MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 52906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010816	GAAGAC	2	12	111740	111751	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189438952
2502	NC_010816	GTT	2	6	111754	111759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438952
2503	NC_010816	TGTGG	2	10	111763	111772	0 %	40 %	60 %	0 %	189438952
2504	NC_010816	ATC	2	6	111827	111832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438952
2505	NC_010816	CAG	2	6	111833	111838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438952
2506	NC_010816	CTG	2	6	111971	111976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438952
2507	NC_010816	GC	3	6	112104	112109	0 %	0 %	50 %	50 %	189438952
2508	NC_010816	TGG	2	6	112134	112139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438952
2509	NC_010816	CG	3	6	112145	112150	0 %	0 %	50 %	50 %	189438952
2510	NC_010816	GGC	2	6	112169	112174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438952
2511	NC_010816	GGCC	2	8	112241	112248	0 %	0 %	50 %	50 %	189438952
2512	NC_010816	CTG	2	6	112301	112306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438952
2513	NC_010816	CAG	2	6	112338	112343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438952
2514	NC_010816	AGGCG	2	10	112432	112441	20 %	0 %	60 %	20 %	189438952
2515	NC_010816	CGG	2	6	112519	112524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438952
2516	NC_010816	GCCAT	2	10	112531	112540	20 %	20 %	20 %	40 %	189438952
2517	NC_010816	ATC	2	6	112553	112558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438952
2518	NC_010816	GCC	2	6	112562	112567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438952
2519	NC_010816	ACA	2	6	112593	112598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438952
2520	NC_010816	TCT	2	6	112611	112616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438952
2521	NC_010816	GGT	2	6	112691	112696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_010816	GAAT	2	8	112716	112723	50 %	25 %	25 %	0 %	189438953
2523	NC_010816	AATGG	2	10	112771	112780	40 %	20 %	40 %	0 %	189438953
2524	NC_010816	CGTGC	2	10	112810	112819	0 %	20 %	40 %	40 %	189438953
2525	NC_010816	GTC	2	6	112867	112872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438953
2526	NC_010816	GCA	2	6	112874	112879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438953
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2528	NC_010816	CAGC	2	8	112911	112918	25 %	0 %	25 %	50 %	189438953
2529	NC_010816	CCCT	2	8	113020	113027	0 %	25 %	0 %	75 %	189438953
2530	NC_010816	ACC	2	6	113045	113050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438953
2531	NC_010816	CGC	2	6	113071	113076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438953
2532	NC_010816	CGG	2	6	113217	113222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438953
2533	NC_010816	CAG	2	6	113242	113247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438953
2534	NC_010816	AAT	2	6	113379	113384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_010816	GAA	2	6	113543	113548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_010816	AGGA	2	8	113560	113567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_010816	GC	3	6	113568	113573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_010816	TCGT	2	8	113592	113599	0 %	50 %	25 %	25 %	189438954
2539	NC_010816	TTC	2	6	113616	113621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438954
2540	NC_010816	TGA	2	6	113635	113640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438954
2541	NC_010816	TTGC	2	8	113667	113674	0 %	50 %	25 %	25 %	189438954
2542	NC_010816	GTCTG	2	10	113686	113695	0 %	40 %	40 %	20 %	189438954
2543	NC_010816	CG	3	6	113711	113716	0 %	0 %	50 %	50 %	189438954
2544	NC_010816	GTA	2	6	113823	113828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438954
2545	NC_010816	CCG	2	6	113833	113838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438954
2546	NC_010816	GCG	2	6	113899	113904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438954
2547	NC_010816	GACT	2	8	113953	113960	25 %	25 %	25 %	25 %	189438954
2548	NC_010816	CGT	2	6	114059	114064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438954
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2550	NC_010816	CTG	2	6	114174	114179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438954
2551	NC_010816	GCG	2	6	114227	114232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438954
2552	NC_010816	TGG	2	6	114341	114346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438955
2553	NC_010816	TGA	2	6	114353	114358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438955
2554	NC_010816	GAA	2	6	114363	114368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438955
2555	NC_010816	CTA	2	6	114447	114452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438955
2556	NC_010816	TGC	2	6	114662	114667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438955
2557	NC_010816	CAT	2	6	114707	114712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438955
2558	NC_010816	TGC	2	6	114719	114724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438955
2559	NC_010816	TCA	2	6	114740	114745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438955
2560	NC_010816	CAG	2	6	114754	114759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438955
2561	NC_010816	CCG	2	6	114864	114869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438955
2562	NC_010816	GGT	2	6	114881	114886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438955
2563	NC_010816	ATC	2	6	114930	114935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438956
2564	NC_010816	GTG	2	6	115013	115018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438956
2565	NC_010816	GCT	2	6	115048	115053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438956
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2570	NC_010816	GTG	2	6	115481	115486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438956
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2572	NC_010816	CAT	2	6	115564	115569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438956
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2574	NC_010816	TCG	2	6	115590	115595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438956
