MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1

Total Repeats: 1074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011244	CTTCC	2	10	455	464	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_011244	CTTCT	2	10	530	539	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011244	TTATC	2	10	1881	1890	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011244	CTTCC	2	10	3345	3354	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_011244	CTTCT	2	10	3448	3457	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011244	AAGAC	2	10	3625	3634	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011244	CTTTT	2	10	8426	8435	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011244	TTAAG	2	10	8457	8466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011244	CTTTA	2	10	9320	9329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011244	TTATT	2	10	9342	9351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011244	TCCTC	2	10	10323	10332	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_011244	TAATA	2	10	10532	10541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011244	TTCTT	2	10	11381	11390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011244	TTTTA	2	10	11622	11631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011244	TTGCT	2	10	12031	12040	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011244	TTAAA	2	10	12648	12657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011244	ATTAA	2	10	12810	12819	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011244	GATTG	2	10	13180	13189	20 %	40 %	40 %	0 %	203287474
19	NC_011244	CTTTT	2	10	13385	13394	0 %	80 %	0 %	20 %	203287474
20	NC_011244	CATAT	2	10	13754	13763	40 %	40 %	0 %	20 %	203287475
21	NC_011244	TTTAA	2	10	15973	15982	40 %	60 %	0 %	0 %	203287476
22	NC_011244	TTGGA	2	10	16432	16441	20 %	40 %	40 %	0 %	203287477
23	NC_011244	CAAAT	2	10	16689	16698	60 %	20 %	0 %	20 %	203287477
24	NC_011244	TCAAT	2	10	16963	16972	40 %	40 %	0 %	20 %	203287477
25	NC_011244	ATTCC	2	10	18122	18131	20 %	40 %	0 %	40 %	203287478
26	NC_011244	TTCTC	2	10	18253	18262	0 %	60 %	0 %	40 %	203287478
27	NC_011244	AAATT	2	10	18626	18635	60 %	40 %	0 %	0 %	203287478
28	NC_011244	AAAAG	2	10	19307	19316	80 %	0 %	20 %	0 %	203287479
29	NC_011244	AAAGT	2	10	20269	20278	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011244	ATTTA	2	10	21209	21218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011244	ATTAT	2	10	21283	21292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011244	AAATC	2	10	21341	21350	60 %	20 %	0 %	20 %	203287481
33	NC_011244	AAATG	2	10	22865	22874	60 %	20 %	20 %	0 %	203287482
34	NC_011244	TAAAA	2	10	23295	23304	80 %	20 %	0 %	0 %	203287483
35	NC_011244	AAACA	2	10	23729	23738	80 %	0 %	0 %	20 %	203287484
36	NC_011244	AGAAA	2	10	23946	23955	80 %	0 %	20 %	0 %	203287484
37	NC_011244	ATAAA	2	10	24266	24275	80 %	20 %	0 %	0 %	203287484
38	NC_011244	AAGAA	2	10	24637	24646	80 %	0 %	20 %	0 %	203287485
39	NC_011244	AAAAT	2	10	26023	26032	80 %	20 %	0 %	0 %	203287487
40	NC_011244	CTGTT	2	10	26750	26759	0 %	60 %	20 %	20 %	203287487
41	NC_011244	AATTA	2	10	27283	27292	60 %	40 %	0 %	0 %	203287487
42	NC_011244	AGTAA	2	10	28702	28711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011244	ATTTT	2	10	30257	30266	20 %	80 %	0 %	0 %	203287491
44	NC_011244	TAATT	2	10	30502	30511	40 %	60 %	0 %	0 %	203287491
