MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 3

Total Repeats: 903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011002	TCGTC	2	10	2024	2033	0 %	40 %	20 %	40 %	197294854
2	NC_011002	TCCGC	2	10	6117	6126	0 %	20 %	20 %	60 %	197294857
3	NC_011002	GCTCG	2	10	6857	6866	0 %	20 %	40 %	40 %	197294857
4	NC_011002	GGCGC	2	10	8235	8244	0 %	0 %	60 %	40 %	197294858
5	NC_011002	ATCGC	2	10	8551	8560	20 %	20 %	20 %	40 %	197294859
6	NC_011002	CCGCG	2	10	10616	10625	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011002	GCCGC	2	10	11692	11701	0 %	0 %	40 %	60 %	197294862
8	NC_011002	GCGCC	2	10	15508	15517	0 %	0 %	40 %	60 %	197294866
9	NC_011002	GCCGT	2	10	17737	17746	0 %	20 %	40 %	40 %	197294869
10	NC_011002	CGGCG	2	10	17751	17760	0 %	0 %	60 %	40 %	197294869
11	NC_011002	CGGCC	2	10	20280	20289	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_011002	CGGCG	2	10	20366	20375	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011002	GACGC	2	10	21228	21237	20 %	0 %	40 %	40 %	197294871
14	NC_011002	CGTGA	2	10	21388	21397	20 %	20 %	40 %	20 %	197294871
15	NC_011002	CGCTG	2	10	23755	23764	0 %	20 %	40 %	40 %	197294873
16	NC_011002	GGCTC	2	10	23932	23941	0 %	20 %	40 %	40 %	197294874
17	NC_011002	TCGGC	2	10	24379	24388	0 %	20 %	40 %	40 %	197294874
18	NC_011002	TGCGA	2	10	25161	25170	20 %	20 %	40 %	20 %	197294874
19	NC_011002	TGCCG	2	10	25309	25318	0 %	20 %	40 %	40 %	197294875
20	NC_011002	TCGCG	2	10	25698	25707	0 %	20 %	40 %	40 %	197294875
21	NC_011002	GCGCG	2	10	25889	25898	0 %	0 %	60 %	40 %	197294875
22	NC_011002	CGGCG	2	10	26708	26717	0 %	0 %	60 %	40 %	197294876
23	NC_011002	GCGCG	2	10	27862	27871	0 %	0 %	60 %	40 %	197294877
24	NC_011002	GCCGC	2	10	29716	29725	0 %	0 %	40 %	60 %	197294879
25	NC_011002	CCGAC	2	10	29816	29825	20 %	0 %	20 %	60 %	197294879
26	NC_011002	ACCTG	2	10	30410	30419	20 %	20 %	20 %	40 %	197294879
27	NC_011002	CGGCT	2	10	34833	34842	0 %	20 %	40 %	40 %	197294883
28	NC_011002	TGAAC	2	10	35483	35492	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011002	GAACT	2	10	35960	35969	40 %	20 %	20 %	20 %	197294884
30	NC_011002	GTTCA	2	10	36912	36921	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011002	GCGAT	2	10	38200	38209	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011002	GCCGC	2	10	39127	39136	0 %	0 %	40 %	60 %	197294887
33	NC_011002	GGCGG	2	10	39752	39761	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011002	CGCGC	2	10	40518	40527	0 %	0 %	40 %	60 %	197294888
35	NC_011002	GCCGG	2	10	42055	42064	0 %	0 %	60 %	40 %	197294889
36	NC_011002	GCCGG	2	10	42142	42151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011002	CGGCG	2	10	42867	42876	0 %	0 %	60 %	40 %	197294890
38	NC_011002	GCGCG	2	10	42885	42894	0 %	0 %	60 %	40 %	197294890
39	NC_011002	GTTTC	2	10	43047	43056	0 %	60 %	20 %	20 %	197294890
40	NC_011002	GAGTC	2	10	45518	45527	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011002	CGGCG	2	10	47354	47363	0 %	0 %	60 %	40 %	197294894
42	NC_011002	CGATG	2	10	47423	47432	20 %	20 %	40 %	20 %	197294894
43	NC_011002	CGGCG	2	10	47466	47475	0 %	0 %	60 %	40 %	197294894
44	NC_011002	GGCTG	2	10	47929	47938	0 %	20 %	60 %	20 %	197294894
45	NC_011002	TCGGC	2	10	49726	49735	0 %	20 %	40 %	40 %	197294896
46	NC_011002	GCGCG	2	10	54535	54544	0 %	0 %	60 %	40 %	197294900
47	NC_011002	GCGCT	2	10	55552	55561	0 %	20 %	40 %	40 %	197294901
