MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 2000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	GAA	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
2	NC_011246	CAA	2	6	53	58	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
3	NC_011246	AAG	2	6	173	178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
4	NC_011246	AAG	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
5	NC_011246	CAA	2	6	211	216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
6	NC_011246	AAG	2	6	251	256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
7	NC_011246	AAG	2	6	293	298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
8	NC_011246	AAG	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
9	NC_011246	AAG	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
10	NC_011246	AAT	2	6	441	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288273
11	NC_011246	AGA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
12	NC_011246	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
13	NC_011246	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288273
14	NC_011246	AAG	4	12	497	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
15	NC_011246	AGA	2	6	516	521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
16	NC_011246	ATA	2	6	527	532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288273
17	NC_011246	AGA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
18	NC_011246	AGA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
19	NC_011246	GAA	3	9	583	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
20	NC_011246	ACA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
21	NC_011246	CAA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
22	NC_011246	GAA	3	9	613	621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
23	NC_011246	ATT	2	6	627	632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288273
24	NC_011246	GAG	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288273
25	NC_011246	ATT	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
26	NC_011246	TAG	2	6	810	815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
27	NC_011246	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
28	NC_011246	ACA	2	6	830	835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
29	NC_011246	CCT	2	6	872	877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288274
30	NC_011246	TGC	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288274
31	NC_011246	ATA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
32	NC_011246	ATT	2	6	1014	1019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
33	NC_011246	TAT	2	6	1069	1074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
34	NC_011246	GAT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
35	NC_011246	CAA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
36	NC_011246	AGA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288274
37	NC_011246	AGA	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288274
38	NC_011246	ATG	3	9	1391	1399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
39	NC_011246	CAA	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
40	NC_011246	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
41	NC_011246	AAT	2	6	1464	1469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
42	NC_011246	ATA	2	6	1536	1541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011246	TAT	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011246	ATT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011246	AGG	2	6	1770	1775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011246	TAG	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011246	AGG	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011246	ATG	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
49	NC_011246	TAT	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
50	NC_011246	GAA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
51	NC_011246	ATA	3	9	2080	2088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
52	NC_011246	GAA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
53	NC_011246	TTG	2	6	2106	2111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288275
54	NC_011246	CAA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288275
55	NC_011246	TAG	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
56	NC_011246	AGA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
57	NC_011246	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
58	NC_011246	AAG	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
59	NC_011246	ATT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
60	NC_011246	GAT	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
61	NC_011246	AAT	2	6	2390	2395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
62	NC_011246	TAG	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
63	NC_011246	ATA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
64	NC_011246	AAT	2	6	2636	2641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
65	NC_011246	ATA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
66	NC_011246	TAA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
67	NC_011246	GTA	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
68	NC_011246	CTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288275
69	NC_011246	AAC	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288275
70	NC_011246	ATT	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
71	NC_011246	CTT	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288275
72	NC_011246	ATT	2	6	2955	2960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011246	TAT	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011246	ATT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011246	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011246	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011246	TTC	2	6	3240	3245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288276
78	NC_011246	AAT	2	6	3252	3257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288276
79	NC_011246	TAT	2	6	3272	3277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288276
80	NC_011246	TGG	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288276
81	NC_011246	TAG	2	6	3584	3589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288276
82	NC_011246	CTT	2	6	3689	3694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288276
83	NC_011246	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288276
84	NC_011246	TTA	2	6	3875	3880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011246	ATT	2	6	4106	4111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
86	NC_011246	TAC	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
87	NC_011246	TGC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288277
88	NC_011246	TAT	2	6	4235	4240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
89	NC_011246	TAA	2	6	4309	4314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288277
90	NC_011246	ACT	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
91	NC_011246	TAC	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
92	NC_011246	AAC	2	6	4436	4441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288277
93	NC_011246	TAG	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288277
94	NC_011246	TCA	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
95	NC_011246	TAA	2	6	4730	4735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288277
96	NC_011246	ATT	3	9	4742	4750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
97	NC_011246	TAT	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
98	NC_011246	CAT	3	9	4875	4883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011246	ACT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011246	TAT	2	6	4912	4917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011246	TAA	3	9	4922	4930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011246	AAT	2	6	4942	4947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011246	ATA	2	6	4948	4953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011246	TAT	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011246	ATA	2	6	4976	4981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011246	ATA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011246	ATT	2	6	5092	5097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011246	TAA	2	6	5105	5110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011246	TTG	2	6	5251	5256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288278
110	NC_011246	ATA	2	6	5501	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288278
111	NC_011246	TTC	2	6	5566	5571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288278
112	NC_011246	ATT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288278
113	NC_011246	TAA	2	6	5741	5746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288278
114	NC_011246	CAT	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288278
115	NC_011246	ACC	3	9	5884	5892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288278
116	NC_011246	CCT	2	6	5921	5926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288278
117	NC_011246	CCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288278
118	NC_011246	ATC	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288278
119	NC_011246	TAT	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288278
120	NC_011246	TCC	2	6	6046	6051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288278
121	NC_011246	ACA	2	6	6061	6066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288278
122	NC_011246	TAA	2	6	6073	6078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288278
123	NC_011246	TCC	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011246	ACA	2	6	6214	6219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011246	TAA	2	6	6279	6284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011246	AAT	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011246	TAT	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011246	CTC	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288279
129	NC_011246	TAA	2	6	6476	6481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
130	NC_011246	TAA	2	6	6497	6502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
131	NC_011246	TAA	2	6	6548	6553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
132	NC_011246	CTA	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288279
133	NC_011246	TAA	2	6	6824	6829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
134	NC_011246	ATT	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288279
135	NC_011246	ATT	2	6	6888	6893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288279
136	NC_011246	TCA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288279
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173	NC_011246	CAT	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_011246	ATT	2	6	8900	8905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_011246	ATC	2	6	15599	15604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288284
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273	NC_011246	ATC	2	6	15869	15874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288284
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290	NC_011246	ATT	2	6	16560	16565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011246	ATT	4	12	16580	16591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_011246	AAT	2	6	16725	16730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011246	ATA	2	6	16788	16793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_011246	ATT	2	6	16801	16806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011246	ATC	3	9	16828	16836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_011246	TAG	2	6	16920	16925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_011246	TAA	2	6	16944	16949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011246	ATC	2	6	17062	17067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_011246	TAC	2	6	17179	17184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_011246	CTT	2	6	17284	17289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_011246	TTC	2	6	17574	17579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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305	NC_011246	TCC	2	6	17686	17691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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328	NC_011246	ATT	2	6	19465	19470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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342	NC_011246	ATA	2	6	20433	20438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_011246	CAT	2	6	24115	24120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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403	NC_011246	TCC	2	6	24278	24283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
404	NC_011246	TCT	2	6	24326	24331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NC_011246	AAT	2	6	24531	24536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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