45	NC_011244	TCTAA	2	10	31623	31632	40 %	40 %	0 %	20 %	203287493
46	NC_011244	AAAAT	2	10	33926	33935	80 %	20 %	0 %	0 %	203287494
47	NC_011244	ATAAG	2	10	34063	34072	60 %	20 %	20 %	0 %	203287495
48	NC_011244	TAAAA	2	10	34380	34389	80 %	20 %	0 %	0 %	203287495
49	NC_011244	TAAAA	2	10	35015	35024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011244	TATTT	2	10	35260	35269	20 %	80 %	0 %	0 %	203287496
51	NC_011244	CTTAT	2	10	35648	35657	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011244	TCACT	2	10	36091	36100	20 %	40 %	0 %	40 %	203287497
53	NC_011244	CCCTC	2	10	37342	37351	0 %	20 %	0 %	80 %	203287498
54	NC_011244	ATTTA	2	10	37779	37788	40 %	60 %	0 %	0 %	203287499
55	NC_011244	ATTTA	2	10	39263	39272	40 %	60 %	0 %	0 %	203287501
56	NC_011244	ATTTA	2	10	39759	39768	40 %	60 %	0 %	0 %	203287502
57	NC_011244	AAAAT	2	10	39943	39952	80 %	20 %	0 %	0 %	203287502
58	NC_011244	TTAAA	2	10	40218	40227	60 %	40 %	0 %	0 %	203287503
59	NC_011244	TAAAT	2	10	41552	41561	60 %	40 %	0 %	0 %	203287504
60	NC_011244	AAAAT	2	10	42169	42178	80 %	20 %	0 %	0 %	203287504
61	NC_011244	CAAAA	2	10	42699	42708	80 %	0 %	0 %	20 %	203287504
62	NC_011244	ATTAA	2	10	42977	42986	60 %	40 %	0 %	0 %	203287505
63	NC_011244	AATGC	2	10	43566	43575	40 %	20 %	20 %	20 %	203287506
64	NC_011244	TTCAT	2	10	43944	43953	20 %	60 %	0 %	20 %	203287506
65	NC_011244	TCAAT	2	10	45186	45195	40 %	40 %	0 %	20 %	203287507
66	NC_011244	ATTAA	2	10	45986	45995	60 %	40 %	0 %	0 %	203287507
67	NC_011244	ACCAC	2	10	48312	48321	40 %	0 %	0 %	60 %	203287509
68	NC_011244	TCAAA	2	10	50323	50332	60 %	20 %	0 %	20 %	203287511
69	NC_011244	AAATA	2	10	51292	51301	80 %	20 %	0 %	0 %	203287511
70	NC_011244	TTTAG	2	10	51327	51336	20 %	60 %	20 %	0 %	203287511
71	NC_011244	AAATA	2	10	51606	51615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011244	TCAAT	2	10	52615	52624	40 %	40 %	0 %	20 %	203287512
73	NC_011244	CAATT	2	10	53866	53875	40 %	40 %	0 %	20 %	203287514
74	NC_011244	GAAAA	2	10	54153	54162	80 %	0 %	20 %	0 %	203287514
75	NC_011244	TCAAA	2	10	54614	54623	60 %	20 %	0 %	20 %	203287515
76	NC_011244	ATAAA	2	10	55158	55167	80 %	20 %	0 %	0 %	203287516
77	NC_011244	AATTT	2	10	56330	56339	40 %	60 %	0 %	0 %	203287516
78	NC_011244	CAAAA	2	10	57470	57479	80 %	0 %	0 %	20 %	203287517
79	NC_011244	TGCAA	2	10	57584	57593	40 %	20 %	20 %	20 %	203287517
80	NC_011244	TAATA	2	10	59595	59604	60 %	40 %	0 %	0 %	203287519
81	NC_011244	ATTAA	2	10	61125	61134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011244	TTATG	2	10	61661	61670	20 %	60 %	20 %	0 %	203287522
83	NC_011244	AAATT	2	10	63134	63143	60 %	40 %	0 %	0 %	203287525
84	NC_011244	ATAAA	2	10	68451	68460	80 %	20 %	0 %	0 %	203287529
85	NC_011244	ATATA	2	10	69009	69018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011244	AATAA	2	10	69950	69959	80 %	20 %	0 %	0 %	203287532
87	NC_011244	ACCTT	2	10	70567	70576	20 %	40 %	0 %	40 %	203287532
88	NC_011244	TAAGA	2	10	71875	71884	60 %	20 %	20 %	0 %	203287534
89	NC_011244	TCTTA	2	10	73912	73921	20 %	60 %	0 %	20 %	203287536
90	NC_011244	CATTA	2	10	75823	75832	40 %	40 %	0 %	20 %	203287537
91	NC_011244	AAAAT	2	10	78041	78050	80 %	20 %	0 %	0 %	203287540
92	NC_011244	TAAAA	2	10	78481	78490	80 %	20 %	0 %	0 %	203287540
93	NC_011244	AATAA	2	10	78818	78827	80 %	20 %	0 %	0 %	203287540
94	NC_011244	AATAA	2	10	80761	80770	80 %	20 %	0 %	0 %	203287541