48	NC_011002	CGGCA	2	10	56134	56143	20 %	0 %	40 %	40 %	197294902
49	NC_011002	GCGAC	2	10	56884	56893	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011002	CCGCC	2	10	57071	57080	0 %	0 %	20 %	80 %	197294903
51	NC_011002	GCGCG	2	10	57512	57521	0 %	0 %	60 %	40 %	197294903
52	NC_011002	GCGGG	2	10	58853	58862	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011002	ACGCG	2	10	59093	59102	20 %	0 %	40 %	40 %	197294904
54	NC_011002	GGCCG	2	10	60129	60138	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011002	TCGCG	2	10	60379	60388	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011002	TCGAG	2	10	64097	64106	20 %	20 %	40 %	20 %	197294909
57	NC_011002	GGGCA	2	10	65526	65535	20 %	0 %	60 %	20 %	197294910
58	NC_011002	ATGCG	2	10	66220	66229	20 %	20 %	40 %	20 %	197294910
59	NC_011002	AGCGC	2	10	68850	68859	20 %	0 %	40 %	40 %	197294912
60	NC_011002	AGCAC	2	10	68869	68878	40 %	0 %	20 %	40 %	197294912
61	NC_011002	GCGCC	2	10	70754	70763	0 %	0 %	40 %	60 %	197294913
62	NC_011002	CCGAG	2	10	70781	70790	20 %	0 %	40 %	40 %	197294913
63	NC_011002	AAGCG	2	10	71759	71768	40 %	0 %	40 %	20 %	197294914
64	NC_011002	GCAGC	2	10	72161	72170	20 %	0 %	40 %	40 %	197294914
65	NC_011002	GCGCT	2	10	72285	72294	0 %	20 %	40 %	40 %	197294914
66	NC_011002	CCGGC	2	10	74956	74965	0 %	0 %	40 %	60 %	197294918
67	NC_011002	CCGAA	2	10	78487	78496	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011002	CAGCG	2	10	79933	79942	20 %	0 %	40 %	40 %	197294922
69	NC_011002	CAGCG	2	10	80102	80111	20 %	0 %	40 %	40 %	197294922
70	NC_011002	CGCTG	2	10	84476	84485	0 %	20 %	40 %	40 %	197294927
71	NC_011002	TGCCG	2	10	84590	84599	0 %	20 %	40 %	40 %	197294927
72	NC_011002	GCTGA	2	10	85555	85564	20 %	20 %	40 %	20 %	197294928
73	NC_011002	GCGCG	2	10	86452	86461	0 %	0 %	60 %	40 %	197294929
74	NC_011002	CGATG	2	10	87248	87257	20 %	20 %	40 %	20 %	197294930
75	NC_011002	GCATG	2	10	88291	88300	20 %	20 %	40 %	20 %	197294931
76	NC_011002	GGCAA	2	10	88496	88505	40 %	0 %	40 %	20 %	197294932
77	NC_011002	CGGGG	2	10	88743	88752	0 %	0 %	80 %	20 %	197294932
78	NC_011002	GCGAT	2	10	89714	89723	20 %	20 %	40 %	20 %	197294932
79	NC_011002	CGCGC	2	10	90416	90425	0 %	0 %	40 %	60 %	197294933
80	NC_011002	CTCGC	2	10	90837	90846	0 %	20 %	20 %	60 %	197294933
81	NC_011002	GCCGG	2	10	92173	92182	0 %	0 %	60 %	40 %	197294934
82	NC_011002	TCGAT	2	10	92250	92259	20 %	40 %	20 %	20 %	197294934
83	NC_011002	CCGCA	2	10	92357	92366	20 %	0 %	20 %	60 %	197294934
84	NC_011002	GAAGC	2	10	93012	93021	40 %	0 %	40 %	20 %	197294935
85	NC_011002	GAAAC	2	10	93711	93720	60 %	0 %	20 %	20 %	197294936
86	NC_011002	ACGCG	2	10	94880	94889	20 %	0 %	40 %	40 %	197294937
87	NC_011002	GCAAC	2	10	95739	95748	40 %	0 %	20 %	40 %	197294938
88	NC_011002	GCGTC	2	10	97225	97234	0 %	20 %	40 %	40 %	197294940
89	NC_011002	CGGCA	2	10	100046	100055	20 %	0 %	40 %	40 %	197294944
90	NC_011002	CGGCG	2	10	100255	100264	0 %	0 %	60 %	40 %	197294944
91	NC_011002	TGCGC	2	10	100681	100690	0 %	20 %	40 %	40 %	197294945
92	NC_011002	CGGTC	2	10	100770	100779	0 %	20 %	40 %	40 %	197294945
93	NC_011002	CCGGG	2	10	101131	101140	0 %	0 %	60 %	40 %	197294945
94	NC_011002	GGGCC	2	10	101371	101380	0 %	0 %	60 %	40 %	197294945
95	NC_011002	CGCGC	2	10	101727	101736	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_011002	CGTCG	2	10	102273	102282	0 %	20 %	40 %	40 %	197294947
