MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011245	CAA	2	6	18132	18137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288492
502	NC_011245	CAA	2	6	18227	18232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288492
503	NC_011245	TCA	2	6	18309	18314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288492
504	NC_011245	A	6	6	18389	18394	100 %	0 %	0 %	0 %	203288492
505	NC_011245	TTG	2	6	18420	18425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288492
506	NC_011245	ATA	2	6	18502	18507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288493
507	NC_011245	CCAT	2	8	18579	18586	25 %	25 %	0 %	50 %	203288493
508	NC_011245	AT	3	6	18585	18590	50 %	50 %	0 %	0 %	203288493
509	NC_011245	GT	3	6	18677	18682	0 %	50 %	50 %	0 %	203288493
510	NC_011245	ATT	2	6	18789	18794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288493
511	NC_011245	T	6	6	18801	18806	0 %	100 %	0 %	0 %	203288493
512	NC_011245	TTC	2	6	18813	18818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288493
513	NC_011245	A	7	7	18863	18869	100 %	0 %	0 %	0 %	203288493
514	NC_011245	ACA	2	6	18892	18897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288493
515	NC_011245	AAC	2	6	18907	18912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288493
516	NC_011245	AAT	2	6	18934	18939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288493
517	NC_011245	ACAA	2	8	18984	18991	75 %	0 %	0 %	25 %	203288493
518	NC_011245	AAG	2	6	18992	18997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288493
519	NC_011245	AAT	2	6	19015	19020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288493
520	NC_011245	AAGT	2	8	19074	19081	50 %	25 %	25 %	0 %	203288494
521	NC_011245	TAT	2	6	19082	19087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288494
522	NC_011245	ACT	2	6	19093	19098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288494
523	NC_011245	A	6	6	19141	19146	100 %	0 %	0 %	0 %	203288494
524	NC_011245	TAA	2	6	19210	19215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288494
525	NC_011245	TGA	3	9	19219	19227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288494
526	NC_011245	T	6	6	19271	19276	0 %	100 %	0 %	0 %	203288494
527	NC_011245	GAT	2	6	19283	19288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288494
528	NC_011245	CAG	2	6	19329	19334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288494
529	NC_011245	AAG	2	6	19363	19368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288494
530	NC_011245	TCA	2	6	19389	19394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288494
531	NC_011245	TAA	2	6	19408	19413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288494
532	NC_011245	TGG	2	6	19417	19422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288494
533	NC_011245	GAT	2	6	19445	19450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288494
534	NC_011245	CTT	2	6	19477	19482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288494
535	NC_011245	ATTC	2	8	19559	19566	25 %	50 %	0 %	25 %	203288494
536	NC_011245	CAA	2	6	19577	19582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288494
537	NC_011245	GAA	2	6	19688	19693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288494
538	NC_011245	GCA	2	6	19940	19945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288494
539	NC_011245	TGCA	2	8	19948	19955	25 %	25 %	25 %	25 %	203288494
540	NC_011245	TTG	2	6	19968	19973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288494
541	NC_011245	TGC	2	6	20026	20031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288494
542	NC_011245	CACAA	2	10	20098	20107	60 %	0 %	0 %	40 %	203288494
543	NC_011245	AGG	2	6	20136	20141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288494
544	NC_011245	AAT	2	6	20145	20150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288494
545	NC_011245	TCAA	2	8	20185	20192	50 %	25 %	0 %	25 %	203288495
546	NC_011245	ACA	2	6	20239	20244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288495
547	NC_011245	TAGT	2	8	20282	20289	25 %	50 %	25 %	0 %	203288495
548	NC_011245	AGA	2	6	20397	20402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288495
549	NC_011245	A	6	6	20413	20418	100 %	0 %	0 %	0 %	203288495
550	NC_011245	AGA	2	6	20484	20489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288495
551	NC_011245	AAG	2	6	20496	20501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288495
552	NC_011245	TGC	2	6	20505	20510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288495
553	NC_011245	A	8	8	20559	20566	100 %	0 %	0 %	0 %	203288495
554	NC_011245	AGG	2	6	20584	20589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011245	A	6	6	20627	20632	100 %	0 %	0 %	0 %	203288496
556	NC_011245	AC	4	8	20636	20643	50 %	0 %	0 %	50 %	203288496
557	NC_011245	AAT	2	6	20723	20728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288496
558	NC_011245	AACA	2	8	20749	20756	75 %	0 %	0 %	25 %	203288496
559	NC_011245	GAC	2	6	20801	20806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288496
560	NC_011245	AT	3	6	20815	20820	50 %	50 %	0 %	0 %	203288496
561	NC_011245	TAC	2	6	20825	20830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288496
562	NC_011245	ATTCA	2	10	20856	20865	40 %	40 %	0 %	20 %	203288496
563	NC_011245	AGA	3	9	20884	20892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288496
564	NC_011245	A	6	6	20897	20902	100 %	0 %	0 %	0 %	203288496
565	NC_011245	TGG	2	6	20941	20946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288496
566	NC_011245	AAG	2	6	21058	21063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288497
567	NC_011245	GAA	2	6	21074	21079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288497
568	NC_011245	AC	3	6	21083	21088	50 %	0 %	0 %	50 %	203288497