95	NC_011244	AAGTG	2	10	82538	82547	40 %	20 %	40 %	0 %	203287543
96	NC_011244	AAATA	2	10	83371	83380	80 %	20 %	0 %	0 %	203287544
97	NC_011244	ATTAC	2	10	83939	83948	40 %	40 %	0 %	20 %	203287544
98	NC_011244	TCTAT	2	10	84184	84193	20 %	60 %	0 %	20 %	203287544
99	NC_011244	AAAGA	2	10	84548	84557	80 %	0 %	20 %	0 %	203287545
100	NC_011244	TAAAA	2	10	85617	85626	80 %	20 %	0 %	0 %	203287546
101	NC_011244	AAATA	2	10	85664	85673	80 %	20 %	0 %	0 %	203287546
102	NC_011244	AATTC	2	10	86607	86616	40 %	40 %	0 %	20 %	203287547
103	NC_011244	TAAAA	2	10	86926	86935	80 %	20 %	0 %	0 %	203287547
104	NC_011244	ATAAA	2	10	87618	87627	80 %	20 %	0 %	0 %	203287547
105	NC_011244	ATATC	2	10	87807	87816	40 %	40 %	0 %	20 %	203287548
106	NC_011244	ATAAA	2	10	89063	89072	80 %	20 %	0 %	0 %	203287549
107	NC_011244	AAGAA	2	10	89715	89724	80 %	0 %	20 %	0 %	203287550
108	NC_011244	TGACT	2	10	89762	89771	20 %	40 %	20 %	20 %	203287550
109	NC_011244	TAAAG	2	10	90621	90630	60 %	20 %	20 %	0 %	203287550
110	NC_011244	ATAAA	2	10	91296	91305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011244	TAAAA	2	10	91324	91333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011244	ATAAC	2	10	92281	92290	60 %	20 %	0 %	20 %	203287552
113	NC_011244	TTAAT	2	10	92657	92666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011244	TGAAA	2	10	95852	95861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011244	TAAAT	2	10	96392	96401	60 %	40 %	0 %	0 %	203287556
116	NC_011244	AATTT	2	10	97019	97028	40 %	60 %	0 %	0 %	203287556
117	NC_011244	AGATT	2	10	98574	98583	40 %	40 %	20 %	0 %	203287557
118	NC_011244	TCCAT	2	10	99273	99282	20 %	40 %	0 %	40 %	203287559
119	NC_011244	ATTAA	2	10	99691	99700	60 %	40 %	0 %	0 %	203287559
120	NC_011244	AACAT	2	10	99844	99853	60 %	20 %	0 %	20 %	203287559
121	NC_011244	ACCAA	2	10	99936	99945	60 %	0 %	0 %	40 %	203287559
122	NC_011244	CTTTT	2	10	100214	100223	0 %	80 %	0 %	20 %	203287559
123	NC_011244	AACTT	2	10	101657	101666	40 %	40 %	0 %	20 %	203287560
124	NC_011244	GCAAA	2	10	102296	102305	60 %	0 %	20 %	20 %	203287561
125	NC_011244	AATTA	2	10	102663	102672	60 %	40 %	0 %	0 %	203287561
126	NC_011244	AACTT	2	10	102772	102781	40 %	40 %	0 %	20 %	203287561
127	NC_011244	TCTCT	2	10	104793	104802	0 %	60 %	0 %	40 %	203287563
128	NC_011244	ATATA	2	10	105246	105255	60 %	40 %	0 %	0 %	203287563
129	NC_011244	ATACT	2	10	105272	105281	40 %	40 %	0 %	20 %	203287563
130	NC_011244	AAAGC	2	10	107256	107265	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011244	CAAAT	2	10	107415	107424	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011244	TCATT	2	10	108025	108034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011244	AATTA	2	10	108559	108568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011244	TAAAA	2	10	109644	109653	80 %	20 %	0 %	0 %	203287567
135	NC_011244	AACTA	2	10	110083	110092	60 %	20 %	0 %	20 %	203287567
136	NC_011244	TAAAA	2	10	110233	110242	80 %	20 %	0 %	0 %	203287567
137	NC_011244	ATTTA	2	10	112534	112543	40 %	60 %	0 %	0 %	203287570
138	NC_011244	AAAGA	2	10	113825	113834	80 %	0 %	20 %	0 %	203287571
139	NC_011244	ATCAC	2	10	113862	113871	40 %	20 %	0 %	40 %	203287571
140	NC_011244	TTCAT	2	10	115249	115258	20 %	60 %	0 %	20 %	203287572
141	NC_011244	TAAAA	2	10	116242	116251	80 %	20 %	0 %	0 %	203287573
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