MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	ATTTT	2	10	20	29	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011247	GCTAT	2	10	215	224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011247	TATTT	2	10	1444	1453	20 %	80 %	0 %	0 %	203288507
4	NC_011247	CAAAT	2	10	2000	2009	60 %	20 %	0 %	20 %	203288507
5	NC_011247	TTTTG	2	10	2172	2181	0 %	80 %	20 %	0 %	203288507
6	NC_011247	TTCTT	3	15	2194	2208	0 %	80 %	0 %	20 %	203288507
7	NC_011247	TTCTC	2	10	3284	3293	0 %	60 %	0 %	40 %	203288508
8	NC_011247	TAATA	2	10	4027	4036	60 %	40 %	0 %	0 %	203288509
9	NC_011247	CAATT	2	10	5876	5885	40 %	40 %	0 %	20 %	203288511
10	NC_011247	CTATA	2	10	8344	8353	40 %	40 %	0 %	20 %	203288513
11	NC_011247	CAATT	2	10	9780	9789	40 %	40 %	0 %	20 %	203288514
12	NC_011247	TAATA	2	10	10596	10605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011247	TTCTT	2	10	11185	11194	0 %	80 %	0 %	20 %	203288515
14	NC_011247	ATTTT	2	10	11420	11429	20 %	80 %	0 %	0 %	203288515
15	NC_011247	TGCTT	2	10	12512	12521	0 %	60 %	20 %	20 %	203288516
16	NC_011247	TGCTT	2	10	14903	14912	0 %	60 %	20 %	20 %	203288518
17	NC_011247	TGCTT	2	10	16100	16109	0 %	60 %	20 %	20 %	203288519
18	NC_011247	AAATA	2	10	16559	16568	80 %	20 %	0 %	0 %	203288519
19	NC_011247	AACCA	2	10	17180	17189	60 %	0 %	0 %	40 %	203288520
20	NC_011247	ATTTA	2	10	18750	18759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011247	TTTCT	2	10	19101	19110	0 %	80 %	0 %	20 %	203288522
22	NC_011247	CTTCT	2	10	19283	19292	0 %	60 %	0 %	40 %	203288522
23	NC_011247	TGCTT	2	10	19296	19305	0 %	60 %	20 %	20 %	203288522
24	NC_011247	ATTTA	2	10	19717	19726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011247	CTTCT	2	10	20254	20263	0 %	60 %	0 %	40 %	203288523
26	NC_011247	ACACT	2	10	20356	20365	40 %	20 %	0 %	40 %	203288523
27	NC_011247	CCTCT	2	10	20489	20498	0 %	40 %	0 %	60 %	203288523
28	NC_011247	ATTTA	2	10	20694	20703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011247	CTTCT	2	10	23225	23234	0 %	60 %	0 %	40 %	203288527
30	NC_011247	ATTTA	2	10	24189	24198	40 %	60 %	0 %	0 %	203288528
31	NC_011247	TAATA	2	10	24296	24305	60 %	40 %	0 %	0 %	203288528
32	NC_011247	TTAAT	2	10	24677	24686	40 %	60 %	0 %	0 %	203288529
33	NC_011247	ATTTT	2	10	24735	24744	20 %	80 %	0 %	0 %	203288529
34	NC_011247	TAAAT	2	10	24926	24935	60 %	40 %	0 %	0 %	203288529
35	NC_011247	TTTAA	2	10	26615	26624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011247	ATATA	2	10	26881	26890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011247	TTAAA	2	10	27420	27429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011247	ATATT	2	10	28694	28703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011247	TTTCA	2	10	29704	29713	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011247	ATAAA	2	10	29723	29732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011247	AAATA	2	10	30445	30454	80 %	20 %	0 %	0 %	203288532
42	NC_011247	TAAAA	2	10	30628	30637	80 %	20 %	0 %	0 %	203288532
43	NC_011247	TTTCA	2	10	31716	31725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011247	AAAAT	2	10	31737	31746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011247	ATAAA	2	10	31901	31910	80 %	20 %	0 %	0 %	203288533
46	NC_011247	AAATA	2	10	32439	32448	80 %	20 %	0 %	0 %	203288533
47	NC_011247	TTTCA	2	10	33707	33716	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011247	AAAAT	2	10	33728	33737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011247	ATAAA	2	10	33892	33901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011247	AAATA	2	10	34431	34440	80 %	20 %	0 %	0 %	203288534