569	NC_011245	A	6	6	21116	21121	100 %	0 %	0 %	0 %	203288497
570	NC_011245	ATG	2	6	21143	21148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288497
571	NC_011245	TGA	2	6	21163	21168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288497
572	NC_011245	AT	3	6	21239	21244	50 %	50 %	0 %	0 %	203288497
573	NC_011245	TCTA	2	8	21253	21260	25 %	50 %	0 %	25 %	203288497
574	NC_011245	AAT	2	6	21274	21279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288497
575	NC_011245	AT	3	6	21347	21352	50 %	50 %	0 %	0 %	203288498
576	NC_011245	A	6	6	21404	21409	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
577	NC_011245	GAAA	2	8	21426	21433	75 %	0 %	25 %	0 %	203288498
578	NC_011245	A	8	8	21431	21438	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
579	NC_011245	CAAA	2	8	21450	21457	75 %	0 %	0 %	25 %	203288498
580	NC_011245	AGA	2	6	21483	21488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
581	NC_011245	A	6	6	21488	21493	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
582	NC_011245	A	9	9	21521	21529	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
583	NC_011245	AGC	2	6	21534	21539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288498
584	NC_011245	A	8	8	21540	21547	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
585	NC_011245	A	8	8	21575	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
586	NC_011245	AGA	2	6	21600	21605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
587	NC_011245	A	6	6	21608	21613	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
588	NC_011245	GAA	2	6	21643	21648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
589	NC_011245	AAG	2	6	21692	21697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
590	NC_011245	AAG	2	6	21725	21730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
591	NC_011245	A	6	6	21759	21764	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
592	NC_011245	GC	3	6	21804	21809	0 %	0 %	50 %	50 %	203288498
593	NC_011245	ACT	2	6	21865	21870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288498
594	NC_011245	GGT	2	6	21877	21882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288498
595	NC_011245	TAT	2	6	21915	21920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288498
596	NC_011245	CAA	2	6	21921	21926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288498
597	NC_011245	A	8	8	21936	21943	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
598	NC_011245	TTC	2	6	22001	22006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288498
599	NC_011245	AGA	2	6	22041	22046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
600	NC_011245	TGC	2	6	22134	22139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288498
601	NC_011245	GTA	2	6	22189	22194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288498
602	NC_011245	A	8	8	22341	22348	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
603	NC_011245	TGA	2	6	22353	22358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288498
604	NC_011245	GAA	2	6	22396	22401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
605	NC_011245	GAT	2	6	22411	22416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288498
606	NC_011245	ACTTT	2	10	22511	22520	20 %	60 %	0 %	20 %	203288498
607	NC_011245	T	6	6	22563	22568	0 %	100 %	0 %	0 %	203288498
608	NC_011245	TAC	2	6	22622	22627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288498
609	NC_011245	GAA	2	6	22657	22662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
610	NC_011245	CAC	2	6	22685	22690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288498
611	NC_011245	ACT	2	6	22696	22701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288498
612	NC_011245	AGG	2	6	22748	22753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288498
613	NC_011245	TTAAC	2	10	22837	22846	40 %	40 %	0 %	20 %	203288499
614	NC_011245	AAC	2	6	22859	22864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288499
615	NC_011245	GAAA	2	8	22871	22878	75 %	0 %	25 %	0 %	203288499
616	NC_011245	TCAA	2	8	22882	22889	50 %	25 %	0 %	25 %	203288499
617	NC_011245	GT	3	6	22897	22902	0 %	50 %	50 %	0 %	203288499
618	NC_011245	TTCA	2	8	22977	22984	25 %	50 %	0 %	25 %	203288499
619	NC_011245	TAC	2	6	23018	23023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288499
620	NC_011245	ATT	2	6	23047	23052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288499
621	NC_011245	ATC	2	6	23103	23108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288499
622	NC_011245	AAT	2	6	23115	23120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288499
623	NC_011245	TTAG	2	8	23127	23134	25 %	50 %	25 %	0 %	203288499
624	NC_011245	ACT	2	6	23147	23152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288499
625	NC_011245	ACA	2	6	23216	23221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288499
626	NC_011245	TAAC	2	8	23224	23231	50 %	25 %	0 %	25 %	203288499
627	NC_011245	AAAG	2	8	23238	23245	75 %	0 %	25 %	0 %	203288499
628	NC_011245	TGA	2	6	23333	23338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288499
629	NC_011245	A	6	6	23473	23478	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
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631	NC_011245	GAA	2	6	23539	23544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288500
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753	NC_011245	A	6	6	28284	28289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
754	NC_011245	T	7	7	28294	28300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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756	NC_011245	TA	3	6	28324	28329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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