MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 2

Total Repeats: 94624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011001	GGC	2	6	159669	159674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562009
4502	NC_011001	CG	3	6	159702	159707	0 %	0 %	50 %	50 %	206562009
4503	NC_011001	GCG	2	6	159729	159734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562009
4504	NC_011001	TCG	2	6	159736	159741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562009
4505	NC_011001	CG	3	6	159740	159745	0 %	0 %	50 %	50 %	206562009
4506	NC_011001	TTC	2	6	159807	159812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206562009
4507	NC_011001	GC	5	10	159843	159852	0 %	0 %	50 %	50 %	206562009
4508	NC_011001	CGAG	2	8	159868	159875	25 %	0 %	50 %	25 %	206562009
4509	NC_011001	GGCC	2	8	159899	159906	0 %	0 %	50 %	50 %	206562009
4510	NC_011001	CGC	2	6	159954	159959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_011001	GCG	2	6	159960	159965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_011001	CAAT	2	8	159976	159983	50 %	25 %	0 %	25 %	206562010
4513	NC_011001	GGA	2	6	159984	159989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206562010
4514	NC_011001	GAA	2	6	160069	160074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206562010
4515	NC_011001	GCT	2	6	160083	160088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562010
4516	NC_011001	GC	3	6	160100	160105	0 %	0 %	50 %	50 %	206562010
4517	NC_011001	CGA	2	6	160131	160136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562010
4518	NC_011001	TCG	2	6	160160	160165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562010
4519	NC_011001	CGG	2	6	160166	160171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562010
4520	NC_011001	GGA	2	6	160212	160217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206562010
4521	NC_011001	CGC	2	6	160221	160226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562010
4522	NC_011001	AAC	2	6	160276	160281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206562010
4523	NC_011001	CGC	2	6	160326	160331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562010
4524	NC_011001	CTT	2	6	160368	160373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206562010
4525	NC_011001	GTCG	2	8	160377	160384	0 %	25 %	50 %	25 %	206562010
4526	NC_011001	TGA	2	6	160397	160402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562010
4527	NC_011001	CGG	3	9	160410	160418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562010
4528	NC_011001	GGC	2	6	160491	160496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562010
4529	NC_011001	CGT	2	6	160497	160502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562010
4530	NC_011001	GCT	2	6	160560	160565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562010
4531	NC_011001	ACGAAG	2	12	160576	160587	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	206562010
4532	NC_011001	GC	3	6	160595	160600	0 %	0 %	50 %	50 %	206562010
4533	NC_011001	GCC	2	6	160652	160657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562010
4534	NC_011001	CG	3	6	160667	160672	0 %	0 %	50 %	50 %	206562010
4535	NC_011001	TCG	3	9	160736	160744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562010
4536	NC_011001	CGG	2	6	160746	160751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562010
4537	NC_011001	GC	3	6	160765	160770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_011001	TGA	2	6	160803	160808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562011
4539	NC_011001	GC	3	6	160833	160838	0 %	0 %	50 %	50 %	206562011
4540	NC_011001	CG	4	8	160843	160850	0 %	0 %	50 %	50 %	206562011
4541	NC_011001	CGC	2	6	160855	160860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562011
4542	NC_011001	GC	3	6	160866	160871	0 %	0 %	50 %	50 %	206562011
4543	NC_011001	GC	3	6	160927	160932	0 %	0 %	50 %	50 %	206562011
4544	NC_011001	GCG	2	6	160935	160940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562011
4545	NC_011001	CGTCG	2	10	160984	160993	0 %	20 %	40 %	40 %	206562011
4546	NC_011001	CG	3	6	161011	161016	0 %	0 %	50 %	50 %	206562011
4547	NC_011001	GGC	2	6	161022	161027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562011
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4549	NC_011001	CGC	2	6	161058	161063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562011
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4552	NC_011001	CGTCG	2	10	161197	161206	0 %	20 %	40 %	40 %	206562011
4553	NC_011001	CGG	2	6	161218	161223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562011
4554	NC_011001	GCG	2	6	161246	161251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562011
4555	NC_011001	GGT	2	6	161263	161268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206562011
4556	NC_011001	GC	3	6	161300	161305	0 %	0 %	50 %	50 %	206562011
4557	NC_011001	CGGC	2	8	161422	161429	0 %	0 %	50 %	50 %	206562011
4558	NC_011001	CGA	2	6	161431	161436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562011
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4560	NC_011001	CGA	2	6	161445	161450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562011
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4562	NC_011001	CGG	2	6	161509	161514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562011
4563	NC_011001	CGAA	2	8	161533	161540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_011001	GAG	2	6	161558	161563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_011001	ACG	2	6	161664	161669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562012
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4570	NC_011001	GCT	2	6	161890	161895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562012
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4572	NC_011001	GCT	2	6	161932	161937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562012