97	NC_011002	CGATC	2	10	103995	104004	20 %	20 %	20 %	40 %	197294948
98	NC_011002	CGATG	2	10	104700	104709	20 %	20 %	40 %	20 %	197294948
99	NC_011002	CGGTG	2	10	105410	105419	0 %	20 %	60 %	20 %	197294949
100	NC_011002	GCCGG	2	10	106337	106346	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_011002	GCGCC	2	10	106874	106883	0 %	0 %	40 %	60 %	197294950
102	NC_011002	GTACG	2	10	108116	108125	20 %	20 %	40 %	20 %	197294951
103	NC_011002	TGCGA	2	10	108309	108318	20 %	20 %	40 %	20 %	197294951
104	NC_011002	CGCGA	2	10	109223	109232	20 %	0 %	40 %	40 %	197294952
105	NC_011002	GCACG	2	10	110521	110530	20 %	0 %	40 %	40 %	197294953
106	NC_011002	ACCTG	2	10	110583	110592	20 %	20 %	20 %	40 %	197294953
107	NC_011002	CGCAA	2	10	111538	111547	40 %	0 %	20 %	40 %	197294954
108	NC_011002	ATCGC	2	10	112167	112176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011002	TCGTC	2	10	112369	112378	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011002	TGCGC	2	10	112675	112684	0 %	20 %	40 %	40 %	197294955
111	NC_011002	AGGCC	2	10	117017	117026	20 %	0 %	40 %	40 %	197294958
112	NC_011002	GACCA	2	10	118041	118050	40 %	0 %	20 %	40 %	197294958
113	NC_011002	GGCGC	2	10	119099	119108	0 %	0 %	60 %	40 %	197294959
114	NC_011002	GCTCG	2	10	119708	119717	0 %	20 %	40 %	40 %	197294960
115	NC_011002	CGGCG	2	10	119903	119912	0 %	0 %	60 %	40 %	197294960
116	NC_011002	CGACG	2	10	120677	120686	20 %	0 %	40 %	40 %	197294960
117	NC_011002	GCGCG	2	10	120770	120779	0 %	0 %	60 %	40 %	197294960
118	NC_011002	CCGCG	2	10	120932	120941	0 %	0 %	40 %	60 %	197294961
119	NC_011002	CGACG	2	10	121205	121214	20 %	0 %	40 %	40 %	197294961
120	NC_011002	GTGCA	2	10	122472	122481	20 %	20 %	40 %	20 %	197294962
121	NC_011002	CGGCG	2	10	123328	123337	0 %	0 %	60 %	40 %	197294963
122	NC_011002	GCGTC	2	10	124680	124689	0 %	20 %	40 %	40 %	197294964
123	NC_011002	ACCGC	2	10	125496	125505	20 %	0 %	20 %	60 %	197294965
124	NC_011002	GGCGC	2	10	126369	126378	0 %	0 %	60 %	40 %	197294966
125	NC_011002	GGGCG	2	10	127837	127846	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011002	AGCGC	2	10	129398	129407	20 %	0 %	40 %	40 %	197294969
127	NC_011002	ATCGC	2	10	129430	129439	20 %	20 %	20 %	40 %	197294969
128	NC_011002	CTTTT	3	15	131035	131049	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011002	GCTCG	2	10	132096	132105	0 %	20 %	40 %	40 %	197294971
130	NC_011002	GCGCG	2	10	132436	132445	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011002	CGGAC	2	10	132651	132660	20 %	0 %	40 %	40 %	197294972
132	NC_011002	GCCGC	2	10	132764	132773	0 %	0 %	40 %	60 %	197294972
133	NC_011002	CCCGG	2	10	133231	133240	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_011002	GCGTC	2	10	135620	135629	0 %	20 %	40 %	40 %	197294974
135	NC_011002	CGCGC	2	10	135657	135666	0 %	0 %	40 %	60 %	197294974
136	NC_011002	TGCAA	2	10	138032	138041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011002	GAACG	2	10	138235	138244	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011002	GCGCG	2	10	138319	138328	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011002	CGCTG	2	10	141165	141174	0 %	20 %	40 %	40 %	197294979
140	NC_011002	GCCCG	2	10	141549	141558	0 %	0 %	40 %	60 %	197294980
141	NC_011002	GCGAT	2	10	141798	141807	20 %	20 %	40 %	20 %	197294980
142	NC_011002	GATCG	2	10	141911	141920	20 %	20 %	40 %	20 %	197294980
143	NC_011002	GCGAG	2	10	144366	144375	20 %	0 %	60 %	20 %	197294983
