011250	TA	3	6	33640	33645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011250	GA	3	6	33808	33813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011250	AT	3	6	34696	34701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011250	GT	3	6	34911	34916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011250	AT	3	6	34926	34931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011250	TA	3	6	35019	35024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011250	TC	3	6	35524	35529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011250	TA	3	6	35937	35942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011250	AT	3	6	36066	36071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011250	AG	3	6	36218	36223	50 %	0 %	50 %	0 %	203288699
93	NC_011250	GA	3	6	36766	36771	50 %	0 %	50 %	0 %	203288699
94	NC_011250	AT	3	6	36920	36925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011250	TA	5	10	37711	37720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011250	AG	4	8	37946	37953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011250	CT	3	6	37962	37967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011250	GA	3	6	38013	38018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011250	AG	3	6	38105	38110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011250	AG	5	10	38115	38124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011250	TA	3	6	39559	39564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011250	TA	3	6	39643	39648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011250	AT	3	6	39736	39741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011250	TA	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011250	AT	3	6	40144	40149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.