4573	NC_011001	GCG	2	6	161949	161954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562012
4574	NC_011001	CGTCG	2	10	161989	161998	0 %	20 %	40 %	40 %	206562012
4575	NC_011001	ACG	2	6	162017	162022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562012
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4581	NC_011001	GGT	2	6	162214	162219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206562012
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4589	NC_011001	CG	3	6	162417	162422	0 %	0 %	50 %	50 %	206562012
4590	NC_011001	CGGCA	2	10	162446	162455	20 %	0 %	40 %	40 %	206562012
4591	NC_011001	CG	3	6	162472	162477	0 %	0 %	50 %	50 %	206562012
4592	NC_011001	GC	3	6	162500	162505	0 %	0 %	50 %	50 %	206562012
4593	NC_011001	CTG	2	6	162506	162511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562012
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4596	NC_011001	GAT	2	6	162574	162579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562012
4597	NC_011001	CG	3	6	162620	162625	0 %	0 %	50 %	50 %	206562012
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4601	NC_011001	CG	3	6	162742	162747	0 %	0 %	50 %	50 %	206562012
4602	NC_011001	CGC	4	12	162795	162806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562012
4603	NC_011001	GCG	2	6	162815	162820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_011001	TCG	2	6	162922	162927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562013
4605	NC_011001	ACA	2	6	162943	162948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206562013
4606	NC_011001	CG	4	8	162961	162968	0 %	0 %	50 %	50 %	206562013
4607	NC_011001	GCCG	2	8	162992	162999	0 %	0 %	50 %	50 %	206562013
4608	NC_011001	GCCG	2	8	163058	163065	0 %	0 %	50 %	50 %	206562013
4609	NC_011001	GAT	2	6	163067	163072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562013
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4623	NC_011001	GC	3	6	163653	163658	0 %	0 %	50 %	50 %	206562013
4624	NC_011001	ACT	2	6	163693	163698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206562013
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4747	NC_011001	CGG	2	6	168127	168132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562016
4748	NC_011001	CGCGG	2	10	168169	168178	0 %	0 %	60 %	40 %	206562016
4749	NC_011001	GCCA	2	8	168192	168199	25 %	0 %	25 %	50 %	206562016
4750	NC_011001	CTCGAT	2	12	168203	168214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206562016
4751	NC_011001	TCG	2	6	168284	168289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4752	NC_011001	GGC	2	6	168300	168305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4753	NC_011001	CGG	2	6	168335	168340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4754	NC_011001	ACG	2	6	168378	168383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562017
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4777	NC_011001	CGG	2	6	169188	169193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4851	NC_011001	GGGAG	2	10	173243	173252	20 %	0 %	80 %	0 %	206562019
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4858	NC_011001	AGGC	2	8	173743	173750	25 %	0 %	50 %	25 %	206562019
4859	NC_011001	ATTT	2	8	173775	173782	25 %	75 %	0 %	0 %	206562019
4860	NC_011001	TCA	2	6	173788	173793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206562019
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4864	NC_011001	GCA	2	6	173976	173981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562019
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4866	NC_011001	CAA	2	6	174051	174056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206562019
4867	NC_011001	GCA	2	6	174062	174067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562019
4868	NC_011001	AGC	2	6	174094	174099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562019
4869	NC_011001	CA	3	6	174106	174111	50 %	0 %	0 %	50 %	206562019
4870	NC_011001	CCG	2	6	174126	174131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206562019
4871	NC_011001	GGA	2	6	174189	174194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206562019
4872	NC_011001	TGA	2	6	174226	174231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562019
4873	NC_011001	GAC	2	6	174237	174242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206562019
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4875	NC_011001	TCG	2	6	174427	174432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562019
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4877	NC_011001	TGA	2	6	174529	174534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206562020
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4888	NC_011001	TCAG	2	8	175214	175221	25 %	25 %	25 %	25 %	206562020
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4909	NC_011001	GCA	2	6	176198	176203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4991	NC_011001	CGG	2	6	179537	179542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4992	NC_011001	CGGC	2	8	179620	179627	0 %	0 %	50 %	50 %	206562023
4993	NC_011001	TGG	2	6	179644	179649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206562023
4994	NC_011001	CAT	2	6	179702	179707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206562023
4995	NC_011001	CGG	2	6	179711	179716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562023
4996	NC_011001	GGCC	2	8	179722	179729	0 %	0 %	50 %	50 %	206562023
4997	NC_011001	CTG	2	6	179784	179789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206562023
4998	NC_011001	GCGCG	2	10	179790	179799	0 %	0 %	60 %	40 %	206562023
4999	NC_011001	CGG	2	6	179819	179824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206562023
5000	NC_011001	GGTCGA	2	12	179834	179845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	206562023

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