144	NC_011002	AGCGC	2	10	145616	145625	20 %	0 %	40 %	40 %	197294984
145	NC_011002	GCCGT	2	10	145731	145740	0 %	20 %	40 %	40 %	197294984
146	NC_011002	GAATC	2	10	145835	145844	40 %	20 %	20 %	20 %	197294984
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148	NC_011002	CACAC	2	10	146860	146869	40 %	0 %	0 %	60 %	197294985
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150	NC_011002	GCAGC	2	10	149513	149522	20 %	0 %	40 %	40 %	197294987
151	NC_011002	CGCGC	2	10	150093	150102	0 %	0 %	40 %	60 %	197294988
152	NC_011002	TGAAT	2	10	151412	151421	40 %	40 %	20 %	0 %	197294988
153	NC_011002	GCGAT	2	10	151693	151702	20 %	20 %	40 %	20 %	197294989
154	NC_011002	AATCG	2	10	152096	152105	40 %	20 %	20 %	20 %	197294989
155	NC_011002	ACGCC	2	10	154392	154401	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
156	NC_011002	CGGCG	2	10	154461	154470	0 %	0 %	60 %	40 %	197294991
157	NC_011002	TTCGC	2	10	154639	154648	0 %	40 %	20 %	40 %	197294991
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159	NC_011002	GCATT	2	10	157449	157458	20 %	40 %	20 %	20 %	197294993
160	NC_011002	GGGCA	2	10	157864	157873	20 %	0 %	60 %	20 %	197294994
161	NC_011002	GCGTC	2	10	157922	157931	0 %	20 %	40 %	40 %	197294994
162	NC_011002	CGGCG	2	10	158490	158499	0 %	0 %	60 %	40 %	197294994
163	NC_011002	AGCGA	2	10	158682	158691	40 %	0 %	40 %	20 %	197294994
164	NC_011002	GCGCG	2	10	160748	160757	0 %	0 %	60 %	40 %	197294997
165	NC_011002	CACGA	2	10	160815	160824	40 %	0 %	20 %	40 %	197294997
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168	NC_011002	ACCGG	2	10	162972	162981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
169	NC_011002	GCAAC	2	10	164383	164392	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
170	NC_011002	CGCGC	2	10	164638	164647	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
171	NC_011002	GGACC	2	10	165980	165989	20 %	0 %	40 %	40 %	197295000
172	NC_011002	GCTGC	2	10	167455	167464	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
173	NC_011002	CGGCG	2	10	168503	168512	0 %	0 %	60 %	40 %	197295002
174	NC_011002	AGCCG	2	10	170160	170169	20 %	0 %	40 %	40 %	197295004
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176	NC_011002	CGCAG	2	10	172241	172250	20 %	0 %	40 %	40 %	197295005
177	NC_011002	CGCGC	2	10	173042	173051	0 %	0 %	40 %	60 %	197295006
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184	NC_011002	GGTCG	2	10	180617	180626	0 %	20 %	60 %	20 %	197295013
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195	NC_011002	AGCCG	2	10	187856	187865	20 %	0 %	40 %	40 %	197295020
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201	NC_011002	CACTG	2	10	193779	193788	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
202	NC_011002	GAATG	2	10	193889	193898	40 %	20 %	40 %	0 %	197295028
203	NC_011002	GCCGC	2	10	194272	194281	0 %	0 %	40 %	60 %	197295028
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221	NC_011002	CGGCG	2	10	215287	215296	0 %	0 %	60 %	40 %	197295049
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258	NC_011002	AAAAT	2	10	243203	243212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_011002	GCGCG	2	10	256786	256795	0 %	0 %	60 %	40 %	197295084
271	NC_011002	TGAAT	2	10	257221	257230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_011002	GCCGT	2	10	258209	258218	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
