MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 2

Total Repeats: 94624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011001	CGA	2	6	179921	179926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562023
5002	NC_011001	CG	3	6	179930	179935	0 %	0 %	50 %	50 %	206562023
5003	NC_011001	GC	3	6	179959	179964	0 %	0 %	50 %	50 %	206562023
5004	NC_011001	CACG	2	8	180158	180165	25 %	0 %	25 %	50 %	206562023
5005	NC_011001	GCG	2	6	180167	180172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562023
5006	NC_011001	CGC	2	6	180200	180205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562023
5007	NC_011001	GTG	3	9	180255	180263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206562023
5008	NC_011001	ATTC	2	8	180300	180307	25 %	50 %	0 %	25 %	206562023
5009	NC_011001	TCGCCG	2	12	180385	180396	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	206562023
5010	NC_011001	CAT	2	6	180408	180413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206562024
5011	NC_011001	CGC	2	6	180438	180443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562024
5012	NC_011001	GC	3	6	180446	180451	0 %	0 %	50 %	50 %	206562024
5013	NC_011001	CGCC	2	8	180462	180469	0 %	0 %	25 %	75 %	206562024
5014	NC_011001	CGGCG	2	10	180522	180531	0 %	0 %	60 %	40 %	206562024
5015	NC_011001	TCG	2	6	180566	180571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562024
5016	NC_011001	TCGT	2	8	180579	180586	0 %	50 %	25 %	25 %	206562024
5017	NC_011001	GC	3	6	180604	180609	0 %	0 %	50 %	50 %	206562024
5018	NC_011001	GCC	2	6	180616	180621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562024
5019	NC_011001	GCG	2	6	180624	180629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562024
5020	NC_011001	TCG	2	6	180632	180637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562024
5021	NC_011001	GC	3	6	180642	180647	0 %	0 %	50 %	50 %	206562024
5022	NC_011001	TCG	2	6	180680	180685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562024
5023	NC_011001	CAA	2	6	180726	180731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206562024
5024	NC_011001	CCG	2	6	180744	180749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562024
5025	NC_011001	TTC	2	6	180817	180822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206562024
5026	NC_011001	CG	3	6	180837	180842	0 %	0 %	50 %	50 %	206562024
5027	NC_011001	GCG	2	6	180863	180868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562024
5028	NC_011001	CGTCG	2	10	180882	180891	0 %	20 %	40 %	40 %	206562024
5029	NC_011001	GGC	2	6	180907	180912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562024
5030	NC_011001	CGT	2	6	180923	180928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562024
5031	NC_011001	GCG	2	6	180944	180949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562024
5032	NC_011001	GCT	2	6	180966	180971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562024
5033	NC_011001	CGAA	2	8	180974	180981	50 %	0 %	25 %	25 %	206562024
5034	NC_011001	CG	4	8	180987	180994	0 %	0 %	50 %	50 %	206562024
5035	NC_011001	ACA	2	6	181037	181042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206562024
5036	NC_011001	CGA	2	6	181074	181079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562024
5037	NC_011001	CGGC	2	8	181097	181104	0 %	0 %	50 %	50 %	206562024
5038	NC_011001	GCG	2	6	181135	181140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562024
5039	NC_011001	TCGCG	2	10	181148	181157	0 %	20 %	40 %	40 %	206562024
5040	NC_011001	CG	4	8	181154	181161	0 %	0 %	50 %	50 %	206562024
5041	NC_011001	CGG	2	6	181197	181202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562024
5042	NC_011001	CG	3	6	181209	181214	0 %	0 %	50 %	50 %	206562024
5043	NC_011001	CG	3	6	181225	181230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_011001	GGC	2	6	181332	181337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562025
5045	NC_011001	CGG	2	6	181357	181362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562025
5046	NC_011001	CGC	2	6	181391	181396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562025
5047	NC_011001	CGC	2	6	181421	181426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562025
5048	NC_011001	GAC	2	6	181487	181492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562025
5049	NC_011001	GACC	2	8	181550	181557	25 %	0 %	25 %	50 %	206562025
5050	NC_011001	GCA	2	6	181591	181596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562025
5051	NC_011001	CG	3	6	181663	181668	0 %	0 %	50 %	50 %	206562025
5052	NC_011001	CGA	2	6	181691	181696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562025
5053	NC_011001	ATC	2	6	181704	181709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206562025
5054	NC_011001	CGGC	2	8	181760	181767	0 %	0 %	50 %	50 %	206562025
5055	NC_011001	TGC	2	6	181801	181806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562025
5056	NC_011001	CG	3	6	181829	181834	0 %	0 %	50 %	50 %	206562025
5057	NC_011001	CGG	2	6	181888	181893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562025
5058	NC_011001	TGA	2	6	181900	181905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562025
5059	NC_011001	GCA	2	6	181925	181930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562025
5060	NC_011001	GAG	2	6	181950	181955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206562025
5061	NC_011001	CTG	2	6	181968	181973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562025
5062	NC_011001	CGA	2	6	182038	182043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562025
5063	NC_011001	TGCGG	2	10	182044	182053	0 %	20 %	60 %	20 %	206562025
5064	NC_011001	AGG	2	6	182089	182094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206562025
5065	NC_011001	CAT	2	6	182124	182129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206562025
5066	NC_011001	CGA	2	6	182152	182157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562025
5067	NC_011001	AAC	2	6	182205	182210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_011001	GCG	2	6	182301	182306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562026
5069	NC_011001	ACGCG	2	10	182310	182319	20 %	0 %	40 %	40 %	206562026
5070	NC_011001	CG	4	8	182316	182323	0 %	0 %	50 %	50 %	206562026
5071	NC_011001	GAC	2	6	182363	182368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562026
5072	NC_011001	GCC	2	6	182377	182382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562026
5073	NC_011001	GC	3	6	182410	182415	0 %	0 %	50 %	50 %	206562026
5074	NC_011001	ACA	2	6	182514	182519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206562026
5075	NC_011001	CGA	2	6	182545	182550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562026
5076	NC_011001	GC	3	6	182601	182606	0 %	0 %	50 %	50 %	206562026
5077	NC_011001	AGT	2	6	182607	182612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562026
5078	NC_011001	CGG	2	6	182619	182624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_011001	CGC	2	6	182625	182630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562027
5080	NC_011001	CG	3	6	182669	182674	0 %	0 %	50 %	50 %	206562027
5081	NC_011001	GC	3	6	182728	182733	0 %	0 %	50 %	50 %	206562027