51	NC_011247	CATGG	2	10	36653	36662	20 %	20 %	40 %	20 %	203288535
52	NC_011247	AAATA	2	10	37066	37075	80 %	20 %	0 %	0 %	203288535
53	NC_011247	AAATA	2	10	39769	39778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011247	ATTTA	2	10	42196	42205	40 %	60 %	0 %	0 %	203288538
55	NC_011247	CTTTA	2	10	42238	42247	20 %	60 %	0 %	20 %	203288538
56	NC_011247	AATTA	2	10	42817	42826	60 %	40 %	0 %	0 %	203288539
57	NC_011247	ATTAT	2	10	43387	43396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011247	AAATT	2	10	44158	44167	60 %	40 %	0 %	0 %	203288540
59	NC_011247	TCTTT	2	10	45275	45284	0 %	80 %	0 %	20 %	203288541
60	NC_011247	ATTAT	2	10	46059	46068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011247	ATGTA	2	10	49869	49878	40 %	40 %	20 %	0 %	203288544
62	NC_011247	TTTAA	2	10	51077	51086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011247	AAATC	2	10	51710	51719	60 %	20 %	0 %	20 %	203288546
64	NC_011247	TTACA	2	10	52025	52034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011247	ATATA	2	10	52143	52152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011247	TCAAA	2	10	53416	53425	60 %	20 %	0 %	20 %	203288547
67	NC_011247	AATAT	2	10	54942	54951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011247	AAATA	2	10	55204	55213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011247	AATTT	2	10	55704	55713	40 %	60 %	0 %	0 %	203288549
70	NC_011247	AACAT	2	10	56239	56248	60 %	20 %	0 %	20 %	203288549
71	NC_011247	TTAAA	2	10	56283	56292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011247	TAAAA	2	10	56389	56398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011247	GTATG	2	10	58035	58044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011247	AAATG	2	10	58850	58859	60 %	20 %	20 %	0 %	203288551
75	NC_011247	TTAAA	2	10	59058	59067	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011247	TAAAG	2	10	60198	60207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011247	TAATA	2	10	62112	62121	60 %	40 %	0 %	0 %	203288553
78	NC_011247	CAATA	2	10	63325	63334	60 %	20 %	0 %	20 %	203288554
79	NC_011247	CTTTT	2	10	64499	64508	0 %	80 %	0 %	20 %	203288555
80	NC_011247	ATTAA	2	10	65848	65857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011247	TAATT	2	10	65874	65883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011247	CATAT	2	10	66460	66469	40 %	40 %	0 %	20 %	203288557
83	NC_011247	TAAAA	2	10	67657	67666	80 %	20 %	0 %	0 %	203288558
84	NC_011247	AAACT	2	10	68509	68518	60 %	20 %	0 %	20 %	203288560
85	NC_011247	TAAAC	2	10	68560	68569	60 %	20 %	0 %	20 %	203288560
86	NC_011247	TAACA	2	10	68749	68758	60 %	20 %	0 %	20 %	203288560
87	NC_011247	ATACC	2	10	69550	69559	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_011247	TATAA	2	10	69902	69911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011247	TTTAA	2	10	71396	71405	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011247	CAAAA	2	10	72260	72269	80 %	0 %	0 %	20 %	203288562
91	NC_011247	AATGA	2	10	72869	72878	60 %	20 %	20 %	0 %	203288563
92	NC_011247	TAGCA	2	10	73519	73528	40 %	20 %	20 %	20 %	203288564
93	NC_011247	AAATA	2	10	74528	74537	80 %	20 %	0 %	0 %	203288564
94	NC_011247	TATAA	2	10	74635	74644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011247	ATCAC	2	10	74672	74681	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011247	AAAAT	2	10	75381	75390	80 %	20 %	0 %	0 %	203288565