273	NC_011002	CCGCG	2	10	258320	258329	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
274	NC_011002	GCGGT	2	10	258910	258919	0 %	20 %	60 %	20 %	197295085
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279	NC_011002	TCGAT	2	10	262177	262186	20 %	40 %	20 %	20 %	197295085
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283	NC_011002	GCGCC	2	10	264631	264640	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
284	NC_011002	GACCA	2	10	264972	264981	40 %	0 %	20 %	40 %	197295089
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288	NC_011002	GCCTG	2	10	266048	266057	0 %	20 %	40 %	40 %	197295089
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343	NC_011002	GCAAT	2	10	325587	325596	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
344	NC_011002	GGCGC	3	15	326346	326360	0 %	0 %	60 %	40 %	197295139
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346	NC_011002	AGCGC	2	10	329488	329497	20 %	0 %	40 %	40 %	197295143
347	NC_011002	GCGTC	2	10	329596	329605	0 %	20 %	40 %	40 %	197295143
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352	NC_011002	CGGCT	2	10	335005	335014	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
353	NC_011002	CGATT	2	10	335295	335304	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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393	NC_011002	CGACG	2	10	376804	376813	20 %	0 %	40 %	40 %	197295173
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396	NC_011002	GGCCG	2	10	378773	378782	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
397	NC_011002	GTTCG	2	10	380970	380979	0 %	40 %	40 %	20 %	197295177
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400	NC_011002	CGGTG	2	10	383951	383960	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
401	NC_011002	ATCGA	2	10	384901	384910	40 %	20 %	20 %	20 %	197295179
402	NC_011002	GACCA	2	10	388636	388645	40 %	0 %	20 %	40 %	197295182
403	NC_011002	GATGC	2	10	389861	389870	20 %	20 %	40 %	20 %	197295183
404	NC_011002	CGGTG	2	10	390035	390044	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
405	NC_011002	CCGAA	2	10	391026	391035	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
406	NC_011002	GCACG	2	10	391568	391577	20 %	0 %	40 %	40 %	197295184
407	NC_011002	CGTCG	2	10	394493	394502	0 %	20 %	40 %	40 %	197295184
408	NC_011002	CGGCA	2	10	395010	395019	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
409	NC_011002	CCGCA	2	10	395869	395878	20 %	0 %	20 %	60 %	197295186
410	NC_011002	GCACC	2	10	396151	396160	20 %	0 %	20 %	60 %	197295187
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429	NC_011002	GTGGA	2	10	411465	411474	20 %	20 %	60 %	0 %	197295201
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434	NC_011002	CGTAC	2	10	414494	414503	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
435	NC_011002	GTCGT	2	10	416457	416466	0 %	40 %	40 %	20 %	197295205
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460	NC_011002	CGCGG	2	10	442242	442251	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
461	NC_011002	CCGCG	2	10	442593	442602	0 %	0 %	40 %	60 %	197295227
462	NC_011002	CCGGC	2	10	442614	442623	0 %	0 %	40 %	60 %	197295227
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500	NC_011002	GCCCC	2	10	478270	478279	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

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