5082	NC_011001	TGC	2	6	182736	182741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562027
5083	NC_011001	GAT	2	6	182765	182770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562027
5084	NC_011001	GCC	2	6	182825	182830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562027
5085	NC_011001	CGAT	2	8	182853	182860	25 %	25 %	25 %	25 %	206562027
5086	NC_011001	TCG	2	6	182922	182927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562027
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5089	NC_011001	TTC	2	6	182985	182990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206562027
5090	NC_011001	CAG	2	6	182993	182998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562027
5091	NC_011001	GC	3	6	183043	183048	0 %	0 %	50 %	50 %	206562027
5092	NC_011001	CCT	2	6	183055	183060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206562027
5093	NC_011001	CGA	2	6	183061	183066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562027
5094	NC_011001	CCGC	2	8	183077	183084	0 %	0 %	25 %	75 %	206562027
5095	NC_011001	GCG	2	6	183097	183102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562027
5096	NC_011001	GCG	2	6	183124	183129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562027
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5109	NC_011001	CGCGC	2	10	183704	183713	0 %	0 %	40 %	60 %	206562027
5110	NC_011001	CG	3	6	183719	183724	0 %	0 %	50 %	50 %	206562027
5111	NC_011001	GCA	2	6	183769	183774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562027
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5114	NC_011001	CG	3	6	183805	183810	0 %	0 %	50 %	50 %	206562027
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5122	NC_011001	CGG	2	6	184126	184131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562027
5123	NC_011001	ACG	2	6	184140	184145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562027
5124	NC_011001	CG	3	6	184144	184149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_011001	CGC	2	6	184156	184161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_011001	GC	3	6	184269	184274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_011001	CG	3	6	184306	184311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_011001	CGGC	2	8	184336	184343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_011001	TCGGC	2	10	184353	184362	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5130	NC_011001	GCA	2	6	184387	184392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_011001	GC	3	6	184407	184412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_011001	A	6	6	184443	184448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_011001	GT	3	6	184463	184468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_011001	A	6	6	184480	184485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_011001	TTG	2	6	184550	184555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_011001	CGGC	2	8	184614	184621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5137	NC_011001	GAA	2	6	184663	184668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206562028
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5141	NC_011001	CG	3	6	184757	184762	0 %	0 %	50 %	50 %	206562028
5142	NC_011001	ACT	2	6	184763	184768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206562028
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5146	NC_011001	CGAA	2	8	184841	184848	50 %	0 %	25 %	25 %	206562028
5147	NC_011001	ACG	2	6	184851	184856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562028
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5151	NC_011001	GGC	2	6	184965	184970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5152	NC_011001	CGG	2	6	185106	185111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562029
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5156	NC_011001	CG	4	8	185335	185342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5157	NC_011001	CG	4	8	185374	185381	0 %	0 %	50 %	50 %	206562030
5158	NC_011001	GCTG	2	8	185384	185391	0 %	25 %	50 %	25 %	206562030
5159	NC_011001	CTG	2	6	185417	185422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562030
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5194	NC_011001	TGA	2	6	186523	186528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562031
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5220	NC_011001	GAA	2	6	187520	187525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206562032
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5227	NC_011001	TAG	2	6	187818	187823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562032
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5230	NC_011001	CGT	2	6	187999	188004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5231	NC_011001	GTC	2	6	188037	188042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5234	NC_011001	GTACGT	2	12	188261	188272	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206562033
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5237	NC_011001	CGTG	2	8	188344	188351	0 %	25 %	50 %	25 %	206562033
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5240	NC_011001	GAA	2	6	188408	188413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206562033
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5242	NC_011001	GTA	2	6	188483	188488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562033
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5244	NC_011001	GCA	2	6	188593	188598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562033
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5246	NC_011001	CG	3	6	188784	188789	0 %	0 %	50 %	50 %	206562033
5247	NC_011001	CGTCG	2	10	188840	188849	0 %	20 %	40 %	40 %	206562033
5248	NC_011001	GTA	2	6	188891	188896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562033
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5251	NC_011001	GCCG	2	8	189005	189012	0 %	0 %	50 %	50 %	206562033
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5304	NC_011001	GCATAT	2	12	190541	190552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5367	NC_011001	TCG	2	6	193065	193070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5371	NC_011001	CG	3	6	193203	193208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5373	NC_011001	GCG	2	6	193280	193285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5493	NC_011001	TCG	2	6	197470	197475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562040
5494	NC_011001	GAT	2	6	197477	197482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562040
5495	NC_011001	GCG	2	6	197531	197536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562040
5496	NC_011001	AGC	2	6	197545	197550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562040
5497	NC_011001	GCA	2	6	197585	197590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562040
5498	NC_011001	TGC	2	6	197596	197601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562040
5499	NC_011001	GCG	3	9	197633	197641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562040
5500	NC_011001	AGC	3	9	197677	197685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562040

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