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2579	NC_010816	AAC	2	6	115724	115729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_010816	GGC	2	6	115809	115814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438957
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2583	NC_010816	CGA	2	6	115914	115919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438957
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2588	NC_010816	TCACCG	2	12	116135	116146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189438957
2589	NC_010816	GTCA	2	8	116236	116243	25 %	25 %	25 %	25 %	189438957
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2592	NC_010816	GAA	2	6	116301	116306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438957
2593	NC_010816	GCT	2	6	116361	116366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438957
2594	NC_010816	GTG	2	6	116375	116380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438957
2595	NC_010816	ACA	2	6	116396	116401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438957
2596	NC_010816	CAA	2	6	116427	116432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438957
2597	NC_010816	CACC	2	8	116451	116458	25 %	0 %	0 %	75 %	189438957
2598	NC_010816	GAC	3	9	116464	116472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438957
2599	NC_010816	CGCC	2	8	116480	116487	0 %	0 %	25 %	75 %	189438957
2600	NC_010816	CTG	2	6	116509	116514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438957
2601	NC_010816	ACG	2	6	116525	116530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438957
2602	NC_010816	CTT	2	6	116556	116561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438957
2603	NC_010816	GCG	2	6	116695	116700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_010816	GT	3	6	116703	116708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_010816	GTC	2	6	116716	116721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_010816	CG	3	6	116833	116838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_010816	G	9	9	116874	116882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_010816	ATA	2	6	116935	116940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_010816	CCG	2	6	116960	116965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_010816	GC	3	6	117026	117031	0 %	0 %	50 %	50 %	189438958
2611	NC_010816	CAG	2	6	117062	117067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438958
2612	NC_010816	GCG	2	6	117119	117124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438958
2613	NC_010816	TTC	2	6	117215	117220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438958
2614	NC_010816	ATC	2	6	117233	117238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438958
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2618	NC_010816	GCTT	2	8	117457	117464	0 %	50 %	25 %	25 %	189438958
2619	NC_010816	TGG	2	6	117534	117539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438958
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2622	NC_010816	CAG	2	6	117668	117673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438958
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2624	NC_010816	CTG	2	6	117701	117706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438958
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2746	NC_010816	GAATC	2	10	123007	123016	40 %	20 %	20 %	20 %	189438967
2747	NC_010816	GCC	2	6	123064	123069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438967
2748	NC_010816	ATG	2	6	123090	123095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438967
2749	NC_010816	CAC	2	6	123113	123118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438967
2750	NC_010816	GAT	2	6	123153	123158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438967
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2752	NC_010816	CGGC	2	8	123347	123354	0 %	0 %	50 %	50 %	189438967
2753	NC_010816	CGAAT	2	10	123399	123408	40 %	20 %	20 %	20 %	189438967
2754	NC_010816	TCC	2	6	123442	123447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2755	NC_010816	GTT	2	6	123510	123515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2758	NC_010816	GAT	2	6	123728	123733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438968
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2786	NC_010816	GAC	2	6	125270	125275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2852	NC_010816	GC	3	6	128656	128661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2862	NC_010816	GGCT	2	8	129146	129153	0 %	25 %	50 %	25 %	189438973
2863	NC_010816	CGA	2	6	129160	129165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438973
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2867	NC_010816	CTG	2	6	129320	129325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438973
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2870	NC_010816	GGC	2	6	129535	129540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438973
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2872	NC_010816	GCC	2	6	129629	129634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438973
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2987	NC_010816	CGG	2	6	135896	135901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438978
2988	NC_010816	CAA	2	6	136025	136030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438978
2989	NC_010816	CGGG	2	8	136045	136052	0 %	0 %	75 %	25 %	189438978
2990	NC_010816	CTG	2	6	136056	136061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438978
2991	NC_010816	GC	3	6	136066	136071	0 %	0 %	50 %	50 %	189438978
2992	NC_010816	CGG	2	6	136181	136186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438978
2993	NC_010816	CAT	2	6	136245	136250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438978
2994	NC_010816	CTC	2	6	136286	136291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438978
2995	NC_010816	TGA	2	6	136297	136302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438978
2996	NC_010816	GCC	2	6	136346	136351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438978
2997	NC_010816	TCCAT	2	10	136390	136399	20 %	40 %	0 %	40 %	189438978
2998	NC_010816	CGC	2	6	136438	136443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438978
2999	NC_010816	GCC	2	6	136503	136508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438978
3000	NC_010816	GCC	2	6	136599	136604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438978

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