MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 3646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011246	A	8	8	32444	32451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011246	TAA	2	6	32452	32457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011246	ATA	2	6	32473	32478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011246	A	7	7	32481	32487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011246	TAAA	2	8	32557	32564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011246	CAA	2	6	32581	32586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011246	CT	3	6	32701	32706	0 %	50 %	0 %	50 %	203288295
1008	NC_011246	TAA	2	6	32772	32777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288295
1009	NC_011246	TCC	2	6	32780	32785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288295
1010	NC_011246	TCA	2	6	32849	32854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288295
1011	NC_011246	ATA	2	6	32860	32865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288295
1012	NC_011246	ATT	2	6	32896	32901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288295
1013	NC_011246	TAA	2	6	32911	32916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288295
1014	NC_011246	AATGA	2	10	32944	32953	60 %	20 %	20 %	0 %	203288295
1015	NC_011246	TAA	2	6	32997	33002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288295
1016	NC_011246	TGA	2	6	33064	33069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288295
1017	NC_011246	TCT	2	6	33137	33142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288295
1018	NC_011246	A	6	6	33174	33179	100 %	0 %	0 %	0 %	203288295
1019	NC_011246	ACT	2	6	33229	33234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288295
1020	NC_011246	T	6	6	33275	33280	0 %	100 %	0 %	0 %	203288295
1021	NC_011246	AAT	2	6	33326	33331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288295
1022	NC_011246	TCT	2	6	33342	33347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011246	TA	3	6	33368	33373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011246	ATA	2	6	33383	33388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011246	AT	4	8	33398	33405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011246	TA	4	8	33407	33414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011246	AAC	2	6	33427	33432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011246	TCA	2	6	33450	33455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_011246	A	6	6	33487	33492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011246	ATA	2	6	33520	33525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011246	AACA	2	8	33529	33536	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_011246	TAGCA	2	10	33596	33605	40 %	20 %	20 %	20 %	203288296
1033	NC_011246	CT	3	6	33608	33613	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
1034	NC_011246	TAA	2	6	33662	33667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288296
1035	NC_011246	ATT	2	6	33672	33677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288296
1036	NC_011246	TCA	3	9	33684	33692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288296
1037	NC_011246	TAT	2	6	33712	33717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288296
1038	NC_011246	CAA	2	6	33730	33735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288296
1039	NC_011246	TTC	2	6	33737	33742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288296
1040	NC_011246	TTC	2	6	33821	33826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288296
1041	NC_011246	CAT	2	6	33886	33891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288296
1042	NC_011246	TCC	2	6	34008	34013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288296
1043	NC_011246	A	6	6	34055	34060	100 %	0 %	0 %	0 %	203288296
1044	NC_011246	TAAA	2	8	34070	34077	75 %	25 %	0 %	0 %	203288296
1045	NC_011246	CAC	2	6	34153	34158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288296
1046	NC_011246	ATC	2	6	34169	34174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288296
1047	NC_011246	TTC	2	6	34208	34213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288296
1048	NC_011246	TCT	2	6	34243	34248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288296
1049	NC_011246	CCA	2	6	34275	34280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288296
1050	NC_011246	CT	3	6	34289	34294	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
1051	NC_011246	CAT	2	6	34297	34302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288296
1052	NC_011246	ATC	2	6	34313	34318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288296
1053	NC_011246	TGT	2	6	34326	34331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288296
1054	NC_011246	ACT	2	6	34394	34399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288296
1055	NC_011246	GAT	2	6	34417	34422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288296
1056	NC_011246	T	7	7	34496	34502	0 %	100 %	0 %	0 %	203288296
1057	NC_011246	ACC	2	6	34514	34519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288296
1058	NC_011246	TC	3	6	34553	34558	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
1059	NC_011246	AC	3	6	34596	34601	50 %	0 %	0 %	50 %	203288296
1060	NC_011246	AAATA	2	10	34605	34614	80 %	20 %	0 %	0 %	203288296
