MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 1

Total Repeats: 112866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011000	GCA	2	6	17052	17057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558420
502	NC_011000	TCG	2	6	17058	17063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558420
503	NC_011000	CG	3	6	17072	17077	0 %	0 %	50 %	50 %	206558420
504	NC_011000	CGC	2	6	17129	17134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_011000	GGC	2	6	17159	17164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011000	AAC	2	6	17170	17175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011000	AAC	2	6	17189	17194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_011000	AATGAA	2	12	17205	17216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	206558421
509	NC_011000	CCG	2	6	17249	17254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558421
510	NC_011000	CCG	2	6	17261	17266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558421
511	NC_011000	GCC	2	6	17269	17274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558421
512	NC_011000	CGG	2	6	17279	17284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
513	NC_011000	TCA	2	6	17303	17308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558421
514	NC_011000	CGG	2	6	17385	17390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
515	NC_011000	GTC	2	6	17416	17421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558421
516	NC_011000	CGC	2	6	17451	17456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558421
517	NC_011000	GC	3	6	17464	17469	0 %	0 %	50 %	50 %	206558421
518	NC_011000	ATGG	2	8	17472	17479	25 %	25 %	50 %	0 %	206558421
519	NC_011000	CGG	2	6	17484	17489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
520	NC_011000	CTG	2	6	17497	17502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558421
521	NC_011000	CGG	2	6	17505	17510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
522	NC_011000	GAA	3	9	17556	17564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558421
523	NC_011000	CGG	2	6	17675	17680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
524	NC_011000	GGC	2	6	17692	17697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
525	NC_011000	TTC	2	6	17707	17712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206558421
526	NC_011000	GAA	2	6	17748	17753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558421
527	NC_011000	CGT	2	6	17763	17768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558421
528	NC_011000	CGG	2	6	17778	17783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
529	NC_011000	TCG	2	6	17830	17835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558421
530	NC_011000	CTG	2	6	17839	17844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558421
531	NC_011000	TCG	2	6	17854	17859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558421
532	NC_011000	GCG	2	6	17891	17896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
533	NC_011000	CGC	2	6	17955	17960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558421
534	NC_011000	GCT	2	6	17961	17966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558421
535	NC_011000	CGA	2	6	17976	17981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558421
536	NC_011000	GCCTCG	2	12	17990	18001	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	206558421
537	NC_011000	GAC	2	6	18003	18008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558421
538	NC_011000	GAA	2	6	18093	18098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558421
539	NC_011000	GGC	2	6	18117	18122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558421
540	NC_011000	ACT	2	6	18125	18130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558421
541	NC_011000	GAC	2	6	18138	18143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558421
542	NC_011000	GCC	2	6	18163	18168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558421
543	NC_011000	GAC	2	6	18171	18176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558421
544	NC_011000	GAA	2	6	18204	18209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558421
545	NC_011000	GCA	2	6	18257	18262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558421
546	NC_011000	GAA	2	6	18291	18296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558421
547	NC_011000	ACT	2	6	18323	18328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558421
548	NC_011000	CGA	2	6	18341	18346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558421
549	NC_011000	GCG	2	6	18416	18421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011000	CG	4	8	18420	18427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_011000	CG	3	6	18431	18436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_011000	CG	3	6	18438	18443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_011000	GCG	3	9	18441	18449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011000	CTG	2	6	18465	18470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011000	CGC	2	6	18471	18476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_011000	CG	4	8	18478	18485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_011000	TGC	2	6	18581	18586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
558	NC_011000	GCT	2	6	18648	18653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
559	NC_011000	GC	3	6	18677	18682	0 %	0 %	50 %	50 %	206558422
560	NC_011000	TGC	2	6	18806	18811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
561	NC_011000	GCTG	2	8	18812	18819	0 %	25 %	50 %	25 %	206558422
562	NC_011000	GCT	3	9	18843	18851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
563	NC_011000	GTC	2	6	18871	18876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
564	NC_011000	TCG	2	6	18904	18909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
565	NC_011000	ACG	2	6	18920	18925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558422
566	NC_011000	GTC	3	9	18991	18999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
567	NC_011000	TCGC	2	8	19003	19010	0 %	25 %	25 %	50 %	206558422
568	NC_011000	GC	3	6	19065	19070	0 %	0 %	50 %	50 %	206558422
569	NC_011000	TCG	2	6	19091	19096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
570	NC_011000	GAT	3	9	19119	19127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558422
571	NC_011000	CGC	2	6	19158	19163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558422
572	NC_011000	CGC	2	6	19202	19207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558422
573	NC_011000	GAT	2	6	19221	19226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558422
574	NC_011000	GGT	2	6	19242	19247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558422
575	NC_011000	CGG	2	6	19254	19259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558422
576	NC_011000	CTG	2	6	19294	19299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
577	NC_011000	CG	3	6	19322	19327	0 %	0 %	50 %	50 %	206558422
578	NC_011000	CGT	2	6	19353	19358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
579	NC_011000	TGC	2	6	19379	19384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558422