97	NC_011247	TTTAA	2	10	75459	75468	40 %	60 %	0 %	0 %	203288565
98	NC_011247	AAGAT	2	10	75643	75652	60 %	20 %	20 %	0 %	203288565
99	NC_011247	ATATG	2	10	76128	76137	40 %	40 %	20 %	0 %	203288566
100	NC_011247	TAAAT	2	10	76148	76157	60 %	40 %	0 %	0 %	203288566
101	NC_011247	AAATA	2	10	76829	76838	80 %	20 %	0 %	0 %	203288567
102	NC_011247	TGAAT	2	10	77091	77100	40 %	40 %	20 %	0 %	203288567
103	NC_011247	ATATC	2	10	77214	77223	40 %	40 %	0 %	20 %	203288567
104	NC_011247	TTTCA	2	10	77390	77399	20 %	60 %	0 %	20 %	203288567
105	NC_011247	CAAAA	2	10	77533	77542	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011247	TGAAT	2	10	77866	77875	40 %	40 %	20 %	0 %	203288568
107	NC_011247	AATAT	2	10	78257	78266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011247	CTAAA	2	10	80380	80389	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011247	TATTT	2	10	80685	80694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011247	CAAAA	2	10	81022	81031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011247	ATTTA	2	10	81871	81880	40 %	60 %	0 %	0 %	203288572
112	NC_011247	ATTAA	2	10	82264	82273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011247	AATTT	2	10	85093	85102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011247	ATTAA	2	10	85714	85723	60 %	40 %	0 %	0 %	203288575
115	NC_011247	AATAA	2	10	85787	85796	80 %	20 %	0 %	0 %	203288575
116	NC_011247	ACTTC	2	10	86808	86817	20 %	40 %	0 %	40 %	203288576
117	NC_011247	ATTTT	2	10	87003	87012	20 %	80 %	0 %	0 %	203288576
118	NC_011247	ATCTG	2	10	87711	87720	20 %	40 %	20 %	20 %	203288576
119	NC_011247	ATTAA	2	10	88489	88498	60 %	40 %	0 %	0 %	203288577
120	NC_011247	ATCAT	2	10	89155	89164	40 %	40 %	0 %	20 %	203288578
121	NC_011247	ATTTA	2	10	89929	89938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011247	TAAAT	2	10	89987	89996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011247	AGACA	2	10	90764	90773	60 %	0 %	20 %	20 %	203288579
124	NC_011247	TTAAA	2	10	91658	91667	60 %	40 %	0 %	0 %	203288580
125	NC_011247	AAATT	2	10	92865	92874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011247	AAATT	2	10	94579	94588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011247	TCTTG	2	10	94866	94875	0 %	60 %	20 %	20 %	203288584
128	NC_011247	AAAAT	2	10	95710	95719	80 %	20 %	0 %	0 %	203288584
129	NC_011247	ATTAT	2	10	95776	95785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011247	TCTTT	2	10	96894	96903	0 %	80 %	0 %	20 %	203288586
131	NC_011247	AATTA	2	10	97468	97477	60 %	40 %	0 %	0 %	203288586
132	NC_011247	TAAAT	2	10	98777	98786	60 %	40 %	0 %	0 %	203288589
133	NC_011247	AACAC	2	10	99008	99017	60 %	0 %	0 %	40 %	203288590
134	NC_011247	GTAAT	2	10	99435	99444	40 %	40 %	20 %	0 %	203288590
135	NC_011247	TATTT	2	10	100084	100093	20 %	80 %	0 %	0 %	203288591
136	NC_011247	AAAAG	2	10	100365	100374	80 %	0 %	20 %	0 %	203288591
137	NC_011247	AATAA	2	10	101231	101240	80 %	20 %	0 %	0 %	203288593
138	NC_011247	AAATT	2	10	101328	101337	60 %	40 %	0 %	0 %	203288593
139	NC_011247	TTAAC	2	10	103076	103085	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011247	TTTTA	2	10	103166	103175	20 %	80 %	0 %	0 %	203288596
141	NC_011247	ATCTT	2	10	103769	103778	20 %	60 %	0 %	20 %	203288597
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143	NC_011247	TAATT	2	10	104713	104722	40 %	60 %	0 %	0 %	203288597
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.