1061	NC_011246	TCCT	2	8	34641	34648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011246	TAA	2	6	34678	34683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011246	TTA	3	9	34703	34711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011246	TATAA	2	10	34712	34721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011246	TATT	2	8	34725	34732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011246	AAG	2	6	34734	34739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011246	ATCAC	2	10	34749	34758	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1068	NC_011246	TAA	2	6	34803	34808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011246	A	6	6	34852	34857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011246	TC	4	8	34861	34868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_011246	TTA	3	9	34892	34900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011246	TTA	2	6	34915	34920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011246	ATTT	2	8	34969	34976	25 %	75 %	0 %	0 %	203288297
1074	NC_011246	TAA	2	6	35030	35035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288297
1075	NC_011246	A	7	7	35083	35089	100 %	0 %	0 %	0 %	203288297
1076	NC_011246	TAT	2	6	35102	35107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288297
1077	NC_011246	TC	3	6	35126	35131	0 %	50 %	0 %	50 %	203288297
1078	NC_011246	TAAT	2	8	35156	35163	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
1079	NC_011246	T	6	6	35193	35198	0 %	100 %	0 %	0 %	203288297
1080	NC_011246	ATA	3	9	35217	35225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288297
1081	NC_011246	TAG	2	6	35252	35257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288297
1082	NC_011246	TCA	2	6	35278	35283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288297
1083	NC_011246	ATC	2	6	35289	35294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288297
1084	NC_011246	A	7	7	35341	35347	100 %	0 %	0 %	0 %	203288297
1085	NC_011246	TAC	2	6	35375	35380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288297
1086	NC_011246	AT	3	6	35410	35415	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
1087	NC_011246	AAAAT	2	10	35458	35467	80 %	20 %	0 %	0 %	203288297
1088	NC_011246	TTTAA	2	10	35536	35545	40 %	60 %	0 %	0 %	203288297
1089	NC_011246	CAA	2	6	35627	35632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288297
1090	NC_011246	AC	3	6	35655	35660	50 %	0 %	0 %	50 %	203288297
1091	NC_011246	ATC	2	6	35667	35672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288297
1092	NC_011246	CAT	2	6	35675	35680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288297
1093	NC_011246	AAGAT	2	10	35720	35729	60 %	20 %	20 %	0 %	203288297
1094	NC_011246	ATA	2	6	35741	35746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288297
1095	NC_011246	TTC	2	6	35756	35761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288297
1096	NC_011246	AT	3	6	35782	35787	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
1097	NC_011246	AT	4	8	35790	35797	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
1098	NC_011246	CAA	2	6	35808	35813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288297
1099	NC_011246	A	6	6	35822	35827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011246	TA	3	6	35869	35874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011246	TCT	2	6	35958	35963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011246	TAA	2	6	35979	35984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011246	AAT	3	9	36092	36100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011246	T	6	6	36153	36158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011246	TCA	2	6	36167	36172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011246	AAC	2	6	36184	36189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_011246	ATATG	2	10	36197	36206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011246	TAAAT	2	10	36217	36226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011246	A	6	6	36230	36235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011246	TC	3	6	36270	36275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_011246	TC	3	6	36326	36331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_011246	TTA	2	6	36388	36393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011246	AATC	2	8	36542	36549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_011246	A	7	7	36558	36564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011246	TACT	2	8	36596	36603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_011246	A	6	6	36612	36617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011246	ATT	2	6	36654	36659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011246	TCT	2	6	36662	36667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_011246	CAT	2	6	36671	36676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011246	AC	3	6	36716	36721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_011246	A	6	6	36732	36737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011246	TA	5	10	36817	36826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011246	AT	3	6	36828	36833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011246	CAAC	2	8	36881	36888	50 %	0 %	0 %	50 %	203288298
1125	NC_011246	AAATA	2	10	36900	36909	80 %	20 %	0 %	0 %	203288298
1126	NC_011246	TTA	2	6	36931	36936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288298
1127	NC_011246	AT	3	6	36980	36985	50 %	50 %	0 %	0 %	203288298
1128	NC_011246	CAA	4	12	37007	37018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288298
1129	NC_011246	T	6	6	37085	37090	0 %	100 %	0 %	0 %	203288298
1130	NC_011246	ATC	2	6	37095	37100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288298
1131	NC_011246	TTTA	2	8	37134	37141	25 %	75 %	0 %	0 %	203288298
1132	NC_011246	TGAAT	2	10	37162	37171	40 %	40 %	20 %	0 %	203288298
1133	NC_011246	TATCTC	2	12	37217	37228	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288298
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1398	NC_011246	A	7	7	45939	45945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1399	NC_011246	CTT	2	6	45973	45978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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