580	NC_011000	CGG	2	6	19394	19399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558422
581	NC_011000	ATG	2	6	19419	19424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558422
582	NC_011000	TGC	2	6	19447	19452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
583	NC_011000	CGC	2	6	19454	19459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558423
584	NC_011000	CGC	2	6	19466	19471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558423
585	NC_011000	TGA	2	6	19501	19506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558423
586	NC_011000	CTG	2	6	19545	19550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
587	NC_011000	GCT	2	6	19565	19570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
588	NC_011000	CGGC	2	8	19600	19607	0 %	0 %	50 %	50 %	206558423
589	NC_011000	CGC	2	6	19676	19681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558423
590	NC_011000	GCT	2	6	19685	19690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
591	NC_011000	TCG	3	9	19696	19704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
592	NC_011000	GAT	2	6	19742	19747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558423
593	NC_011000	ATCT	2	8	19779	19786	25 %	50 %	0 %	25 %	206558423
594	NC_011000	CACG	2	8	19799	19806	25 %	0 %	25 %	50 %	206558423
595	NC_011000	CG	3	6	19831	19836	0 %	0 %	50 %	50 %	206558423
596	NC_011000	GCC	2	6	19837	19842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558423
597	NC_011000	GCT	2	6	19850	19855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
598	NC_011000	ACG	2	6	19867	19872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558423
599	NC_011000	TAC	2	6	19881	19886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558423
600	NC_011000	TGG	3	9	19894	19902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558423
601	NC_011000	TCG	2	6	19960	19965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
602	NC_011000	GC	4	8	19983	19990	0 %	0 %	50 %	50 %	206558423
603	NC_011000	ACCG	2	8	20010	20017	25 %	0 %	25 %	50 %	206558423
604	NC_011000	GCT	2	6	20024	20029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
605	NC_011000	GGTGCT	2	12	20078	20089	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	206558423
606	NC_011000	TCG	2	6	20134	20139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
607	NC_011000	TGA	2	6	20143	20148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558423
608	NC_011000	CGG	2	6	20156	20161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558423
609	NC_011000	CGA	2	6	20251	20256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558423
610	NC_011000	CGA	2	6	20293	20298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558423
611	NC_011000	CGTG	2	8	20323	20330	0 %	25 %	50 %	25 %	206558423
612	NC_011000	TCG	2	6	20350	20355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
613	NC_011000	CG	3	6	20366	20371	0 %	0 %	50 %	50 %	206558423
614	NC_011000	GC	3	6	20417	20422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_011000	GCA	2	6	20464	20469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011000	CCGG	2	8	20474	20481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_011000	CGC	2	6	20482	20487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_011000	GCG	2	6	20514	20519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011000	GTG	2	6	20550	20555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011000	GAG	2	6	20621	20626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011000	CG	3	6	20782	20787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_011000	TTCG	2	8	20812	20819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_011000	AGA	2	6	20953	20958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011000	AGC	2	6	20976	20981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011000	GCA	2	6	20982	20987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011000	GGC	2	6	21008	21013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_011000	CCGT	2	8	21019	21026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
628	NC_011000	GCA	2	6	21197	21202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011000	GC	3	6	21217	21222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_011000	ATC	2	6	21225	21230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011000	CG	3	6	21252	21257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_011000	TTC	2	6	21267	21272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011000	TTC	2	6	21276	21281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011000	GAC	2	6	21287	21292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_011000	GCG	2	6	21340	21345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_011000	CG	3	6	21344	21349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_011000	TTA	2	6	21403	21408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011000	GCC	2	6	21430	21435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_011000	T	6	6	21450	21455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_011000	AGC	2	6	21458	21463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_011000	GATG	2	8	21494	21501	25 %	25 %	50 %	0 %	206558424
642	NC_011000	GT	3	6	21526	21531	0 %	50 %	50 %	0 %	206558424
643	NC_011000	GCG	2	6	21532	21537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558424
644	NC_011000	CCGGC	2	10	21584	21593	0 %	0 %	40 %	60 %	206558424
645	NC_011000	GCT	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558424
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647	NC_011000	CG	3	6	21700	21705	0 %	0 %	50 %	50 %	206558424
648	NC_011000	CGA	2	6	21729	21734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558424
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651	NC_011000	CTCG	2	8	21777	21784	0 %	25 %	25 %	50 %	206558424
652	NC_011000	CGA	2	6	21818	21823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558424
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654	NC_011000	GC	3	6	21839	21844	0 %	0 %	50 %	50 %	206558424
655	NC_011000	ATC	2	6	21847	21852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558424
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664	NC_011000	GAA	2	6	22326	22331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558424
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672	NC_011000	GC	3	6	22705	22710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
673	NC_011000	GCC	2	6	22728	22733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
674	NC_011000	ACC	2	6	22738	22743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
675	NC_011000	CGC	2	6	22750	22755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
676	NC_011000	GC	3	6	22759	22764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
677	NC_011000	TCGCG	2	10	22775	22784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
678	NC_011000	CG	4	8	22781	22788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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886	NC_011000	CGA	2	6	29823	29828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558430
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